G448378


Basic Information

Item Value
gene id G448378
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 83849702 ~ 83855550 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU507478
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>TU507485
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Function

NR:

description
Glutathione peroxidase 7 precursor

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU507478 False 903 lncRNA 0.38 3 83849702 83855550
TU507479 False 919 lncRNA 0.38 2 83849702 83855550
TU507480 False 903 lncRNA 0.38 2 83849702 83855550
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TU507489 True 919 lncRNA 0.38 2 83849702 83855550

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110524685 LOC106560426 coding downstream 24242 83804300 ~ 83825460 (-)
LOC110523023 NA coding downstream 49197 83798816 ~ 83800505 (-)
LOC110524682 LOC106560471 coding downstream 187739 83635307 ~ 83661963 (-)
LOC110524681 LOC106560421 coding downstream 249980 83584736 ~ 83599722 (-)
adcyap1r1b adcyap1r1 coding downstream 543460 83241207 ~ 83306242 (-)
LOC110522893 LOC106560472 coding upstream 24931 83879999 ~ 83896988 (-)
podn LOC106560429 coding upstream 210624 84066174 ~ 84120343 (-)
LOC118964673 NA coding upstream 233442 84088992 ~ 84090407 (-)
LOC118964672 NA coding upstream 234996 84090546 ~ 84091472 (-)
scp2b LOC106560430 coding upstream 265799 84121349 ~ 84138828 (-)
G448302 NA non-coding downstream 72483 83777006 ~ 83777219 (-)
G448296 NA non-coding downstream 76983 83771947 ~ 83772719 (-)
G448289 NA non-coding downstream 80232 83761781 ~ 83769470 (-)
G448272 NA non-coding downstream 121719 83727472 ~ 83727983 (-)
G448252 NA non-coding downstream 151396 83698050 ~ 83698306 (-)
G448384 NA non-coding upstream 3145 83858695 ~ 83859127 (-)
G448387 NA non-coding upstream 5602 83861152 ~ 83861477 (-)
G448413 NA non-coding upstream 15439 83870989 ~ 83871381 (-)
G448418 NA non-coding upstream 31162 83886712 ~ 83886971 (-)
G448079 NA other downstream 329429 83510353 ~ 83520273 (-)
G447993 NA other downstream 529987 83315161 ~ 83319715 (-)
G447220 NA other downstream 1458478 82390655 ~ 82391224 (-)
G446775 NA other downstream 1906091 81943285 ~ 81943611 (-)
G445220 NA other downstream 3588197 80245943 ~ 80261505 (-)
G448411 NA other upstream 16052 83871602 ~ 83873308 (-)
G448452 NA other upstream 60586 83916136 ~ 83916641 (-)
G450676 NA other upstream 1487238 85342788 ~ 85343072 (-)
lurap1 LOC106560455 other upstream 1590131 85443496 ~ 85472422 (-)
G450752 NA other upstream 1631292 85486842 ~ 85487158 (-)

Expression


Co-expression Network