LOC110526112 (LOC106587027)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110526112
gene name LOC106587027
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 50747281 ~ 50761069 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
chromaffin granule amine transporter-like isoform X1

GO:

id name namespace
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GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG:

id description
K08155 SLC18A1_2, VMAT; MFS transporter, DHA1 family, solute carrier family 18 (vesicular amine transporter), member 1/2

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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G516918 NA non-coding upstream 362224 50384006 ~ 50385057 (+)
G517068 NA non-coding downstream 1261 50762330 ~ 50763117 (+)
G517069 NA non-coding downstream 2647 50763716 ~ 50764117 (+)
G517101 NA non-coding downstream 11455 50772524 ~ 50773077 (+)
G517102 NA non-coding downstream 12277 50773346 ~ 50773606 (+)
G517108 NA non-coding downstream 20880 50781949 ~ 50782422 (+)
barhl1a barhl1 other upstream 995532 49748788 ~ 49753260 (+)
LOC118964898 LOC106585477 other upstream 1360069 49347319 ~ 49387212 (+)
G516011 NA other upstream 1440141 49305125 ~ 49307140 (+)
LOC110526066 LOC106584148 other upstream 1500828 49233579 ~ 49260632 (+)
LOC110493840 LOC106605670 other downstream 1517424 52277694 ~ 52279409 (+)
G519603 NA other downstream 1890871 52651940 ~ 52655297 (+)
G521552 prmt3 other downstream 3164873 53925942 ~ 53955130 (+)
G521914 NA other downstream 3508856 54269925 ~ 54270259 (+)

Expression


Co-expression Network