G424649


Basic Information

Item Value
gene id G424649
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 61888198 ~ 61927422 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU481093
cagactgttctctctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctcagactgttctctcccgctcagttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctcttgctcagactgttctctctatcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctcagactgttctctctctctgactctcgctcagactgttctctctctctctcagactctctcgctcagactgttctctctctctctcacgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcactgttctctcgctcagactgctctctttctctctcgcccagactgctctctttctctctcgctcagactgttctctctctctcgctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagac
>TU481094
tctctctctcgctcagactgttctctctctgactgttctctctctctgactgttctctctctctgactgttctctctctgactgttctctctctcgctctgactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctcgctcagactgttctctctcgctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcactgttctctctctctcgctcactattctctccctctctctctcgctcactgttctctctctctctctctcgcccagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcactgttctctctctctcgctcactattctctccctctcgttcactattctctccctctctcactcgctcactgttctctctctcacccagactgttctctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcccgctcactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctcactctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcactgttctctcgctcagactgctctctttctctctcgcccagactgctctctttctctctctcgctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctctctctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcactgttctctcgctcagactgctctctttctctctcgcccagactgctctctttctctctcgctcagactgttctctctctctcgctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagac
>TU481095
tctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgctctctctttctctctcgctcagacttctctctctctctcgctcagactgttctctcgctctctcgctcagactgttctctctctctccctctctctcgctcagactgttctctctctgactgttctctcccgctcagttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctcttgctcagactgttctctctatcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctcagactgttctctctctctgactctcgctcagactgttctctctctctctcagactctctcgctcagactgttctctctctctctcacgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcactgttctctcgctcagactgctctctttctctctcgcccagactgctctctttctctctcgctcagactgttctctctctctcgctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagac
>TU481096
ctcgctcagactgttctctctctcgctcagactgttctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcatgactgttctctctctctcgctcagactgttctctccctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgcgctcactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctcactcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctcgctctcgctcagactgttctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctctctctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcactgttctctcgctcagactgctctctttctctctcgcccagactgctctctttctctctcgctcagactgttctctctctctcgctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagac
>TU481097
cagactgttctctctctcgctcagaatgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctcgctctctcgctcagactgttctctctctctccctctctctcgctcagactgttctctctctgactgttctctcccgctcagttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctcttgctcagactgttctctctatcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctcagactgttctctctctctgactctcgctcagactgttctctctctctctcagactctctcgctcagactgttctctctctctctcacgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcactgttctctcgctcagactgctctctttctctctcgcccagactgctctctttctctctcgctcagactgttctctctctctcgctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctctctcttgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagacagctctctttctctctcgcccagactgctctctctctctcgctcagactgttctctctctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctcgctcagactgttctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagactgttctctctctctctcgctcagac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU481093 False 999 lncRNA 0.52 3 61888198 61914957
TU481094 False 2193 lncRNA 0.52 3 61888198 61899139
TU481095 False 1104 lncRNA 0.52 3 61888198 61918206
TU481096 False 1351 TUCP 0.53 3 61888198 61927422
TU481097 True 1110 TUCP 0.52 3 61888198 61913769

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tssk6 LOC106613736 coding downstream 45471 61841561 ~ 61842727 (-)
LOC110524252 LOC106613733 coding downstream 101656 61763118 ~ 61786542 (-)
LOC110524249 LOC106613730 coding downstream 209092 61660149 ~ 61679106 (-)
LOC110524247 LOC106613727 coding downstream 265843 61617987 ~ 61622355 (-)
LOC110522983 LOC106613725 coding downstream 377120 61304113 ~ 61511078 (-)
si:ch211-212d10.2 LOC106613739 coding upstream 115883 62033465 ~ 62037994 (-)
LOC110524260 LOC105011525 coding upstream 158363 62076569 ~ 62083302 (-)
cirbpb LOC106613741 coding upstream 166247 62084453 ~ 62092024 (-)
midn LOC106613743 coding upstream 299292 62217498 ~ 62251746 (-)
atp5f1d LOC106613744 coding upstream 359083 62277289 ~ 62281739 (-)
G424620 NA non-coding downstream 9683 61853800 ~ 61878515 (-)
G424586 NA non-coding downstream 43938 61837749 ~ 61844260 (-)
G424535 NA non-coding downstream 176277 61711440 ~ 61711921 (-)
G424515 NA non-coding downstream 203559 61684411 ~ 61684639 (-)
G424514 NA non-coding downstream 204040 61683903 ~ 61684158 (-)
G424664 NA non-coding upstream 20347 61938553 ~ 61944254 (-)
G424666 NA non-coding upstream 49541 61967747 ~ 61973241 (-)
G424719 NA non-coding upstream 128630 62046836 ~ 62047291 (-)
G424721 NA non-coding upstream 134705 62052911 ~ 62054066 (-)
G424502 NA other downstream 228613 61659033 ~ 61659585 (-)
G424499 LOC106613729 other downstream 236423 61649967 ~ 61651775 (-)
G424474 NA other downstream 270954 61616870 ~ 61617244 (-)
LOC110524239 LOC106573579 other downstream 817055 61058949 ~ 61081864 (-)
G422347 NA other downstream 1787142 60100765 ~ 60101056 (-)
G424678 NA other upstream 80320 61998526 ~ 62001309 (-)
LOC110524277 LOC106613757 other upstream 885732 62803832 ~ 62808176 (-)
G425612 NA other upstream 931798 62850004 ~ 62850247 (-)
G425647 NA other upstream 976453 62894659 ~ 62900503 (-)
LOC110524282 LOC106584262 other upstream 1341442 63257597 ~ 63260481 (-)

Expression


Co-expression Network