XLOC_023735


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_023735
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 42135051 ~ 42141140 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00047278
CTGagcacgtgtcatcagagggagagTTAAGCCCCGCCCAATAGTGGAGACAGCAGAGACTGTACAGCAGGTGCtctaccgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgtgctgaagGACAGACAGACGCTCAGATGATTTAAACTCATGTTTAATatgaaagatgatgatgatgatgatgatgatgatggacagTTTCCCTCCGCTGACGGTCAAAGGCCACAGAAATGATGAAGTGCAGGAGCAGCGCCCCTGCGGGGTCACCACGGCAACACTGCAGCGCCCCTACTGGAGGACTGGGTCACCATGGCAACACTGCAGAGATATGTGGTACAacgacctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctctttctctgcagttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttctggctCTGCAGGCAGCCATGCAAGCGCTCGTCTAGCAGAAGTGTGTGTCCGACAGCAGACTCTATACTGGTCAGCAGCTCTATAAAACTAGAGCTGTCGCTGACTCTACTGTAACTGCTCTATGCCTCATCTTAAAAACCGGCGGATGAATGAAGCAGCTGGAGGCGGAGCCAGAGGAGAGATCAGAGAAGTGGAGACGCTTGCATATTCATGAGGAGTCCGTGACAGAGCGCCCGCCCCCCCGCCGCCGCCCGCCCAGAGAAACATTTGGTTTAAAATGACAGGAGCTTATGTACATCGCTGATCCTCTGTGCGGGTCACGCTTGTGTTGCACTCGGCCCATGCGCCGGGGTCAGGGGTCACTCCTGCCCGAAGCCCTCCGTCTCCTCGATGGCGAACAGCAGCTTCTCCTTCAGCTGCTCGAAGCTCTTATACGGCGGCAGATCCAGACGGTTGAagctGTGTGACTGCGGGGCAGCCAGGTGTCCTTGCCCACCTTCTCTATGCAGAACTTCTGCGGCCCGTTACTGCCTGCAGGAGGAGGAGCGTCAGAGcagcgcagtgtgtgtgtgtgtgtgtaagataaGAATCGTGTGTATGATGacatgtgtgagagagaggaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcactcacCCATGAGCTCTGCGAAGCCGCCCAGTGGGAGTCTGCAGGTGCCCGTCACAAACTGCATTAAGCGCAGACGCACCTCATTGTCCACCTCCTTCACAagctgcgcgcacacacacacacacacacacacacacacacttcagtgtgGATCACAGTACGAGTCTCCAGCTTAAGCCAGTGTAAACATAACTGCTGGATGAATGATGAGTGTTGAAGGggtgtgtgtgttcgtgtatgtgtgttcatgtctgtgtgtgtttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagctcagAGAAAGTTCATCTGATGTTCGTGATGCTTCAGTGTTTTCATCAGTCTCAGGATGCTTTACTGTAATAAACTACACTGGCTCACAGTCTCtgcttcagcacacacacacacacactctctctgagGGAATACACACTCCAGGGTTTCTCACCTGCCAGAACCAGATGATCTGCTTGCTGTTGCGTGTGTAGTGGCGATACACAGTGTTCCTCTGCCAGTCCTGCAGATCCACCTCCTGCATCCCGCACAGCATCACCTGCACACAAACACCGGTCAGCGAGAGACACTccacttcactcacacacacacacacacacacacacacacacacacacctccagctCCTTCTCATCGAAGTACTGCAGCCACTGCAGCGGCACCACCTCATTAAAGCCGTCCAGGAAGGCTTTAGTCTGAGACTCCACACCGCGAGAGAAACGCCACTCCGCCAtcagcctacacacacacacacacacacacacaggtcagagAACACACAAAGgtcagagaacacacacacacacacacacacacactctctgtctcGTACCCGATGTACTCCTCCTTGTTCTCCTCCGTCACCTGCACGTTGGCTCCGTCCTCCTTCAGGTCGTGTGAGCTGATCTTCCCCAGAATCTCCATGTCCACCGAGAAGAACATCTCCAGCCCACACTCCTCGATGTTAttatctctgaacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatccataagggagcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgaccgtATCCAGATCAGGGAGTTGTAGAACTCGGGGTCGATGGACTCCAGGTCCTTCAGGATCAGCTTCTTGCTCAGCATCCGCTTATAGAACGGCAGAGAGAAGCCGGTGTCGATGAACTTACCGTGGAAGAgtgcctgaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaggtgagcgGCGCTCTGCAGAGCTCAGGTGTGTCAGTGAGGGCGGGGCTGTTACCATGGCGATAAATCGGCCGATGAAGCAGAAGTAGGACAGGTGGTCTGGGTTGATGGTGGATGCTGGGTTGATCTGCAGGCAGTAGTTGCTCTTGCCGGCGTACTCGAAGAGGCAGTACATGGGGTTCAACACCTCGTGGGAGAGGAGGAAGAACCActcgctgcacacacacacacacattggcttAAGCTAGAGACTCATACTGTGATCCACacggaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgttaccGTGCGAGGCCTCCGTAGTCCAGTCCCTCCTCTCCTCTAAAGATCACATACAGACGCCTCCGCAGGTCATACGGCTTAAAGTTCATGATCTGCAGAGAAAGCAGACGATcagaaactacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacagtagactataccggtttttaaccagttttgataaagacatTCAGCCTTGGGTAAAAAACAGAGTGTactttgactgtgtgtgtgcgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttcgatTGTGGATCCTTTCACAGGTCTGGGGTCAGCTCTGAACAGTCCAGTGGCTGTATGATGTTTGTGTGCTTGAGATATTGAGATATGATTCAGAGTtgtacacgtacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaatgacttTTTCTAAGTTTATCTGTGTTCTACCCAATCAGCCCAGTGTGTGTGTGCCGCAGTTAGTGGCATTATGTGGGAGTATAACTGATGATGTTCTGTCAGTGTGAGCAGAGCGGCCCACAAACTCAGCCGAGTGATGAagctgatgatgaagatgatgatgaagatgataatgatgatgatgatgatgatctccAGTGAACTGTCTGCCTATAACTGAATCTCTGACTCCAGCTCTGCTTCATCTCGCAGACTGATCATGTTTggatttaaactgtaattatccctgcaaaacacacataaacatacacacacgcacgcgcacttacacacgcacacacacatgcacacacacacgcacacacgcgcacacacacacacgcacacacacacacatacatatacacacacacacacacacgcgcgcaaacacacacacacacacacacacacacacgcgcacacacacacgcacacacacacacgcacacacacacgcacacacacacacgcacacacgcacacacacacacacacgcacacacacgcacacacacgcacacacacgcacacacacgcacacacacacacgcacacacacacacaaacacacacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacagacacacacagacacacacacacacacacacacagacgtgaCTGAAGCTCTGCTAACCTGCTGGAAGGAGTCCTCAAACAGAGTCTGTCGGGACACCGTGATCTTCACATGGCTGGCGAGAGCATTGGACTGCGAACACACAGAGGACATGttaggaacacacacacacacacacacacacacacacaggatgaaGTGTTGAGCAAGAGTTACCTGACACAGATAACGGAAATGAGCCAGTTTCCATCTGAAGCTCCGCTCGTACGCAATCTGTGGACCTTtagtgctgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacattagaggAACACATAACAACACTCCAGCAGTGTTCTGATCAGTGGTCTCAGGCCCGGTCCACACTGCTGTGTTTCAGTGTTAAACTGTGTTTGAGAATGAGGGAGATCTGCGTCCACACTGCCGTTTCTGAACAGCTCCGCTCACACTACactactgaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactctggcgcAGGTTAGACAGTTGCTGCTGGGTCTCCCGCTGATTCTGGTTGTGCAGTGACCGCCGGCCTGTATCTCCTCTACTCTGGActcctcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctcctCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActcctcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctcctCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActcttcttgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtatctcCTCTACTCTGGActctt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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00047278 True 5922 lncRNA 0.51 2 42135051 42141140

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_023734 pigm coding downstream 26396 42102204 ~ 42108655 (-)
XLOC_023733 NA coding downstream 40973 42091209 ~ 42094078 (-)
XLOC_023732 ssr1 coding downstream 44416 42081728 ~ 42090635 (-)
XLOC_023731 ppp4r1 coding downstream 62165 42060967 ~ 42072886 (-)
XLOC_023730 NA coding downstream 196274 41937199 ~ 41938777 (-)
XLOC_023736 rmdn1 coding upstream 173 42141313 ~ 42150116 (-)
XLOC_023737 NA coding upstream 26874 42168014 ~ 42170743 (-)
XLOC_023738 NA coding upstream 29886 42171026 ~ 42172918 (-)
XLOC_023665 dre-mir-735 misc downstream 3957024 38177961 ~ 38178027 (-)
XLOC_023729 NA non-coding downstream 207884 41923786 ~ 41927167 (-)
XLOC_023728 CABZ01081282.1 non-coding downstream 308229 41826706 ~ 41826822 (-)
XLOC_023723 NA non-coding downstream 674927 41446548 ~ 41460124 (-)

Expression


Co-expression Network