G463346


Basic Information

Item Value
gene id G463346
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 100600669 ~ 100608599 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU525798
atggtgactggagtatgggtagctgcagcccagtatggtgactggagtatgggtagctgtcccCCAGTATGATGagtggagtatgggtagctgtcccgcagtatggtgactggagtatgggtagctgcaggacaatatggtgactggagtatgggtagctgcaggacaatatggtgacttgagtatgggtagctgcaggacaatatggtgacttgagtatgggtagctgtcccccagtaTGGTGACTtgagtatgggtagctgtcccccagtatggtgactggagtatgggtagctgtcccccagtatggtgactggagtatgggtagctgtcccccagtatggtgactggagtatgggtagctgcaggacaatatggtgacttgagtatgggtagctgcaggacaataatggtgactggagtatgtgtagctgcaggacaatatgatgacttgagtatgggtagctgtcccccagtatggtgactggagtatgggtagctgcagcccagtatggtgactggagtatgggtagctgtcccccagtatggtgactggagtatgggtagctgcaggacaatatggtgactggagtatgtgtagctgcaggacaatatgatgacttgagtatgggtagctgtcccccagtatggtgactggagtatgggtagctgcaggacaatatgaCGACTTGAGTATGGGTAAGtgcaggacaatatggtgactggagtatgggtagctgcaggacaatatgacgacttgagtatgggtagctgcaggacaatatgaCGACTctagtatgggtagctgcagtcCAACATGGTGACTTGattatgggtagctgcaggacaatatggtgacttgagtatgggtagctgcaggacaatatggtgactggagtatgggtagctgcagcccaGTATGGTGACTgaagtatgggtagctgcaggccaatatggtgactggagtatggttAGCTGCAGAACAATATGGTTACTTGAGTATGCATAGCTGCAGCCCAATacggtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU525798 True 1027 lncRNA 0.50 6 100600669 100608599

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110524909 LOC106921341 coding upstream 150891 100420267 ~ 100449778 (+)
LOC110524906 NA coding upstream 374321 100224211 ~ 100226348 (+)
si:ch211-121a2.4 LOC106560711 coding upstream 409504 100182927 ~ 100191165 (+)
LOC118964709 NA coding upstream 443523 100145603 ~ 100157146 (+)
LOC110490602 LOC106560622 coding upstream 1199111 99374155 ~ 99401558 (+)
LOC118964711 NA coding downstream 57548 100666147 ~ 100667320 (+)
G463344 NA non-coding upstream 1963 100597603 ~ 100598706 (+)
G463339 NA non-coding upstream 10861 100589534 ~ 100589808 (+)
G463303 NA non-coding upstream 65796 100532203 ~ 100534873 (+)
G463289 NA non-coding upstream 87431 100511631 ~ 100513238 (+)
G463277 NA non-coding upstream 105173 100494679 ~ 100495496 (+)
G463350 NA non-coding downstream 3067 100611666 ~ 100612744 (+)
G463394 NA non-coding downstream 72696 100681295 ~ 100725850 (+)
G463404 chd1l non-coding downstream 85728 100694327 ~ 100698633 (+)
G463408 NA non-coding downstream 97061 100705660 ~ 100706209 (+)
G463422 NA non-coding downstream 129719 100738318 ~ 100757844 (+)
G463269 NA other upstream 117915 100479621 ~ 100482754 (+)
G463164 NA other upstream 309075 100269561 ~ 100291594 (+)
G463139 NA other upstream 370496 100226504 ~ 100230232 (+)
G463119 NA other upstream 428772 100171137 ~ 100171897 (+)
G462762 NA other upstream 514665 100050135 ~ 100089049 (+)

Expression


Co-expression Network