LOC110526054


Basic Information

Item Value
gene id LOC110526054
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 46935543 ~ 46978128 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XM_021606657.2
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>TU583581
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021606657.2 False 4424 mRNA 0.38 2 46957507 46978128
TU583581 True 1195 lncRNA 0.38 2 46935543 46978111

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964876 NA coding upstream 22225 46931084 ~ 46935277 (+)
rasgrf2b rasgrf2 coding upstream 57498 46722960 ~ 46900004 (+)
msh3 LOC106584876 coding upstream 248540 46574935 ~ 46708962 (+)
LOC110526049 LOC106570833 coding upstream 389867 46542604 ~ 46567635 (+)
LOC110526048 sec14l2 coding upstream 442746 46471484 ~ 46514756 (+)
LOC110526907 NA coding downstream 15468 46993596 ~ 47004352 (+)
si:dkey-88e18.2 il12b coding downstream 132684 47110812 ~ 47119011 (+)
LOC110526052 hic2 coding downstream 172772 47150900 ~ 47217434 (+)
LOC118964877 NA coding downstream 417239 47395367 ~ 47398426 (+)
LOC110526909 LOC106585521 coding downstream 443113 47421241 ~ 47424219 (+)
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G514440 NA non-coding upstream 42242 46914969 ~ 46915260 (+)
G514436 NA non-coding upstream 44648 46912602 ~ 46912854 (+)
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G514487 NA non-coding downstream 27713 47005841 ~ 47006197 (+)
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G514494 NA non-coding downstream 38859 47016987 ~ 47017236 (+)
G514464 NA other upstream 29788 46926842 ~ 46927714 (+)
G513745 NA other upstream 56379 46900561 ~ 46901123 (+)
G513501 NA other upstream 596917 46359956 ~ 46360585 (+)
LOC110526042 LOC106584891 other upstream 767210 46076084 ~ 46190292 (+)
G512912 NA other upstream 1321252 45635589 ~ 45636250 (+)
G514499 NA other downstream 44166 47022294 ~ 47023092 (+)
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G514665 NA other downstream 328310 47306438 ~ 47320050 (+)
LOC118964881 LOC106585521 other downstream 535658 47425001 ~ 47519480 (+)
G515069 NA other downstream 971878 47950006 ~ 47952254 (+)

Expression


Co-expression Network