G451222


Basic Information

Item Value
gene id G451222
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 86417741 ~ 86422607 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU510690
caggactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtacaggactgctgctccacctgacctatgatagatgtaatacagtacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacaggactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatatatgtaatacagtacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtgcagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctgctccacctgacctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctactccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctgctccacctgagctatgatagatgtaatacagtacagtactgctattccacctcaaatcaaatcaaatcaaatgttatttgtcacatacacatggttagcagatgttaatgcgtgtgtagcgaaatgcttgtacttctagttccgacaatgcagtaataaccaacaagtaatctagctaacaattccaaaactactaccttatacacacaagtgtaaggggataaagaatatgtacataaagatatatgaatgagtgatggtacagagcggcataggcaagatacagtagatggtattgagtgcagtatatacatatgagatgagtatgtaaacaaagtggcatagttaaagtggctagtgatacatgtattacataaagatgcagtagatgatatagagtacagtatatacatatacatatgagatgaataatgtagggtatgtaacattatattaggtagcattgtttaaagtggctagtgatatattttacatcatttcccatcaatttccattattaaagtggctggagttgagtaagtgtgttggcagcagccactcaatgttagtggtggctgtttaacagtctgatgaccttgagatagaagctgttttt

Function

NR:

description
PREDICTED: sex-determining region Y protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU510690 True 2169 lncRNA 0.40 2 86417741 86422607

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ak4 ak4 coding downstream 157553 86253504 ~ 86260188 (-)
LOC110524725 dnajc6 coding downstream 169651 86187387 ~ 86248090 (-)
LOC110524724 lepr coding downstream 243290 86087193 ~ 86174451 (-)
LOC118964679 NA coding downstream 345863 86071203 ~ 86071878 (-)
pde4ba pde4b coding downstream 386592 85682309 ~ 86031149 (-)
cachd1 cachd1 coding upstream 134123 86556176 ~ 86712442 (-)
ror1 LOC106560470 coding upstream 340765 86763372 ~ 87043134 (-)
pgm1 LOC106560477 coding upstream 632427 87055034 ~ 87067699 (-)
efcab7 efcab7 coding upstream 649224 87071831 ~ 87093894 (-)
alg6 alg6 coding upstream 685393 87108000 ~ 87144341 (-)
G451186 NA non-coding downstream 82866 86300595 ~ 86334875 (-)
G451053 NA non-coding downstream 114780 86251118 ~ 86302961 (-)
G451089 NA non-coding downstream 281394 86136136 ~ 86136347 (-)
G451013 NA non-coding downstream 408308 86009111 ~ 86009433 (-)
G451012 NA non-coding downstream 408671 86008751 ~ 86009070 (-)
G451243 NA non-coding upstream 43493 86466100 ~ 86466638 (-)
G451159 NA non-coding upstream 54211 86476818 ~ 86478516 (-)
G451252 NA non-coding upstream 96321 86518928 ~ 86519152 (-)
G451253 NA non-coding upstream 96713 86519320 ~ 86519645 (-)
G451256 NA non-coding upstream 101419 86524026 ~ 86524277 (-)
G450957 NA other downstream 538767 85877733 ~ 85878974 (-)
G450752 NA other downstream 930583 85486842 ~ 85487158 (-)
lurap1 LOC106560455 other downstream 945861 85443496 ~ 85472422 (-)
G450676 NA other downstream 1074669 85342788 ~ 85343072 (-)
G448452 NA other downstream 2501100 83916136 ~ 83916641 (-)
G451271 NA other upstream 126231 86548838 ~ 86549878 (-)
G451286 NA other upstream 174745 86597352 ~ 86597744 (-)
G451856 NA other upstream 819247 87241854 ~ 87243233 (-)
G452255 NA other upstream 1075759 87498366 ~ 87499136 (-)

Expression


Co-expression Network