LOC110525345


Basic Information

Item Value
gene id LOC110525345
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 17526298 ~ 17534335 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005052029.1 False 4664 mRNA 0.43 4 17526298 17534335
XR_002473739.2 True 5199 mRNA 0.43 3 17526304 17534335

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110525341 LOC106585648 coding upstream 30161 17488588 ~ 17496137 (+)
LOC110525335 LOC106585645 coding upstream 113442 17360752 ~ 17412856 (+)
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LOC118964847 NA coding upstream 394998 17126955 ~ 17131300 (+)
dab2ipa LOC106585786 coding upstream 400286 17016096 ~ 17126012 (+)
LOC110525350 LOC106585656 coding downstream 102633 17636968 ~ 17643111 (+)
LOC110525352 LOC106585658 coding downstream 122731 17657066 ~ 17715306 (+)
LOC118964848 NA coding downstream 185174 17719509 ~ 17721149 (+)
LOC110525354 LOC106585663 coding downstream 204209 17738544 ~ 17764617 (+)
LOC110525357 LOC106585662 coding downstream 240351 17774686 ~ 17789072 (+)
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G480218 NA non-coding upstream 28799 17496957 ~ 17497499 (+)
G480244 LOC106585650 non-coding upstream 45464 17479515 ~ 17480834 (+)
G480230 LOC106585647 non-coding upstream 61145 17464534 ~ 17465153 (+)
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G480309 NA non-coding downstream 49118 17583453 ~ 17583685 (+)
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G480313 NA non-coding downstream 54578 17588913 ~ 17589136 (+)
G480318 NA non-coding downstream 62978 17597313 ~ 17597583 (+)
G480219 NA other upstream 80367 17444753 ~ 17445931 (+)
G480128 NA other upstream 205133 17320774 ~ 17321165 (+)
traf1 LOC106585784 other upstream 544078 16970834 ~ 16982251 (+)
G479239 NA other upstream 1166547 16359416 ~ 16359751 (+)
G480062 LOC106585661 other downstream 183535 17717870 ~ 17718201 (+)
LOC110525363 LOC106585667 other downstream 380425 17914750 ~ 17980989 (+)
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G481159 NA other downstream 800997 18335332 ~ 18340566 (+)

Expression


Co-expression Network