LOC110525621 (LOC106585565)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110525621
gene name LOC106585565
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 26608848 ~ 26711398 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021605905.2
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>TU557869
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021605905.2 False 9568 mRNA 0.43 3 26642261 26711398
TU557869 True 530 lncRNA 0.40 2 26608848 26648515

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110525620 LOC106585558 coding downstream 77931 26553538 ~ 26564330 (-)
LOC110525619 LOC106585557 coding downstream 92855 26481087 ~ 26551627 (-)
dpysl2a LOC106585556 coding downstream 111429 26502944 ~ 26530832 (-)
tmem230b LOC106585554 coding downstream 184378 26455731 ~ 26457883 (-)
igsf9b LOC106585552 coding downstream 186841 26404186 ~ 26455420 (-)
LOC110525622 NA coding upstream 2058 26713456 ~ 26724026 (-)
LOC110525623 cenpe coding upstream 14854 26726252 ~ 26732944 (-)
LOC110525624 LOC100380864 coding upstream 26881 26738279 ~ 26740643 (-)
LOC110525627 LOC106585561 coding upstream 116760 26828158 ~ 26876043 (-)
LOC118965120 NA coding upstream 165924 26877322 ~ 26877454 (-)
G490886 NA non-coding downstream 97675 26543490 ~ 26544586 (-)
G490621 NA non-coding downstream 173930 26467521 ~ 26468331 (-)
G490616 NA non-coding downstream 175982 26466002 ~ 26466279 (-)
G490517 NA non-coding downstream 252116 26389780 ~ 26390145 (-)
G490978 NA non-coding upstream 34844 26746242 ~ 26750563 (-)
G490982 NA non-coding upstream 44382 26755780 ~ 26818625 (-)
G491027 NA non-coding upstream 111495 26822893 ~ 26823157 (-)
G491417 LOC106585572 non-coding upstream 327646 27039044 ~ 27039874 (-)
G491475 LOC106585563 non-coding upstream 397976 27109374 ~ 27110138 (-)
LOC110525606 LOC106585545 other downstream 359092 26271759 ~ 26283169 (-)
G489511 hmcn2 other downstream 1144772 25496963 ~ 25497489 (-)
G489038 NA other downstream 1535691 25106205 ~ 25106570 (-)
G491291 NA other upstream 113469 26824867 ~ 26867158 (-)
G491539 NA other upstream 505209 27216607 ~ 27244193 (-)
LOC110525653 NA other upstream 1023598 27734995 ~ 27737024 (-)
LOC110525655 LOC106585601 other upstream 1115833 27827231 ~ 27885634 (-)
G494389 LOC106585296 other upstream 2699817 29411215 ~ 29415314 (-)
G490963 NA non-coding upstream 58587 26707102 ~ 26729484 (-)

Expression


Co-expression Network