G447418


Basic Information

Item Value
gene id G447418
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 82771819 ~ 82775310 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU506344
caatgttttttttaatgggtTACATTTCGCTACACCAGTAATGACATCTACTtaatatgtatgtgaccaataaaatttgatttgaaaagactCAAACATATCTGCCAATATCTGATACAATAACCAGGGTTATAGTGACACCTGCTGGTTACCACAGACCTACAATTATGTAACTGAACATGACAACCCTGAGAAGCTGTTACCATCAATGGAGACAAATCAGTGATCCACTCCTTTAATTAATTGAGAAAAGTCTGCaagtcactctcacacacacacacacacacacgattataTGAGCAGCCAGCCATGATTTTCAGGTTCTCAAACAAAAGAAAGCAGTACAAATCCCTTAATTAACAAAACATTAAAATATTCACAGAAATATACAACCAAAAACACCACGGTAGACAGATTTCACAAATCAGAAACACACATCTAAAATTCATAATTGAGATGAAAATAACATTAAATATATTGGAATTTCAAAATACTATTTGGGTATCCAAAtgttgaaaatgtaaaaaaaaaaagtggcctTGCTAAATGTAGCATCAGCTTTCCTCTATGCTGCTAAGTTAGCTTGATAGGTGGTTTCTACTTGGTAGACGGACCATTCTCATCTTCAACTACTTAGTCACAGACATATACAAACAAGTCTTTATAAAAACAACAcattattattctaaaatgtgtgtGCTGTGTTGGTCTAAGCAGTAGTAGGACAACTAAGTTCGTATATCCCCTAATGTACCACGTAAACCATTTCAGCGTCAcaagatacaggtaactgcccaAATAATGgcaacacttgagtaaatgaggcaTACACAgtagtatattgaaagcaggtgcttccacacaagtGTGGTTCCAGAGTTAAgcatttaacatcccatcatgaCTTGGGTCATGTATAAAATGCTAGGCTGGCccttattttggctaccatgtctTTGCCCcaataggatgacaatgcccccatgcacaagtcatcactgaatggtttgatgaacatgaaaatgatgtaatccatttgccatggccatctcagtcaccagatgtCAACTAAATTGAACACATGGGATATTCTAGAGCAgagcctgagacagtgttttacACCACCATCTACAAAATACCAAATGGAATATTTGGAGGAAGATTAGTGCTGcattcctccaatagagttccagacacttgtaaaatctatgccaaggtgcattgaagctgatCTGGCGTCTCGTGGTAGCCCAACAGCCTATTAAGACAGTTAATGTTGGTGTTGCCTTtatttttggcagttacctgtatgtagaGCAATTGCAGAACACCATTAGGGGCATtttccaatatatatatatttcttgatAGAAAAAGTTACACCCATTGATCCATGGTCATTTCTGTggcctaacccttttcctaacctcaGTCTCCAAACATGGCTCACTAATCcacctaacctgctatgtaaacaAATAATGTGTCGAGAAACCATCAGTCTCATAACACCGGAACTGACCAATGGCAGGTATCAATGTGCATTTCCTGATAGCAGGGAACACCCATATTAAGAAACATCCCAAATTGTGGTCTGCAATTACACCATATTCGTTTTTCTGCACCTATGAAGTCACAGTGCATAAGAATGTGGTACAAAACATGAGTAGAAAAACTAATACACACActgagtaaaaaaaacaaacattaggaacaccttcaaaatattgagttgcacccccttttgccctcagaatagcctcaattcgctggagcatggactctacaaggtgttgaaagtgtggCTGGAGGCTGGCCTGGTGACtccgatgcttcccacagttgtgtcaagttggctggtggaccattcttgatacacacgggaaactgttgagcgtgaaaaacccagcagctatagtggttcttgacacactcaaaccggtgcgcctggtacctactaccataccccattcaaaggcacttaaaatcttttgttttgcccgttcaccctctgaaatGGCACACAAGCACAAtccatgtgaattgtcaaggcttaaaagtcctttaaccagtctcctcagctcatctacactgattgaagtggatttaacaggtgatcacagctgtcacctggattcacctggtcagtctcatggaaaaagcaggggtttctaatgttttgtccactcagtgtagaaCCATTGATGTACTTTGAAGGTAGTCATTTGTACTCGACTATCAAACAGAAACAAAAGACTTTACGTCAACAACTCTAGAAAACTGGTAGGAGAATGGAATGCAGTGCTATGGCTACAGCTATACATTCTCTGCTGCACAATGCTCTAACTTGAGGAAGTGGAGGGCTCAACCCAGGTCCTGAATGGATGTCCTTGTTTTTACTGTTGAGAGTTGAGTGACCTTGTTAGAACTGGAGTGGGAAAGCAGGACTCTGGGATacagtaaaacatgtttttaacattaagaccagtggtgtagtggagggtaaatgcaAAAAATGTAAAAGTTGTTTGTGCACCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGCAGaaaaaaatgcattgaaagtataCGAAGCATTATTATTCCCCACGAAAGGCGATCAGTGTTTATACTATATTTTCACTGATTAAGACATGTGGTCTTTGGATCAGCGGCTGTAGTTTGACATGAAGTCTTCTTCCATCTCTATAATAGTAAGCGACAACAACACTGAGCCCCAACATTTAGCCCATTTTGGGACAGGATTTCCATGTCTTAACTCCCTCAGCGACAGATTCATGCAGTCACCTGCTTTCTAAAACTGTTGTTTCTCTGCAGTTGAAACTGCTGTAATCTGGACCAAGCATCCTTTCCTACGAACCTCCTCTTCCGCTCCTTGCCCTGCTGCAATAACACATTTAATATCCAGTCATTTACAAAACATCCTTGTATTGTAACATGTCCACCTGTCATTCCCTGAGTGGTTTGTCTATCTATGGcgctgtctgaaatggcaccctattctctagtgcactactattggcTGGTAGTGCACTGTATGGAATAGACTAACATGTCTGCTGTGCCCTCAGTACATGGACTCACAGTCCCGAAGGTTTCCAAACGGAAGACTGAAGGTGCTGCCCAGTCTCTTGGTGGCTCTGCCTCCTCCCCCAGTCTTCTTCCTGTTCCAGTTGAGTAAGGGGGCGGTGCGCTGCCCCTTAGCCCTGCCCATGGTCCGTTGCAGAGCGTTCGCTTCGTCTCCACTGGGGGAGAGCATCACTTGCCTCCTAtccac
>TU506345
caatgttttttttaatgggtTACATTTCGCTACACCAGTAATGACATCTACTtaatatgtatgtgaccaataaaatttgatttgaaaagactCAAACATATCTGCCAATATCTGATACAATAACCAGGGTTATAGTGACACCTGCTGGTTACCACAGACCTACAATTATGTAACTGAACATGACAACCCTGAGAAGCTGTTACCATCAATGGAGACAAATCAGTGATCCACTCCTTTAATTAATTGAGAAAAGTCTGCaagtcactctcacacacacacacacacacgattataTGAGCAGCCAGCCATGATTTTCAGGTTCTCAAACAAAAGAAAGCAGTACAAATCCCTTAATTAACAAAACATTAAAATATTCACAGAAATATACAACCAAAAACACCACGGTAGACAGATTTCACAAATCAGAAACACACATCTAAAATTCATAATTGAGATGAAAATAACATTAAATATATTGGAATTTCAAAATACTATTTGGGTATCCAAAtgttgaaaatgtaaaaaaaaaaagtggcctTGCTAAATGTAGCATCAGCTTTCCTCTATGCTGCTAAGTTAGCTTGATAGGTGGTTTCTACTTGGTAGACGGACCATTCTCATCTTCAACTACTTAGTCACAGACATATACAAACAAGTCTTTATAAAAACAACAcattattattctaaaatgtgtgtGCTGTGTTGGTCTAAGCAGTAGTAGGACAACTAAGTTCGTATATCCCCTAATGTACCACGTAAACCATTTCAGCGTCAcaagatacaggtaactgcccaAATAATGgcaacacttgagtaaatgaggcaTACACAgtagtatattgaaagcaggtgcttccacacaagtGTGGTTCCAGAGTTAAgcatttaacatcccatcatgaCTTGGGTCATGTATAAAATGCTAGGCTGGCccttattttggctaccatgtctTTGCCCcaataggatgacaatgcccccatgcacaagtcatcactgaatggtttgatgaacatgaaaatgatgtaatccatttgccatggccatctcagtcaccagatgtCAACTAAATTGAACACATGGGATATTCTAGAGCAgagcctgagacagtgttttacACCACCATCTACAAAATACCAAATGGAATATTTGGAGGAAGATTAGTGCTGcattcctccaatagagttccagacacttgtaaaatctatgccaaggtgcattgaagctgatCTGGCGTCTCGTGGTAGCCCAACAGCCTATTAAGACAGTTAATGTTGGTGTTGCCTTtatttttggcagttacctgtatgtagaGCAATTGCAGAACACCATTAGGGGCATtttccaatatatatatatttcttgatAGAAAAAGTTACACCCATTGATCCATGGTCATTTCTGTggcctaacccttttcctaacctcaGTCTCCAAACATGGCTCACTAATCcacctaacctgctatgtaaacaAATAATGTGTCGAGAAACCATCAGTCTCATAACACCGGAACTGACCAATGGCAGGTATCAATGTGCATTTCCTGATAGCAGGGAACACCCATATTAAGAAACATCCCAAATTGTGGTCTGCAATTACACCATATTCGTTTTTCTGCACCTATGAAGTCACAGTGCATAAGAATGTGGTACAAAACATGAGTAGAAAAACTAATACACACActgagtaaaaaaaacaaacattaggaacaccttcaaaatattgagttgcacccccttttgccctcagaatagcctcaattcgctggagcatggactctacaaggtgttgaaagtgtggCTGGAGGCTGGCCTGGTGACtccgatgcttcccacagttgtgtcaagttggctggtggaccattcttgatacacacgggaaactgttgagcgtgaaaaacccagcagctatagtggttcttgacacactcaaaccggtgcgcctggtacctactaccataccccattcaaaggcacttaaaatcttttgttttgcccgttcaccctctgaaatGGCACACAAGCACAAtccatgtgaattgtcaaggcttaaaagtcctttaaccagtctcctcagctcatctacactgattgaagtggatttaacaggtgatcacagctgtcacctggattcacctggtcagtctcatggaaaaagcaggggtttctaatgttttgtccactcagtgtagaaCCATTGATGTACTTTGAAGGTAGTCATTTGTACTCGACTATCAAACAGAAACAAAAGACTTTACGTCAACAACTCTAGAAAACTGGTAGGAGAATGGAATGCAGTGCTATGGCTACAGCTATACATTCTCTGCTGCACAATGCTCTAACTTGAGGAAGTGGAGGGCTCAACCCAGGTCCTGAATGGATGTCCTTGTTTTTACTGTTGAGAGTTGAGTGACCTTGTTAGAACTGGAGTGGGAAAGCAGGACTCTGGGATacagtaaaacatgtttttaacattaagaccagtggtgtagtggagggtaaatgcaAAAAATGTAAAAGTTGTTTGTGCACCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGTTTATGGGAGCATTTACCCAGCTTTTGCAGaaaaaaatgcattgaaagtataCGAAGCATTATTATTCCCCACGAAAGGCGATCAGTGTTTATACTATATTTTCACTGATTAAGACATGTGGTCTTTGGATCAGCGGCTGTAGTTTGACATGAAGTCTTCTTCCATCTCTATAATAGTAAGCGACAACAACACTGAGCCCCAACATTTAGCCCATTTTGGGACAGGATTTCCATGTCTTAACTCCCTCAGCGACAGATTCATGCAGTCACCTGCTTTCTAAAACTGTTGTTTCTCTGCAGTTGAAACTGCTGTAATCTGGACCAAGCATCCTTTCCTACGAACCTCCTCTTCCGCTCCTTGCCCTGCTGCAATAACACATTTAATATCCAGTCATTTACAAAACATCCTTGTATTGTAACATGTCCACCTGTCATTCCCTGAGTGGTTTGTCTATCTATGGcgctgtctgaaatggcaccctattctctagtgcactactattggcTGGTAGTGCACTGTATGGAATAGACTAACATGTCTGCTGTGCCCTCAGTACATGGACTCACAGTCCCGAAGGTTTCCAAACGGAAGACTGAAGGTGCTGCCCAGTCTCTTGGTGGCTCTGCCTCCTCCCCCAGTCTTCTTCCTGTTCCAGTTGAGTAAGGGGGCGGTGCGCTGCCCCTTAGCCCTGCCCATGGTCCGTTGCAGAGCGTTCGCTTCGTCTCCACTGGGGGAGAGCATCACTTGCCTCCTAtccac

