G438307


Basic Information

Item Value
gene id G438307
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 74209798 ~ 74217446 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU496277
cctctctactttctatactctactctctcctctcgactttctacactctactctctcctctctactttctacactctactttctcctctctactctctcctctctactttctcctctctactttctcctctctactctctcctctctactctctcctctactttctacactctactttctcctttctactttctcctctctaatttctcctctaccttctcctctctactctctcctctctacactctactttcccctctctactttctactcctctctactttctactttctcctctctactttctcctctctactttctcctctctactttctcctctctcctctacactctactttctcctttctactcctctctactttctcctctctcctttctcctttctcctctctcctttctcctttctcctcactctactttctacactctactttctacactctactttctcctttctactttctcctttctactttctcctctctactttcttcactctactttctcctctctactctctcctctttactttctcctctctactttctcctctctattttctcctttctctactttctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttctcctctctattttctcctctctacactctactttctcctctctcctctctactttctcctctctacactctactttctcctctctacactctactttctcctctctcctctctacactctactttctcctctctactctctactcctttctactcctctactttctacactctactctctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttctacactctactctctactctactttctacactctactttctcctttctactttctcctctctactttctactctctcctctctacactctactttctcctctctgctTTCTACTCCTCTACTttctactctctcctttctcctctctactttctcctttctcctcactctactttctcctctctactttctctctcctctactttctcatTTCTGCTTTCTCctgtctactctctcctctctactttctctcctctctactttctactctctactttctcctctctacttcctactcctctctactttctactctctcctttctcctctctactttctcctttctcctctctactttctcctttctcctctactttctcctttctctctcctctactttctcctttctgCTTTCTCctgtctactctctcctctctactttctctcctctctactttctactctctactttctactctctcctctctttctcctctctactttctcctctctactttctcatctctactttctcctctctactttctactcctttctcctctcta
>TU496278
ttctcctctctactttctcctttctcctctactttctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttctcctctctactttctcctctctcctctctactttctcctctctactttctcctctctcctctctacactctactttctcctctctactcctttctactcctctctactttctacactctactctctcctctctactctctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttctacactctactttctcctctctactttctacactctactttctcctctctcctctctacactctactttctcctctctcctctctacactctactttctcctctctactctctactcctttctactcctctctactttctacactctactctctcctctctactctctcctctctactttctacactctactctctcctctactttctacactctactttctcctttctactttctcctctctactttctactcctctctactttctactttctcctctctactttctcctttctcctcactctactttctcctctctactttctcctctctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttatacactactttctcctctctactttctcctctctcctctctactctctcctatctactttctacactctactctctcctctctactttatacactctactttctcctctctaatttctcctctaccttctcctctctactctctcctctctacactctactttctcctctctactttctactcctctctactttctactctctcctttctcctctctactttctcctctctactctctcctctctactctctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttctacactctactctctcctctctactttctacactctactctctcc

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU496277 False 1426 lncRNA 0.42 4 74209798 74216683
TU496278 True 970 lncRNA 0.43 2 74212390 74217446

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523002 LOC106560265 coding downstream 134207 74062228 ~ 74075591 (-)
sgcb LOC106560263 coding downstream 193760 74009042 ~ 74016038 (-)
LOC110524549 LOC106560259 coding downstream 201229 73993983 ~ 74008569 (-)
ociad2 ocad2 coding downstream 237668 73969591 ~ 73972130 (-)
fryl NA coding downstream 255921 73850914 ~ 73953877 (-)
LOC110524556 LOC106560268 coding upstream 188400 74405846 ~ 74501105 (-)
LOC118964644 kdr coding upstream 589760 74807206 ~ 74820307 (-)
LOC100135915 LOC106560272 coding upstream 631384 74848830 ~ 74891311 (-)
LOC110522887 LOC106560273 coding upstream 684111 74901557 ~ 74911349 (-)
LOC110523004 NA coding upstream 743931 74961377 ~ 74968484 (-)
G437992 NA non-coding downstream 99561 74110008 ~ 74110237 (-)
G437991 NA non-coding downstream 100131 74109443 ~ 74109667 (-)
G437954 NA non-coding downstream 139919 74069535 ~ 74069879 (-)
G437953 NA non-coding downstream 141371 74067952 ~ 74068427 (-)
G437952 NA non-coding downstream 142301 74067126 ~ 74067497 (-)
G438409 NA non-coding upstream 223404 74440850 ~ 74445900 (-)
G438410 NA non-coding upstream 228657 74446103 ~ 74450669 (-)
G438424 NA non-coding upstream 251659 74469105 ~ 74469898 (-)
G438447 NA non-coding upstream 298515 74515961 ~ 74516300 (-)
G438452 NA non-coding upstream 303380 74520826 ~ 74521029 (-)
LOC110524526 LOC106584218 other downstream 799459 73370439 ~ 73421683 (-)
G437079 NA other downstream 1062670 73146358 ~ 73147128 (-)
G437074 NA other downstream 1084760 73122112 ~ 73125038 (-)
G437054 NA other downstream 1114462 73094794 ~ 73095336 (-)
G436873 NA other downstream 1433930 72774561 ~ 72775868 (-)
G439002 NA other upstream 647813 74865259 ~ 74927797 (-)
G439594 NA other upstream 1046027 75263473 ~ 75265403 (-)
G439788 LOC106560295 other upstream 1353803 75571249 ~ 75575569 (-)
G441168 glrx2 other upstream 2369012 76586458 ~ 76590370 (-)

Expression


Co-expression Network