G462763


Basic Information

Item Value
gene id G462763
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 99617431 ~ 99659807 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU525014
actgtctctattgtattatgacagagcagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatcaactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatga
>TU525040
taatttgacagaccagcaagatctattgtctctataataatttgacagacacgctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccaactggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctacagtctctataataaaatgacagaccaggtatatctactgtatctattataatttgaaagactagctagatctattgtctctataataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcaactgtctctattatattatgacagaccagctagatcaactgtctctattatattatgacagatcagctagatctattgtctcaattataatttgacagaaccatcaagatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattgtattatgacagagcagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatcaactgtctctattatattatgacagatcagctatatctactgtctctattttaatatgacagaaccagcttgatatactgtctctatg
>TU525046
taatttgacagaccagcaagatctattgtctctataataatttgacagacacgctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccaactggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctacagtctctataataaaatgacagaccaggtatatctactgtatctattataatttgaaagactagctagatctattgtctctataataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctgttataatgtgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctgcatctacactctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctacatctactgtatctattataatatgacagcccggctagatctattgtctctattataatttgacagaaccatcaagatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtttctatgtctctattatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattatgttatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagttagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattag
>TU525025
taatttgacagaccagcaagatctattgtctctataataatttgacagacacgctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccggctagatctattgtctctattataatttgacagaaccatcaagatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattgtattatgacagagcagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatcaactgtctctattatattatgacagatcagctatatctactgtctctattttaatatgacagaaccagcttgatatactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgccagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatttgacaaaccagctagatctactgtctctatgtctctattgtagtatgacagatcagctagatctactctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatttgacagaccagctggatctattgtctctataataatatgacagactagctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctatatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctgtataacaatatgatagaccagctagatctactgtctctattatattataacagatcagctagatctactagttctattataatatgacagaccagcaagatctactttctctattataatatgacagaccagctagatcta
>TU525036
tctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattataatacgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattagaatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatttactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatcttctgtctctattatattatgaattaccaggtagatctaatgtcgctattgtattatgacagagcagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagatcagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatcaactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattagatt
>TU525033
tgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgccagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatttgacaaaccagctagatctactgtctctatgtctctattgtagtatgacagatcagctagatctactctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatttgacagaccagctggatctattgtctctataataatatgacagactagctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctatatctactgtctctattataatatgacagaaccatcaagatctactgtctctatgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattagattatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgcctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctac
>TU525037
gctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgccagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatataatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatttgacaaaccagctagatctactgtctctatgtctctattgtagtatgacagatcagctagatctactctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatttgacagaccagctggatctattgtctctataataatatgacagactagctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctatatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctgtataacaatatgatagaccagctagatctactgtctctattatattataacagatcagctagatctactagttctattataatatgacagaccagcaagatctactttctctattataatatgacagaccagctagatcta
>TU525052
gctagatctgctgtctctattacattatgacagaccagctggatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctacatctactgtatctattataatatgacagcccggctagatctattgtctctattataatttgacagaaccatcaagatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtttctatgtctctattatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattatgttatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagttagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattag
>TU525019
attataatatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatcttctgtatctattataataacacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatttattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattactacagaccagcaagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatga
>TU525018
gtctctattaaattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagatcagctatatctactgtctctattataatatgacaaacaagctagatctactgtctctatgtctctattgtattatgacagatcagctagatctactctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagacaagctagatatactgtatctattataatttgacagaccagctagatctattgtctctataataatatgacagactagctagatctgctgtatctattacagtatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctggatctactgtctctataataatatgactgaccagctagatctacagtatctattataatatgaacgaccagctagatctactgtctctataacaatatgatagaccagctagatctactgtctctgttataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagcttcatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctataataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattataacagatcagctagatctactagttctattataatatgacagaccagcaagatctaccttctctattatattatgacagtctctattatattataacagatcagctagatctactagttatattataatatgacagaccagcaagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagttctactgtttctattataatatgacagaccagctatatctactgtctctatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattacattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatga
>TU525032
caagttagatctactctctctattatattatgatagacaagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatgtactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatga
>TU525041
gatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagttagatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtatctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctcatatattatgacagaccagcaagatctactgtctctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagacctgctagctctactgtatctattatattatgacagaccagcaacatCTACCGTCTCTATTGGATTacgacacaccagctagatcttctgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctgtctctattatattactgcagaccagcaagatctactgtctctattgtattttgagagaccagctagatctactgtctctattatattatgaatgaccaggtagatctaatgtcgctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatcgtatgacagaccagctagatctactgtttttatgtctctattatattatgacagacaagttagatctactctctctattatattatgatagacaagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatgtactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtatctattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatga
>TU525044
cagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgacatagcagctagatctactgtctctattgtattatgacatagcagctagatctactctctctattatattatgacagacataatCTACACAatctactagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctacagtctctataataatatgacagaccaggtatatctactgtatctattataatttgaaagactagctagatctattgtctctataataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccaggtagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatggcagaccaggtatatctactatatctattataatttgacagaccagctagatctactgtttctattatattatgagagacaagctagatctactgtctctattataatatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctatattataatatgacagaccagctggatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatcgactgtatttattatcatatgacagaccagctagatctactgtttctattatatgatgacagaccagctagagctactgtttctattgtattatgacagagcagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagttcagctatatctactgtctctattataatatgacaaacaagctagatctactgtctctatgtctctattgtattatgacagatcagctagatctactctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatatactgtctctattgtattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatatactgtatctattataatttgacagaccagctagatctattgtctctataataatatgacagactagctagatctgctgtctctattacattatgacagagcagctagatctactgtctctattaaattatgacagaccagctagatctactgtctctatcatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattgtattatgacatagcagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtttctatgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactctctctattatattatgacagacataatCTACACAatctactagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctagtctctataataatatgacagaccaggtatatctactgtatctattataatttgaaagactagctagatctattgtctctataataatatgacagaccagctagatccactgtctctattatattatgaccgaccagctagatctactgtctctataacaatatgatagaccagctagatctactgtctctgttataatatgacagatcagctggatctactgtctcaattataatatgacagaccagcttcatctactgtatctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctataattatatgacagaccatctagatctactgtctctattatattataacag

