G450957



Basic Information


Item Value
gene id G450957
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 85877733 ~ 85878974 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU510403
TTAGCCTCGGTGAATGCTGCTAGACCATCaggggtatttgtgtgtgtggtgtgtctatgtgcttatggttgtgcgtgtgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgtgtctatgtgcttatggctgtgcgtctatgtgcttatggtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgcgtgtgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtgatgcgtgtttgtggtgtgtcctatgtgcttatggtggtgcgtatgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgcgtatgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgtgtcctatgtgcttatggtggtgcgtatgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgcgtgtgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgcgtgtgtgtggtgtgtctatgtgcttatggtggtgcgtatgtgtggtgtgtctatgtgcttatggttgtgc

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU510403 True 501 TUCP 0.49 2 85877733 85878974

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
sgip1a sgip1 coding downstream 224936 85531690 ~ 85652797 (-)
LOC110524719 ttc4 coding downstream 366256 85502967 ~ 85511477 (-)
lurap1 LOC106560455 coding downstream 405311 85443496 ~ 85472422 (-)
LOC118964733 NA coding downstream 434497 85435129 ~ 85443236 (-)
LOC110524715 col24a1 coding downstream 702296 84934006 ~ 85175437 (-)
LOC118964679 NA coding upstream 192229 86071203 ~ 86071878 (-)
LOC110524724 lepr coding upstream 208219 86087193 ~ 86174451 (-)
LOC110524725 dnajc6 coding upstream 308413 86187387 ~ 86248090 (-)
ak4 ak4 coding upstream 374530 86253504 ~ 86260188 (-)
raver2 raver2 coding upstream 472368 86351342 ~ 86547212 (-)
G450934 NA non-coding downstream 29343 85848136 ~ 85848390 (-)
G450922 NA non-coding downstream 40051 85837387 ~ 85837682 (-)
G450919 NA non-coding downstream 43728 85833793 ~ 85834005 (-)
G450917 NA non-coding downstream 45967 85831070 ~ 85831766 (-)
G450909 NA non-coding downstream 55701 85821826 ~ 85822032 (-)
G450840 NA non-coding upstream 7831 85886805 ~ 85887332 (-)
G451012 NA non-coding upstream 129777 86008751 ~ 86009070 (-)
G451013 NA non-coding upstream 130137 86009111 ~ 86009433 (-)
G451089 NA non-coding upstream 257162 86136136 ~ 86136347 (-)
G451053 NA non-coding upstream 372144 86251118 ~ 86302961 (-)
G450752 NA other downstream 390575 85486842 ~ 85487158 (-)
G450676 NA other downstream 534661 85342788 ~ 85343072 (-)
G448452 NA other downstream 1961092 83916136 ~ 83916641 (-)
G448411 NA other downstream 2004425 83871602 ~ 83873308 (-)
G451271 NA other upstream 669864 86548838 ~ 86549878 (-)
G451286 NA other upstream 718378 86597352 ~ 86597744 (-)
ror1 LOC106560470 other upstream 886609 86763372 ~ 87043134 (-)
G451856 NA other upstream 1362880 87241854 ~ 87243233 (-)
G452255 NA other upstream 1619392 87498366 ~ 87499136 (-)

Expression



Co-expression Network