G462565


Basic Information

Item Value
gene id G462565
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 99518725 ~ 99521899 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU524731
acatagggaatatggtgccgttTGGGACTTAAGATGGGTGATGCGCATTTTCCAAACACCAGCTAGCAGGTCAGTTGTCACTCAGTGTTCTCATCCAATCCTCCTCACTTTAACACTTACCTATTGTGTACAGAAGAAAACGAAATCCTGTTGTATTTTACACAGAGAATCGTTAGTTCTCAGTCTCTTGTGTTGTGGAGGAAATATGTCTGCATTATACGCTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATTATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGATACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGATACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATATAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGGAGGCTACATGATGATCTATAGAGACTGTTGATGTAGACTACACGGTCtagatgtgtcttttacttgaactcagtgaagaatttatttgggctgcaatctgaggtgcagttgaCTCTAATGAACTAATCCTCTGCAgccgaggtaactctgggtcttcctttcctgtggcagccctcatgagagccagtttcttcatagcgtttgatggtgtttgcgaatgcacttgaagaaactgatggactgtcgtttctctttgattatttgagttgttcttgccataatatggacttagtcttttaccaaatgggctatcttctgtataccc

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU524731 True 1926 lncRNA 0.39 3 99518725 99521899

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110490602 LOC106560622 coding upstream 117167 99374155 ~ 99401558 (+)
LOC110523045 NA coding upstream 310918 99196283 ~ 99207807 (+)
LOC110524867 bivm coding upstream 339903 99159906 ~ 99178822 (+)
LOC110523047 LOC106560665 coding upstream 417655 99061377 ~ 99101070 (+)
oca2 LOC106591054 coding upstream 1076460 98276682 ~ 98442265 (+)
LOC118964709 NA coding downstream 623704 100145603 ~ 100157146 (+)
si:ch211-121a2.4 LOC106560711 coding downstream 661028 100182927 ~ 100191165 (+)
LOC110524906 NA coding downstream 702312 100224211 ~ 100226348 (+)
LOC110524909 LOC106921341 coding downstream 898368 100420267 ~ 100449778 (+)
LOC118964711 NA coding downstream 1144248 100666147 ~ 100667320 (+)
G462557 NA non-coding upstream 20594 99497514 ~ 99498131 (+)
G462517 NA non-coding upstream 31946 99429422 ~ 99486779 (+)
G462514 NA non-coding upstream 94757 99423620 ~ 99423968 (+)
G462510 NA non-coding upstream 99245 99418041 ~ 99419480 (+)
G462509 NA non-coding upstream 99664 99416872 ~ 99419061 (+)
G462567 NA non-coding downstream 8976 99530875 ~ 99531089 (+)
G462724 NA non-coding downstream 25933 99547832 ~ 99548040 (+)
G462758 NA non-coding downstream 68780 99590679 ~ 99590907 (+)
G462761 NA non-coding downstream 84133 99606032 ~ 99606531 (+)
G462763 NA non-coding downstream 95532 99617431 ~ 99659807 (+)
G462549 NA other upstream 34765 99483383 ~ 99483960 (+)
G462233 NA other upstream 459371 99058883 ~ 99059354 (+)
G462037 NA other upstream 685814 98832457 ~ 98834433 (+)
G461999 NA other upstream 739658 98774482 ~ 98779067 (+)
G462762 NA other downstream 544670 100050135 ~ 100089049 (+)
G463119 NA other downstream 649238 100171137 ~ 100171897 (+)
G463139 NA other downstream 704605 100226504 ~ 100230232 (+)
G463164 NA other downstream 747662 100269561 ~ 100291594 (+)
G463269 NA other downstream 957722 100479621 ~ 100482754 (+)

Expression


Co-expression Network