mtx3 (mtx3)


Basic Information

Item Value
gene id mtx3
gene name mtx3
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 32485864 ~ 32507844 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036979926.1
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GCCCGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTCCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTCCCTGTGTGTTTCTGCTTTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTGCCTGTGTGTTTCTGCTCTAGCCCGGTCCCTGTGTGTTTCTGCTTTAGCCTTCCACATGGAAGCCATTAAGTGTTTTCTGACCAGCCACACGTTTCACTTCTGCACATGCACCATGAAATTTCTAATttctccttacctctctcccttcttttatGAAGGGAAGTATCAAAGGACAGTCAGAGGTGGTGCGGAGCCTGGAAAAGAGTCATGTAATTATGTTGGGAGTGAGATAATATATTTCCTTTGGAAAAAGAGAAGGCCTCAGCATAGTTCTGAGATTAGGTTTTAGATCAGGCCAGCTCTGCTAATAGTTGTTTATTAGAACATTTAAAGATGCTAAATACCAAGTATCAATGCTTACAGCCTAAAGTGGATCTAAAACCTTTTCTCTAACTTTTCCAACAAGCAATAAAACTATCAGTAGCCTGGGTGTCATTTTGTGTCTGTTTTAGCCAACTATAGCCATCAAATCTGGATATTCTTGAGAAAGGCTCAAGTTGATATGTGAAGAATAAAAAATGAACTCCACTA

Function

symbol description
mtx3 Predicted to be involved in mitochondrion organization. Predicted to act upstream of or within protein transport. Predicted to be located in mitochondrial outer membrane. Predicted to be part of SAM complex. Predicted to be active in cytoplasm. Orthologous to human MTX3 (metaxin 3).

NR:

description
PREDICTED: metaxin-3 isoform X3

GO:

id name namespace
GO:0006626 protein targeting to mitochondrion biological_process
GO:0005741 mitochondrial outer membrane cellular_component

KEGG:

id description
K17776 MTX; metaxin

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036979926.1 False 4076 mRNA 0.42 9 32485864 32506112
XM_036979927.1 False 4073 mRNA 0.42 9 32485864 32506112
XM_036979928.1 True 5828 mRNA 0.45 9 32485864 32507844

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
serinc5 LOC106585022 coding upstream 16692 32414385 ~ 32469172 (+)
cdk7 cdk7 coding upstream 76152 32403411 ~ 32409712 (+)
lnpep LOC106585016 coding upstream 235296 32232088 ~ 32250568 (+)
erap2 LOC106585017 coding upstream 261032 32211361 ~ 32224832 (+)
rgmb LOC106585015 coding upstream 284500 32188430 ~ 32201364 (+)
LOC110525781 LOC106585026 coding downstream 24921 32532765 ~ 32537679 (+)
LOC118965022 NA coding downstream 100592 32608436 ~ 32620481 (+)
LOC110525782 LOC106585028 coding downstream 139849 32647693 ~ 32667410 (+)
LOC110526889 NA coding downstream 159853 32667697 ~ 32668444 (+)
LOC118964860 NA coding downstream 167242 32675086 ~ 32684624 (+)
G497153 NA non-coding upstream 20452 32464030 ~ 32465412 (+)
G497146 NA non-coding upstream 41326 32441571 ~ 32444538 (+)
G497117 NA non-coding upstream 95046 32390569 ~ 32390818 (+)
G496505 setbp1 non-coding upstream 159904 32320513 ~ 32325960 (+)
G496500 NA non-coding upstream 179559 32305826 ~ 32306305 (+)
G497253 NA non-coding downstream 146127 32653971 ~ 32713205 (+)
G497402 NA non-coding downstream 430040 32937884 ~ 32938090 (+)
G497740 LOC106585045 non-coding downstream 581123 33088967 ~ 33103783 (+)
LOC110525799 LOC106585046 non-coding downstream 627479 33135282 ~ 33165186 (+)
G497749 NA non-coding downstream 672471 33180315 ~ 33183152 (+)
G495920 LOC106584987 other upstream 1173127 31294946 ~ 31312737 (+)
si:ch211-225b11.4 LOC106584980 other upstream 1475260 31006547 ~ 31022524 (+)
G495132 NA other upstream 1752974 30732352 ~ 30732890 (+)
G495076 LOC106585256 other upstream 1909108 30576105 ~ 30576756 (+)
4ebp2 LOC106585258 other upstream 1962481 30517976 ~ 30523383 (+)
polk polk other downstream 420074 32926258 ~ 32936958 (+)
c6h22orf39 cssa24h22orf39 other downstream 809793 33317578 ~ 33320353 (+)
LOC110525816 LOC106585060 other downstream 953791 33447246 ~ 33465055 (+)
G499111 NA other downstream 1643296 34151140 ~ 34151737 (+)

Expression


Co-expression Network