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU525014 False 280 lncRNA 0.35 2 99617431 99651845
TU525040 False 675 lncRNA 0.34 3 99618255 99652911
TU525046 False 906 lncRNA 0.35 3 99618255 99644596
TU525025 False 1381 lncRNA 0.35 2 99618255 99626700
TU525036 False 790 lncRNA 0.35 2 99619846 99625563
TU525033 False 940 lncRNA 0.36 3 99621615 99632094
TU525037 False 904 lncRNA 0.35 2 99623093 99626700
TU525052 False 556 lncRNA 0.35 2 99623093 99644596
TU525019 False 382 lncRNA 0.33 2 99627742 99651845
TU525018 False 1125 lncRNA 0.34 2 99636347 99651845
TU525032 False 292 lncRNA 0.33 2 99647738 99651845
TU525041 False 928 lncRNA 0.35 2 99648761 99651845
TU525044 True 1925 lncRNA 0.34 2 99653733 99659807

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110490602 LOC106560622 coding upstream 215873 99374155 ~ 99401558 (+)
LOC110523045 NA coding upstream 409624 99196283 ~ 99207807 (+)
LOC110524867 bivm coding upstream 438609 99159906 ~ 99178822 (+)
LOC110523047 LOC106560665 coding upstream 516361 99061377 ~ 99101070 (+)
oca2 LOC106591054 coding upstream 1175166 98276682 ~ 98442265 (+)
LOC118964709 NA coding downstream 485796 100145603 ~ 100157146 (+)
si:ch211-121a2.4 LOC106560711 coding downstream 523120 100182927 ~ 100191165 (+)
LOC110524906 NA coding downstream 564404 100224211 ~ 100226348 (+)
LOC110524909 LOC106921341 coding downstream 760460 100420267 ~ 100449778 (+)
LOC118964711 NA coding downstream 1006340 100666147 ~ 100667320 (+)
G462761 NA non-coding upstream 10900 99606032 ~ 99606531 (+)
G462758 NA non-coding upstream 26524 99590679 ~ 99590907 (+)
G462724 NA non-coding upstream 69391 99547832 ~ 99548040 (+)
G462567 NA non-coding upstream 86342 99530875 ~ 99531089 (+)
G462565 NA non-coding upstream 95532 99518725 ~ 99521899 (+)
G462769 NA non-coding downstream 8126 99667933 ~ 99669694 (+)
G462796 NA non-coding downstream 96399 99756206 ~ 99756976 (+)
G462797 NA non-coding downstream 97291 99757098 ~ 99762119 (+)
G462799 NA non-coding downstream 112149 99771956 ~ 99775934 (+)
G462801 NA non-coding downstream 117658 99777465 ~ 99777993 (+)
G462549 NA other upstream 133471 99483383 ~ 99483960 (+)
G462233 NA other upstream 558077 99058883 ~ 99059354 (+)
G462037 NA other upstream 784520 98832457 ~ 98834433 (+)
G461999 NA other upstream 838364 98774482 ~ 98779067 (+)
G462762 NA other downstream 406762 100050135 ~ 100089049 (+)
G463119 NA other downstream 511330 100171137 ~ 100171897 (+)
G463139 NA other downstream 566697 100226504 ~ 100230232 (+)
G463164 NA other downstream 609754 100269561 ~ 100291594 (+)
G463269 NA other downstream 819814 100479621 ~ 100482754 (+)

Expression


Co-expression Network