LOC110525555 (LOC106585499)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110525555
gene name LOC106585499
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 23757804 ~ 23779720 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
aspartate beta-hydroxylase domain-containing protein 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036979684.1 False 3742 mRNA 0.46 4 23757804 23772857
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XM_021605768.2 True 4022 mRNA 0.46 4 23757804 23779720

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110525554 LOC106585497 coding downstream 6966 23730000 ~ 23750838 (-)
LOC110525553 LOC106585496 coding downstream 28825 23718380 ~ 23728979 (-)
LOC110525552 LOC106585495 coding downstream 39974 23713875 ~ 23717830 (-)
LOC110525551 LOC106585494 coding downstream 47576 23706557 ~ 23710228 (-)
LOC110525548 LOC106585492 coding downstream 89436 23644995 ~ 23668368 (-)
LOC110525558 LOC106585502 coding upstream 35082 23814802 ~ 23832541 (-)
LOC110525220 anapc5 coding upstream 70290 23850010 ~ 23855515 (-)
LOC110525561 LOC106585505 coding upstream 108934 23888654 ~ 23911739 (-)
LOC110525564 NA coding upstream 136076 23915796 ~ 23918064 (-)
LOC110525565 LOC106585509 coding upstream 164166 23943886 ~ 23948503 (-)
G487553 NA non-coding downstream 28268 23729308 ~ 23729536 (-)
G487546 NA non-coding downstream 53545 23703534 ~ 23704259 (-)
G487538 hnf1a non-coding downstream 58289 23697218 ~ 23699515 (-)
G487620 NA non-coding upstream 60042 23839762 ~ 23839997 (-)
G487628 NA non-coding upstream 78142 23857862 ~ 23863007 (-)
G487650 NA non-coding upstream 134646 23914366 ~ 23915707 (-)
G487655 NA non-coding upstream 148172 23927892 ~ 23928124 (-)
G487656 NA non-coding upstream 149531 23929251 ~ 23929771 (-)
LOC110525180 hps4 other downstream 172250 23582127 ~ 23587892 (-)
G487016 NA other downstream 365742 23390017 ~ 23392062 (-)
G487022 bicdl1 other downstream 371897 23385534 ~ 23385907 (-)
G486953 NA other downstream 504443 23251286 ~ 23258106 (-)
G488386 NA other upstream 573813 24353533 ~ 24353823 (-)
LOC110525585 LOC106585524 other upstream 881177 24655788 ~ 24715090 (-)
G489038 NA other upstream 1326485 25106205 ~ 25106570 (-)
G489511 hmcn2 other upstream 1717243 25496963 ~ 25497489 (-)
LOC110525606 LOC106585545 other upstream 2499987 26271759 ~ 26283169 (-)

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