G455711


Basic Information

Item Value
gene id G455711
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 91242497 ~ 91248997 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU515971
tactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatGGGTACGGTTCcaggtcatatgtacatgtaggtagggtgatgggtacaggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtacaggtcagtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtacaggtcagtccaggtaatatgtacatgtaggtaggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtaaatgtaggtaggggtgatgggtactggcccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtacaggtccaggtaatatgtacatgtaggtaggggtgacgggtactggtccaggtaatatgtaaatgtaggtaggggtgatgggtactggcccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtacggtcagtccaggtaatatatacatgtaggtaggggtgatgggtacaggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtcatttgtacatgtaggtaggggtgaa
>TU515972
ggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtaggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtacaggtcagtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtaggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatatacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtcatttgtacatgtaggtaggggtgaa
>TU515967
tggggtgatgggtacaggtcagtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtaggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatGGGTACGGTTCcaggtcatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtacaggtccaggtaatatgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtcaaggtcatttgtacatgtaggtggggtgatgggtacaggtcagtccaggtcatttgtacatgtaggtagggtgatgggtactggtccaggtaatatgtacatgtaggtggggtgatgggtacaggtcagtccaggtcatttgtacatgtaggt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU515971 False 752 lncRNA 0.48 5 91242497 91248275
TU515972 False 466 lncRNA 0.48 4 91242497 91244907
TU515967 True 506 lncRNA 0.48 3 91247492 91248997

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964688 NA coding downstream 133403 91105800 ~ 91109094 (-)
aspm LOC106560548 coding downstream 238865 90979189 ~ 91003632 (-)
LOC110524789 NA coding downstream 310236 90912429 ~ 90932261 (-)
LOC110524787 cfhr5 coding downstream 340102 90818787 ~ 90902401 (-)
b3galt2 LOC106560555 coding downstream 858403 90364241 ~ 90384094 (-)
lhx9 LOC106560546 coding upstream 53547 91302544 ~ 91315662 (-)
abhd8b abhd8 coding upstream 411830 91660827 ~ 91677939 (-)
ano8b LOC106560570 coding upstream 432848 91681845 ~ 91772451 (-)
plvapb plvap coding upstream 575608 91824605 ~ 91828072 (-)
babam1 babam1 coding upstream 583384 91832381 ~ 91849143 (-)
G455685 NA non-coding downstream 52943 91189110 ~ 91189554 (-)
G455662 NA non-coding downstream 129704 91112399 ~ 91112793 (-)
G455661 NA non-coding downstream 130369 91111837 ~ 91112128 (-)
G455651 NA non-coding downstream 141586 91100712 ~ 91100911 (-)
G455646 NA non-coding downstream 152251 91089866 ~ 91090246 (-)
G455718 NA non-coding upstream 33066 91282063 ~ 91282769 (-)
G455751 NA non-coding upstream 114288 91363285 ~ 91457328 (-)
G455760 NA non-coding upstream 126409 91375406 ~ 91430319 (-)
G455791 NA non-coding upstream 205563 91454560 ~ 91455729 (-)
G455795 NA non-coding upstream 216725 91465722 ~ 91465933 (-)
G455649 NA other downstream 146162 91094709 ~ 91096335 (-)
G455600 NA other downstream 167734 91073996 ~ 91074763 (-)
G455630 NA other downstream 181512 91057457 ~ 91060985 (-)
G454882 NA other downstream 768883 90454681 ~ 90473614 (-)
G455713 NA other upstream 8110 91257107 ~ 91258984 (-)
G456288 LOC106560576 other upstream 647639 91896636 ~ 91914788 (-)
G457385 NA other upstream 1262922 92511919 ~ 92514384 (-)
G457422 NA other upstream 1322982 92571979 ~ 92573894 (-)
G457423 NA other upstream 1325386 92574263 ~ 92574754 (-)

Expression


Co-expression Network