LOC118964801


Basic Information

Item Value
gene id LOC118964801
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 543104 ~ 545704 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005051978.1
ACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTTTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCTGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGACCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGACCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTTTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATTAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCTGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTAGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCA
>XR_005051979.1
TCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTTTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCTGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGACCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGACCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTTTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCACTAATGTGTTTATTAGGTCTAGTCTGTCTAATAAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCTGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTAGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCACTAATGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCAGTCCAGTGTGTTTATCAGGTCTAGTCTGTCTAATTAACCTCA

Function

NR:

description
mucin-1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005051978.1 False 2278 mRNA 0.39 3 543104 545704
XR_005051979.1 True 2210 mRNA 0.39 3 543422 545704

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964800 LOC105008036 coding upstream 467240 56073 ~ 77877 (+)
LOC118964799 isca1 coding upstream 494103 43896 ~ 52580 (+)
LOC110525134 NA coding downstream 6077 551781 ~ 554254 (+)
LOC118964804 NA coding downstream 9460 555164 ~ 555893 (+)
tars1 LOC106585996 coding downstream 18573 564277 ~ 602519 (+)
slc4a4a LOC101484802 coding downstream 229960 775664 ~ 1118589 (+)
LOC118964805 NA coding downstream 451325 997029 ~ 1002288 (+)
G464120 NA non-coding upstream 8711 533938 ~ 534393 (+)
G464092 NA non-coding upstream 88014 454317 ~ 455090 (+)
G463893 NA non-coding upstream 104182 438576 ~ 438922 (+)
G463894 NA non-coding upstream 104783 437649 ~ 438321 (+)
G463892 NA non-coding upstream 105941 436884 ~ 437163 (+)
G464067 NA non-coding downstream 21946 567650 ~ 570254 (+)
G464126 NA non-coding downstream 47623 593327 ~ 599273 (+)
G464132 NA non-coding downstream 60693 606397 ~ 608103 (+)
G464138 NA non-coding downstream 69416 615120 ~ 615541 (+)
G464154 NA non-coding downstream 97184 642888 ~ 643281 (+)
LOC110525138 rufy3 other upstream 84098 442716 ~ 549899 (+)
G463813 NA other upstream 274953 265409 ~ 268151 (+)
G464705 NA other downstream 683001 1228705 ~ 1229099 (+)
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zfr zfr other downstream 1854057 2342330 ~ 2451362 (+)
G465355 NA other downstream 1859415 2405119 ~ 2406090 (+)
LOC110525071 LOC106585963 other downstream 2259679 2743964 ~ 2866482 (+)

Expression


Co-expression Network