G424830


Basic Information

Item Value
gene id G424830
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 62290337 ~ 62431657 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU481292
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>TU481287
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AAAAATGACAGTATAAATATTTAACCAGGCAAAAGGGCAGATGGGTCTTTAAAATGAATTACCCAGCTCTGTGCAAATATTAACATTAAGGAGAATTACAATGGGTAGCGATACCATGCTGGAGTCAATGCAACTTTAATGTCCCGGCTCCTTAGGGGCCCCCTTCTCGTTAAGTGAAGCAGTTTCACTAGGCTGCTTTATGGAGACTTGatacttattatcctaccctacacacacacacacaacattattatcctaccctacacacacacttattatcctaccacacacacacacacacacaccttattatcctacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaacgtattatcctacacacacacacaacgtattatcctacacacacacacacaaacacaacttattatcctacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaaacaacttattatcctacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacaacttattatcctgcacacacacacacacaacttattatcctatcctacacacacaagttattatcctacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacaacttattatcacacacacacacaacttattatcacacacacacacaacttattatcacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacacaacttattatcctacacacacacacacaacttattatcctgctcacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaacttattatcacacacacacacacacacacacacacaca

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU481294 False 1927 lncRNA 0.40 8 62355287 62431657
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TU481291 False 1908 lncRNA 0.40 2 62414831 62422251
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TU481289 True 2967 lncRNA 0.40 4 62427796 62431657

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110524260 LOC105011525 coding downstream 207035 62076569 ~ 62083302 (-)
si:ch211-212d10.2 LOC106613739 coding downstream 252343 62033465 ~ 62037994 (-)
LOC110524270 LOC106613752 coding upstream 154581 62586238 ~ 62680215 (-)
LOC118964634 NA coding upstream 364960 62796617 ~ 62797240 (-)
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LOC110524279 LOC106613762 coding upstream 487921 62919578 ~ 63214903 (-)
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G425647 NA other upstream 463002 62894659 ~ 62900503 (-)
G425810 LOC106613766 other upstream 869267 63300924 ~ 63303394 (-)

Expression


Co-expression Network