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU506344 False 3464 lncRNA 0.41 2 82771819 82775310
TU506345 True 3462 lncRNA 0.41 2 82771819 82775310

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-191a24.4 LOC106560402 coding downstream 166135 82601460 ~ 82605684 (-)
si:ch211-191a24.3 LOC106560396 coding downstream 235496 82433215 ~ 82536323 (-)
igfbp3 igfbp-3a1 coding downstream 425135 82275087 ~ 82346684 (-)
LOC110524669 LOC106584070 coding downstream 881906 81843519 ~ 81889913 (-)
LOC110524665 slc22a23 coding downstream 1004224 81639462 ~ 81767595 (-)
LOC110524677 mafa coding upstream 191674 82966984 ~ 82974589 (-)
LOC110524678 LOC106560415 coding upstream 206139 82981449 ~ 83097063 (-)
adcyap1r1b adcyap1r1 coding upstream 465897 83241207 ~ 83306242 (-)
LOC110524681 LOC106560421 coding upstream 809426 83584736 ~ 83599722 (-)
LOC110524682 LOC106560471 coding upstream 859997 83635307 ~ 83661963 (-)
G447388 NA non-coding downstream 27960 82743511 ~ 82743859 (-)
G447371 NA non-coding downstream 61549 82709114 ~ 82710270 (-)
G447363 NA non-coding downstream 72168 82695888 ~ 82699651 (-)
G447344 NA non-coding downstream 114370 82656364 ~ 82657449 (-)
G447310 NA non-coding downstream 187668 82578013 ~ 82584151 (-)
G447426 NA non-coding upstream 7634 82782944 ~ 82783686 (-)
G447442 NA non-coding upstream 24340 82799650 ~ 82799926 (-)
G447445 NA non-coding upstream 26876 82802186 ~ 82802401 (-)
G447448 NA non-coding upstream 27968 82803278 ~ 82803577 (-)
G447457 NA non-coding upstream 33077 82808387 ~ 82808596 (-)
G447220 NA other downstream 380595 82390655 ~ 82391224 (-)
G446775 NA other downstream 828208 81943285 ~ 81943611 (-)
G445220 NA other downstream 2510314 80245943 ~ 80261505 (-)
LOC118964653 LOC106581256 other downstream 2545618 80223240 ~ 80233361 (-)
G445197 NA other downstream 2594739 80176762 ~ 80177080 (-)
G447993 NA other upstream 542203 83315161 ~ 83319715 (-)
G448079 NA other upstream 735043 83510353 ~ 83520273 (-)
G448411 NA other upstream 1096292 83871602 ~ 83873308 (-)
G448452 NA other upstream 1140826 83916136 ~ 83916641 (-)
G450676 NA other upstream 2567478 85342788 ~ 85343072 (-)

Expression


Co-expression Network