G436017


Basic Information

Item Value
gene id G436017
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 72212395 ~ 72216387 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU493651
tgaccagcaacagcaacagagcttggagaagcctaattaccgtgactaagcggtcatgtggaatttgactccCTTCATGACATACGGtcaccgccacagccctaggcaCAGTTGAGCATATGTTTTAGAATTTGCTTTATTATTTTACTGGACGTATGGTACCTGCGTCTGATGGTCATGGTGCTTTcacgacaactgggaactcggaaaaatcgaggtcaaatcatgacgtcagtgaatTTCAGGTCGGAATGTCGGAGCACTGAAAGATGCCGGAGTTACAGAGTTGGATTACCGTTCAAAACGATTTTCCCCAGTTGGATCTCctttttttcagagttccaacttcagtgtgttcaagacaactgggaagtctGAGATTTCAGTTCTTTTGAAAAACGGTATTAGTctcaagggagggagagagcagcagagggtctgcctctcacggtccctgctctctcctttcctcaggtgagactgaccagagagaggggacataaTCTTTCAActgatggcgaaactcaagtTGCACCGCATCTGCCTCAGGCACAAATTCTTGTTGTTCCTATGACCAAAGAAAGTTAAATACTCCTCGATATTAAAATATAGCCATCGAGCTGCTAATAATAATCAAACGCAGGGCTATCGATAcacttggctactcattcatATGCAGCTGCAGCGTgagtagaagaggagagaagagcgtTTAATGTTTTGTAATAGTTTTTAattaaaacagtgttgacagttcTGAATAAAACagcactcataaaaacagcagttcTTTGCTGTCttctttgacagtctctctggacatggttttaaaagttatgaAATCTAGGGCCTCTCGAGtaacgcagcggtctaaggcaccgcatcgcagtgctagaggcgtcactacagatccgggttcgatcacaaccggctgtggttgggagtcacatagggcggcgcacaattggcccagcttcgtcctggttaggggagggtatgACTGGGAGgcgctttacttggctcatcgcgctctaaggactccttgtggcaggccgggtgcctgcaggctgacctcagtcatcaggtgaacggtgtttcctccgacacattggtgcggctggctttcgggttaagcgggcgggtgttaagaagcgtggtttggcgggtcatgtttcggaggacgcatgactcgaccttcgcctcccgagcccgttggggagttgcagcgatgagacaagatcgaaattggggagaagaaagggggtaaaatacacacaaaaaaaaggtaTGAAATCTCAAATAGGCTAGTATCAAACTTTGCTGTGGTGGGTGTGGGTCGTGAAAGCTGTAGGTAGGCACAGTGAtttgagctatctgattggccagcacAGTAGGCACGCTCTATTTAACCACATATCTCCCGGTCCACCAGGTAGGCAGAGTTTGTATTTTCAGACAAACAAGACAAGGCTTCTGTATGAAGTGCATCTACCACCAACAGCGCAACACAGGGGAAAAAAGGAGTGCAAGTGATTTGCCTTTatcgttggcttttctacagaaatgttgGTGATCGtctaggaatgccttgaagatcgacCAACGATCGACCGATTGGTGACCTTTGCCAGTAAGGTTACATTTCATATCATATACTGTAGTCAgacgtattattattattataatagtcAACTTATTATTATAGTCAACCTAttataattatttattattatagtCGGATGTAGTATTATTATAGTCGgatgtagtagtattattatagtcggatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtCAGATGTGGTAGtattgttatagtcagatgtaaTAGtattgttatagtcagatgtagtagtattgttatagtcagatgtagtagtattgTTATAGTCAGATGTAGCAGTATTATTATAGTCAGATGTAGCAGTATTATTATAGTCAgatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtCAGATGTATTATTGTTAGTCAGACTTTTAGTCAATCTGTCTGCGGTTGTCTATCAACAGCTTAGAAACATGTTATACATGACTTGTAGCACACCAAAATATTTGAAGATAAAGAAAGTAACCCCCACTACCACCCCCTCGTCCCTTCTCACACGTTTAAAATGCTTTCAAGCCAGAACTGAAAATGAAGTGATGGATGTATCTCAATACTCTACAGTGGCCTCCTTTACTTGTCTCCTGCTTTCCTTTTCTACACCCAGCTTGATCCGACACTAGTAGGATAGGTTCTAGCCAGTGAGAGGAAGCCACTGTGAAGTATTGaactaggcttgggcggtatccagattgtcCTACCTTCATACAAACCTTAAGCCATACCAGGATATTCGATAATACTGCCACCCAAGGAGCGCTATTTTCAAACCCAACTCTGCCTCTGTAATccgaaggttagcaatgctaacaagtacatgtaaaaaCCCATATAGAATGCTAACTAAATACTAAAGTTATACAAATAACTAAAAAATGCTAGTCACAGTTTGTTGCACGCACAAAACAAATCTTAGCAAGGATCTTGATCCAGGAAGGGATTTTCTGCTGTTACCAAGCAAAGCTTTATTTTGGAAGAAGTTAACCACTTAGCTCactaactagctactaaattagcaaaccaaaGCATTTGCCACATTTTAGACCgttaacttaatagttataagatatctcgctggcaaacatttagttgtaTATGACATGCTGTAACTAGATCACCTGGCTTGTGCTGAacaacagtgagtgactcacaaggctctGTTCTCTCGTCATTGTGTCACCATGTGGTTAGGGACGACCGAAAAGCTTCATAATGAAATATATTATGTGACGGGTGAAATGAAGATCACATTTGTCTTTATCTCttaacgtattgcacaagttgacttgagggatttacttaaaaagtagctacagatattcacatttatttaaaaaataaaataaaaaaacgtaaTAGAAAtagtattgaaaaaccatcccgtggctatttccaaatgACACATTATACGGTATACCAGGCCTAACTGGGACACAGTGTGTCCTACTGACCTAGTACGGCACACTAGGTCATAAATGCCGAatacacattttggttgaatgcattgagttgtgcaactgactaggtatcccctttccctgtGGTACTGCTTGGCCACTTGATCTAATTTCCCATTGGTAATGCTAGGTTAGTTGTCTATCTCTAGATGGTTGAATTCTATTGTGTACGATGTATTTTTTCTGTGATATTGAGTTCTGCTGGAAGGTCATCATGAAGCTTATGAATGTCTGCTGCTATTCCCATTAACCCTGAGGAGCTAAGGGACAGACACTGTTCATTCCACTGCATCTGCTGGAGGTCATAAGCTGTCTagtaccactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgagagattTTGCTGACCCATACATTCTGAGGGGGTTGGGACTGGGTGGCATAATTTGTTTTAATTTGAATGGTATTAGTTTGTATTGTTATGTGTCTGGAAGAGTGCTGGTTAATGAGTTACAATGACTCTATGGGctgtgaaacacacacagactggggTGTAACACTGCCTAGTGTGATGACACCACAGCGTCTTGCATATCTGTACAAAACAATAACCCCTACATCTTCATTCCTTTTGTTTTTTAATGTAATTTATTTGAGGTGTAAATATTGATCTGTAATGATGTACTATACTCTGGCATTGACAAACTGAACTACTGTAATGTTTCTCTGAGCTAATAAAATTATTTGAAAGGA
>TU493652
tgaccagcaacagcaacagagcttggagaagcctaattaccgtgactaagcggtcatgtggaatttgactccCTTCATGACATACGGtcaccgccacagccctaggcaCAGTTGAGCATATGTTTTAGAATTTGCTTTATTATTTTACTGGACGTATGGTACCTGCGTCTGATGGTCATGGTGCTTTcacgacaactgggaactcggaaaaatcgaggtcaaatcatgacgtcagtgaatTTCAGGTCGGAATGTCGGAGCACTGAAAGATGCCGGAGTTACAGAGTTGGATTACCGTTCAAAACGATTTTCCCCAGTTGGATCTCctttttttcagagttccaacttcagtgtgttcaagacaactgggaagtctGAGATTTCAGTTCTTTTGAAAAACGGTATTAGTctcaagggagggagagagcagcagagggtctgcctctcacggtccctgctctctcctttcctcaggtgagactgaccagagagaggggacataaTCTTTCAActgatggcgaaactcaagtTGCACCGCATCTGCCTCAGGCACAAATTCTTGTTGTTCCTATGACCAAAGAAAGTTAAATACTCCTCGATATTAAAATATAGCCATCGAGCTGCTAATAATAATCAAACGCAGGGCTATCGATAcacttggctactcattcatATGCAGCTGCAGCGTgagtagaagaggagagaagagcgtTTAATGTTTTGTAATAGTTTTTAattaaaacagtgttgacagttcTGAATAAAACagcactcataaaaacagcagttcTTTGCTGTCttctttgacagtctctctggacatggttttaaaagttatgaAATCTAGGGCCTCTCGAGtaacgcagcggtctaaggcaccgcatcgcagtgctagaggcgtcactacagatccgggttcgatcacaaccggctgtggttgggagtcacatagggcggcgcacaattggcccagcttcgtcctggttaggggagggtatgACTGGGAGgcgctttacttggctcatcgcgctctaaggactccttgtggcaggccgggtgcctgcaggctgacctcagtcatcaggtgaacggtgtttcctccgacacattggtgcggctggctttcgggttaagcgggcgggtgttaagaagcgtggtttggcgggtcatgtttcggaggacgcatgactcgaccttcgcctcccgagcccgttggggagttgcagcgatgagacaagatcgaaattggggagaagaaagggggtaaaatacacacaaaaaaaaggtaTGAAATCTCAAATAGGCTAGTATCAAACTTTGCTGTGGTGGGTGTGGGTCGTGAAAGCTGTAGGTAGGCACAGTGAtttgagctatctgattggccagcacAGTAGGCACGCTCTATTTAACCACATATCTCCCGGTCCACCAGGTAGGCAGAGTTTGTATTTTCAGACAAACAAGACAAGGCTTCTGTATGAAGTGCATCTACCACCAACAGCGCAACACAGGGGAAAAAAGGAGTGCAAGTGATTTGCCTTTatcgttggcttttctacagaaatgttgGTGATCGtctaggaatgccttgaagatcgacCAACGATCGACCGATTGGTGACCTTTGCCAGTAAGGTTACATTTCATATCATATACTGTAGTCAgacgtattattattattataatagtcAACTTATTATTATAGTCAACCTAttataattattTATTATTATAGTCGgatgtagtagtattattatagtcggatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtCAGATGTGGTAGtattgttatagtcagatgtaaTAGtattgttatagtcagatgtagtagtattgttatagtcagatgtagtagtattgttatagtcagatgtagtAGTATTATTATAGTCAGATGTAGCAGTATTATTATAGTCAGATGTAGCAGTATTATTATAGTCAgatgtagtagtattattatagtcagatgtagtagtattattatagtCAGATGTATTATTGTTAGTCAGACTTTTAGTCAATCTGTCTGCGGTTGTCTATCAACAGCTTAGAAACATGTTATACATGACTTGTAGCACACCAAAATATTTGAAGATAAAGAAAGTAACCCCCACTACCACCCCCTCGTCCCTTCTCACACGTTTAAAATGCTTTCAAGCCAGAACTGAAAATGAAGTGATGGATGTATCTCAATACTCTACAGTGGCCTCCTTTACTTGTCTCCTGCTTTCCTTTTCTACACCCAGCTTGATCCGACACTAGTAGGATAGGTTCTAGCCAGTGAGAGGAAGCCACTGTGAAGTATTGaactaggcttgggcggtatccagattgtcCTACCTTCATACAAACCTTAAGCCATACCAGGATATTCGATAATACTGCCACCCAAGGAGCGCTATTTTCAAACCCAACTCTGCCTCTGTAATccgaaggttagcaatgctaacaagtacatgtaaaaaCCCATATAGAATGCTAACTAAATACTAAAGTTATACAAATAACTAAAAAATGCTAGTCACAGTTTGTTGCACGCACAAAACAAATCTTAGCAAGGATCTTGATCCAGGAAGGGATTTTCTGCTGTTACCAAGCAAAGCTTTATTTTGGAAGAAGTTAACCACTTAGCTCactaactagctactaaattagcaaaccaaaGCATTTGCCACATTTTAGACCgttaacttaatagttataagatatctcgctggcaaacatttagttgtaTATGACATGCTGTAACTAGATCACCTGGCTTGTGCTGAacaacagtgagtgactcacaaggctctGTTCTCTCGTCATTGTGTCACCATGTGGTTAGGGACGACCGAAAAGCTTCATAATGAAATATATTATGTGACGGGTGAAATGAAGATCACATTTGTCTTTATCTCttaacgtattgcacaagttgacttgagggatttacttaaaaagtagctacagatattcacatttatttaaaaaataaaataaaaaaacgtaaTAGAAAtagtattgaaaaaccatcccgtggctatttccaaatgACACATTATACGGTATACCAGGCCTAACTGGGACACAGTGTGTCCTACTGACCTAGTACGGCACACTAGGTCATAAATGCCGAatacacattttggttgaatgcattgagttgtgcaactgactaggtatcccctttccctgtGGTACTGCTTGGCCACTTGATCTAATTTCCCATTGGTAATGCTAGGTTAGTTGTCTATCTCTAGATGGTTGAATTCTATTGTGTACGATGTATTTTTTCTGTGATATTGAGTTCTGCTGGAAGGTCATCATGAAGCTTATGAATGTCTGCTGCTATTCCCATTAACCCTGAGGAGCTAAGGGACAGACACTGTTCATTCCACTGCATCTGCTGGAGGTCATAAGCTGTCTagtaccactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgagagattTTGCTGACCCATACATTCTGAGGGGGTTGGGACTGGGTGGCATAATTTGTTTTAATTTGAATGGTATTAGTTTGTATTGTTATGTGTCTGGAAGAGTGCTGGTTAATGAGTTACAATGACTCTATGGGctgtgaaacacacacagactggggTGTAACACTGCCTAGTGTGATGACACCACAGCGTCTTGCATATCTGTACAAAACAATAACCCCTACATCTTCATTCCTTTTGTTTTTTAATGTAATTTATTTGAGGTGTAAATATTGATCTGTAATGATGTACTATACTCTGGCATTGACAAACTGAACTACTGTAATGTTTCTCTGAGCTAATAAAATTATTTGAAAGGA

