G409218


Basic Information

Item Value
gene id G409218
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 48641214 ~ 48645375 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU464225
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>TU464221
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>TU464219
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Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU464225 False 4133 lncRNA 0.42 2 48641214 48645375
TU464221 False 4088 lncRNA 0.42 2 48641259 48645375
TU464219 True 3794 lncRNA 0.42 2 48641553 48645375

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pdxp plpp coding downstream 60551 48574750 ~ 48580663 (-)
pdcl pdcl coding downstream 96782 48540082 ~ 48544432 (-)
LOC110523983 LOC106560666 coding downstream 193326 48423554 ~ 48489102 (-)
nup54 nup54 coding downstream 515536 48106327 ~ 48125678 (-)
LOC110523978 LOC106605670 coding downstream 611538 48027781 ~ 48029676 (-)
mier3a LOC105008092 coding upstream 1531 48646906 ~ 48693022 (-)
LOC110523989 LOC106560554 coding upstream 84608 48729983 ~ 48847550 (-)
notch1 notch1 coding upstream 236018 48881393 ~ 48954869 (-)
col27a1a LOC106560409 coding upstream 443160 49088535 ~ 49370988 (-)
LOC110523994 rax coding upstream 1012611 49657986 ~ 49663582 (-)
G409219 NA non-coding downstream 34591 48605653 ~ 48606623 (-)
G408916 NA non-coding downstream 53432 48587459 ~ 48587782 (-)
G408914 NA non-coding downstream 54480 48586522 ~ 48586734 (-)
G408912 NA non-coding downstream 55542 48585427 ~ 48585672 (-)
G408895 NA non-coding downstream 88015 48552887 ~ 48553199 (-)
G409305 NA non-coding upstream 140161 48785536 ~ 48792880 (-)
G409306 NA non-coding upstream 140694 48786069 ~ 48793643 (-)
G409308 NA non-coding upstream 143557 48788932 ~ 48796706 (-)
G409418 NA non-coding upstream 341427 48986802 ~ 48987055 (-)
G409424 NA non-coding upstream 346177 48991552 ~ 48991777 (-)
G408782 sec16a other downstream 283649 48353302 ~ 48357565 (-)
G408664 NA other downstream 417994 48221952 ~ 48223220 (-)
LOC110523962 LOC106561388 other downstream 2031099 46572673 ~ 46610314 (-)
G406588 NA other downstream 2406677 46219667 ~ 46234537 (-)
LOC110523950 LOC106561514 other downstream 2617374 46019698 ~ 46023840 (-)
G410168 NA other upstream 888541 49533916 ~ 49576456 (-)
G411459 NA other upstream 1973516 50618891 ~ 50619175 (-)
G411929 NA other upstream 2076939 50722314 ~ 50723061 (-)
G411930 NA other upstream 2077784 50723159 ~ 50724077 (-)
LOC110524003 LOC106613485 other upstream 2534383 51179758 ~ 51228505 (-)

Expression


Co-expression Network