XLOC_023369 (mtrr)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_023369
gene name mtrr
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 16851213 ~ 16905018 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00046205
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>TCONS_00046210
caaaaaaaaaatctagaagtTGATCTTCAACTTTTAAAGCTGAGTGAAGTAGACTCGCCAAAAGGAAAAACTGTTACATCTGACAGCATTGCTACAGAGATCGGCTCTACTTCATCGGTTGCATCTTTGAAGGAATCTGTCCCACCATTGTCAGAGTCTGTGCTTAATGTTCCTGCTCTTCCTCCTTCATATCTGGAGATCCTGTTGGTGGGGACAGAAAATGTAGAGGAGACAGTCCTGCCTGATAAAGACGGTTATTTTGAAGTGCCAATTTCGAAGGCAGTTCAATTAACTCAAGATGATGCAGTGAAAACTGCCATCTTGCTGGAGCTTGATATTTCGAGACAGTGAGGTTGAAGAGCTGCTGCTCAAACTGGATCTGCAAATGCAAAAGAACTGCACCGTTCAAGTTAATCTGCTTAAAAACACCAGCAAGAAAGcaGCAAAAGTTCCACTTCACATCCCACAGAATGGCTCTTTGCAGTTTATTCTCACCTGGTGTTTAGAGATAAGGAGCACTCCGAAAAAAGCATTTTTG
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Function

symbol description
mtrr Predicted to enable FMN binding activity; [methionine synthase] reductase activity; and flavin adenine dinucleotide binding activity. Predicted to be involved in homocysteine metabolic process and methionine biosynthetic process. Predicted to be active in cytosol. Used to study visceral heterotaxy. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including endocrine gland cancer (multiple); heart disease (multiple); hematologic cancer (multiple); homocystinuria; and homocystinuria-megaloblastic anemia cblE type. Orthologous to human MTRR (5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase).

GO:

id name namespace
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GO:0009086 methionine biosynthetic process biological_process
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GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen molecular_function
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GO:0016491 oxidoreductase activity molecular_function
GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding molecular_function
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KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-101115-3 Predicted to enable FMN binding activity; [methionine synthase] reductase activity; and flavin adenine dinucleotide binding activity. Predicted to be involved in homocysteine metabolic process and methionine biosynthetic process. Predicted to be active in cytosol. Used to study visceral heterotaxy. Human ortholog(s) of this gene implicated in several diseases, including endocrine gland cancer (multiple); heart disease (multiple); hematologic cancer (multiple); homocystinuria; and homocystinuria-megaloblastic anemia cblE type. Orthologous to human MTRR (5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000045398

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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Expression


Co-expression Network