G453294


Basic Information

Item Value
gene id G453294
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 89151748 ~ 89155291 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU513158
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>TU513159
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>TU513160
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU513158 False 3470 lncRNA 0.43 3 89151748 89155291
TU513159 False 3520 lncRNA 0.43 2 89151748 89155291
TU513160 True 3494 lncRNA 0.43 2 89151748 89155291
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110524761 LOC106584012 coding upstream 171859 88655985 ~ 88979889 (+)
LOC110522898 NA coding upstream 580563 88570295 ~ 88571185 (+)
LOC110522896 NA coding upstream 719095 88425966 ~ 88432653 (+)
prpf38a pr38a coding upstream 733900 88412848 ~ 88417848 (+)
LOC110524756 LOC106560515 coding upstream 751409 88390467 ~ 88400339 (+)
LOC118964683 NA coding downstream 493018 89648309 ~ 89669213 (+)
kifap3a kifap3 coding downstream 565147 89720438 ~ 89763740 (+)
swt1 swt1 coding downstream 657735 89813026 ~ 89847246 (+)
hmcn1 LOC106560561 coding downstream 814768 89970059 ~ 90193583 (+)
ptgs2b ptgs2b coding downstream 1110279 90265570 ~ 90272209 (+)
G453249 NA non-coding upstream 93241 89046260 ~ 89058507 (+)
G453250 NA non-coding upstream 94006 89053856 ~ 89057742 (+)
G453248 NA non-coding upstream 116977 89031794 ~ 89034771 (+)
G453247 NA non-coding upstream 119473 89026780 ~ 89032275 (+)
G453246 NA non-coding upstream 139813 89010832 ~ 89011935 (+)
G453345 NA non-coding downstream 71280 89226571 ~ 89227523 (+)
G453348 NA non-coding downstream 73750 89229041 ~ 89233853 (+)
G453347 NA non-coding downstream 80466 89235757 ~ 89238160 (+)
G453377 NA non-coding downstream 117924 89273215 ~ 89273643 (+)
G453396 NA non-coding downstream 160384 89315675 ~ 89319363 (+)
G452697 NA other upstream 847299 88303307 ~ 88304449 (+)
G452673 NA other upstream 928121 88223282 ~ 88223627 (+)
G452609 NA other upstream 1025881 88120399 ~ 88125867 (+)
G452159 NA other upstream 1248308 87902315 ~ 87903440 (+)
G452111 NA other upstream 1379654 87770604 ~ 87772094 (+)
G453429 NA other downstream 229934 89385225 ~ 89386470 (+)
G453547 NA other downstream 444673 89599964 ~ 89600696 (+)
G454751 NA other downstream 1291404 90446695 ~ 90447956 (+)
G455168 NA other downstream 1633227 90788518 ~ 90790211 (+)
G455203 LOC106560548 other downstream 1838574 90993865 ~ 90994299 (+)

Expression

G453294 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 3.
End of interactive chart.

G453294 Expression in each Bioproject

Bar chart with 18 bars.
G453294 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 75.
End of interactive chart.

Co-expression Network