G451564


Basic Information

Item Value
gene id G451564
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 86787330 ~ 86789304 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU511064
ACACAGTATGGAACACGCATAACctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacagtatggaacacacatgatctacacattatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgATCTACACATTATGGAACACGCATGACctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctgcacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgATCTACACAGTATGGATCACACATGATctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgATCTACACAGTATGGATCACACATGATctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgATCTACACAGTATGGATCACACATGATctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgATCTACACAGTATGGATCACACATGATctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacgcacatgatctacacagtatggaacacacatgATCTACACAGTATGGATCACACATGATctacacagtatggaacacacataacctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgatctacacagtatggaacacacatgATCTGATAC

Function

NR:

description
PREDICTED: dynein heavy chain-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU511064 True 1608 lncRNA 0.40 2 86787330 86789304

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
cachd1 cachd1 coding downstream 74888 86556176 ~ 86712442 (-)
raver2 raver2 coding downstream 240118 86351342 ~ 86547212 (-)
ak4 ak4 coding downstream 527142 86253504 ~ 86260188 (-)
LOC110524725 dnajc6 coding downstream 539240 86187387 ~ 86248090 (-)
LOC110524724 lepr coding downstream 612879 86087193 ~ 86174451 (-)
pgm1 LOC106560477 coding upstream 265730 87055034 ~ 87067699 (-)
efcab7 efcab7 coding upstream 282527 87071831 ~ 87093894 (-)
alg6 alg6 coding upstream 318696 87108000 ~ 87144341 (-)
foxd3 foxd3 coding upstream 362521 87151825 ~ 87153819 (-)
atg4c atg4c coding upstream 602357 87391661 ~ 87401413 (-)
G451562 NA non-coding downstream 7915 86776022 ~ 86779415 (-)
G451559 NA non-coding downstream 18551 86768490 ~ 86768779 (-)
G451557 NA non-coding downstream 25086 86758684 ~ 86762244 (-)
G451357 NA non-coding downstream 35762 86751227 ~ 86751568 (-)
G451353 NA non-coding downstream 38247 86748792 ~ 86749083 (-)
G451567 NA non-coding upstream 4904 86794208 ~ 86794649 (-)
G451575 NA non-coding upstream 22560 86811864 ~ 86812067 (-)
G451592 NA non-coding upstream 46006 86835310 ~ 86835639 (-)
G451601 NA non-coding upstream 62472 86851776 ~ 86852270 (-)
G451607 NA non-coding upstream 70226 86859530 ~ 86859732 (-)
ror1 LOC106560470 other downstream 21343 86763372 ~ 87043134 (-)
G451286 NA other downstream 189586 86597352 ~ 86597744 (-)
G451271 NA other downstream 237452 86548838 ~ 86549878 (-)
G450957 NA other downstream 908356 85877733 ~ 85878974 (-)
G450752 NA other downstream 1300172 85486842 ~ 85487158 (-)
G451856 NA other upstream 452550 87241854 ~ 87243233 (-)
G452255 NA other upstream 709062 87498366 ~ 87499136 (-)
LOC110523029 LOC106584023 other upstream 984918 87685213 ~ 88049103 (-)
G452442 NA other upstream 1070823 87860127 ~ 87866464 (-)
G452457 NA other upstream 1105428 87894732 ~ 87895212 (-)

Expression


Co-expression Network