G377527


Basic Information

Item Value
gene id G377527
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 21589495 ~ 21591705 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU429120
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429122
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429124
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccttcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429125
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429126
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429127
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccttcctcatggttacagacccagcAACattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429128
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcctctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccttcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt
>TU429129
agacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatataccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatactcaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtctcccctcctcatggttacagaccaaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccagcAACATTATAtaatatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatatagtatcccctcctcatggttacagacccaacaacattatataatatcccctcctcatggttacatacccaacaacattatatagtatcccctcctcttGAAGAAAAGCACATGAgctaatttatgcagcagcatacaatatatttttttcgTTGTTGTGcagtgctcacttgaacaggcaCGACAGTCCgtcttgtgggcaaattttgtcatcaaaggtgcttt

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106603955

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU429120 False 1672 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705
TU429122 False 1344 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705
TU429124 False 1675 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705
TU429125 False 1388 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705
TU429126 False 1183 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705
TU429127 False 1596 lncRNA 0.40 2 21589495 21591705
TU429128 False 1760 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705
TU429129 True 1063 lncRNA 0.40 3 21589495 21591705

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523408 LOC106565015 coding upstream 55334 21527555 ~ 21534161 (+)
LOC110523409 LOC106565015 coding upstream 67667 21518557 ~ 21521828 (+)
LOC110523407 LOC106568363 coding upstream 96060 21478685 ~ 21493435 (+)
LOC110523406 crybb1 coding upstream 112324 21473853 ~ 21477171 (+)
npm2b LOC106592477 coding upstream 300964 21277568 ~ 21288531 (+)
LOC110523412 LOC106568387 coding downstream 10328 21602033 ~ 21609081 (+)
LOC110523413 LOC106568345 coding downstream 24495 21616200 ~ 21622938 (+)
LOC110523414 cetn3 coding downstream 41827 21633532 ~ 21635979 (+)
LOC110523415 LOC106568324 coding downstream 77716 21669421 ~ 21684268 (+)
LOC110522823 NA coding downstream 97463 21689168 ~ 21695622 (+)
G377523 NA non-coding upstream 11911 21577204 ~ 21577584 (+)
G377520 NA non-coding upstream 17223 21571209 ~ 21572272 (+)
G377517 NA non-coding upstream 20281 21568954 ~ 21569214 (+)
G377513 NA non-coding upstream 23889 21565274 ~ 21565606 (+)
G377505 NA non-coding upstream 38934 21550337 ~ 21550561 (+)
G377533 NA non-coding downstream 20414 21612119 ~ 21612381 (+)
G377535 NA non-coding downstream 23373 21615078 ~ 21615793 (+)
LOC110523419 LOC106568313 non-coding downstream 174042 21765705 ~ 21769900 (+)
G377619 NA non-coding downstream 188683 21780388 ~ 21780616 (+)
G377628 NA non-coding downstream 198876 21790581 ~ 21790798 (+)
LOC110523400 LOC106568542 other upstream 430576 21108129 ~ 21160149 (+)
LOC110522817 LOC106568462 other upstream 752936 20831111 ~ 20842676 (+)
LOC110522816 LOC106568602 other upstream 830994 20508074 ~ 20759255 (+)
G377022 NA other upstream 992632 20591480 ~ 20596863 (+)
G376320 NA other upstream 1605647 19983261 ~ 19983848 (+)
G378660 NA other downstream 580830 22172535 ~ 22231920 (+)
G378832 NA other downstream 912047 22503752 ~ 22506270 (+)
G378868 NA other downstream 1010405 22602110 ~ 22629669 (+)
lhfpl2a lhfpl2 other downstream 1350587 22942205 ~ 23007315 (+)
LOC110522832 LOC106567816 other downstream 2032259 23623921 ~ 23678038 (+)

Expression


Co-expression Network