Function

NR:

description
PREDICTED: UDP-N-acetylglucosamine transporter-like isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU493651 False 3899 lncRNA 0.41 3 72212395 72216387
TU493652 True 3902 lncRNA 0.41 4 72212395 72216387

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110524504 vamp4 coding upstream 2734 72175117 ~ 72209661 (+)
LOC110524503 LOC106613969 coding upstream 44953 72136286 ~ 72167442 (+)
LOC110524502 LOC106613967 coding upstream 78121 72098758 ~ 72134274 (+)
LOC110524501 LOC106613965 coding upstream 115269 72068869 ~ 72097126 (+)
LOC100136696 LOC100136696 coding upstream 159131 72041148 ~ 72053264 (+)
myoc LOC106613972 coding downstream 3510 72219897 ~ 72228181 (+)
mettl13 LOC106613973 coding downstream 18826 72235213 ~ 72239514 (+)
LOC110524507 LOC106613976 coding downstream 23531 72239918 ~ 72269866 (+)
LOC110524510 LOC106613977 coding downstream 146465 72362852 ~ 72377582 (+)
LOC110524509 LOC106613979 coding downstream 161395 72377782 ~ 72393450 (+)
G436018 NA non-coding upstream 718 72209845 ~ 72211677 (+)
G436015 NA non-coding upstream 40986 72171171 ~ 72171409 (+)
G435801 NA non-coding upstream 206805 72002883 ~ 72005590 (+)
G435716 NA non-coding upstream 363392 71848450 ~ 71849003 (+)
G435626 NA non-coding upstream 485401 71726686 ~ 71726994 (+)
G436049 NA non-coding downstream 40542 72256929 ~ 72260707 (+)
G436059 NA non-coding downstream 63807 72280194 ~ 72284469 (+)
G436051 LOC106613974 non-coding downstream 68256 72284643 ~ 72285257 (+)
G436069 NA non-coding downstream 79859 72296246 ~ 72298469 (+)
G436131 NA non-coding downstream 153211 72369598 ~ 72369995 (+)
ralgps2 LOC106613957 other upstream 525226 71552653 ~ 71687963 (+)
G434829 NA other upstream 913495 71298615 ~ 71298900 (+)
G434792 LOC106613943 other upstream 988817 71218789 ~ 71223578 (+)
G434653 NA other upstream 1252463 70959610 ~ 70959932 (+)
LOC110524423 LOC106613476 other upstream 3998291 68212224 ~ 68214236 (+)
G436403 NA other downstream 287073 72503460 ~ 72504435 (+)
G436588 NA other downstream 779112 72995499 ~ 72995735 (+)
G437327 NA other downstream 1239914 73456301 ~ 73495084 (+)
LOC110524560 LOC106560270 other downstream 2546817 74729349 ~ 74770168 (+)
G438719 NA other downstream 2555622 74772009 ~ 74776469 (+)

Expression


Co-expression Network