igdcc3 (LOC106562146)



Basic Information


Item Value
gene id igdcc3
gene name LOC106562146
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 63823887 ~ 63944930 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021607201.2
AGAAGTGTAGTTCGTGGTAAAAGCTACAACGTGGATATGTGTGTGAGGCAGCGGCTCTGGGATacagaggtatagaggagagagcacGAGATGCTGACAGATTCCTGATAGATGTGCAAAATGGCGCAAGCAAGTTCTACCCCTGCGAGCCACCAATTGTTGTAGCTCGGAACATGAAGAGCTAGCCGTATGTCTGTTTTCTTCTGATCGCCTCACGTTGTTTTTTCAAGTATCGTAATATATTTCAAAGTGATTAAATGGCTACCAGAAGGCTCTGCCTTGTTCCATGCATTTTTGGATTACTCCTCAACGCTTTAGTCGGTGTGACATCGGGAGCAGAGCTCTCCTTCACCCTGGAGCCCAGTGACATCATCGCGGTGCAGGAGCAGCCCCTAATGCTGCACTGTCAGGTGGACGGTATCCCACCAATCACCACGCAGTGGAGGAGGAATGGAATCCTCCTGGTGGATGACCAATACTACACCATGTTCCACAACGGCACTCTGCTGATTGGACGCTTCCAGAGGACCAAGTCTGATGGCTCAACTGATGAAGGGGATTATGAGTGCGTGGGCCAGAACTCCTTTGGTCTGGTGGTGAGCCGCAGGGCCAGGGTGCAGGCCGCCAcgATGGCAGAGTTCCATGTCCAGCCGCGGTCAGTGCGTGCGGAGGAGGCGGGCGTTGGGCGGTTCCAGTGCCAGATTCACGGCCTGCCTGAGCCTGCCATCAGCTGGGAGAAAGATGGCCGCTCCGTGGACACTAAGGATGAGAGGTATACCCTGCTCCCCACTGGTGTTCTGCAGATCACCGGTCTGCGTCAGGAGGATAGTGGTGTGTTCTGCTGTGTGGCCCACAACAGTGCAGGAGTAAAGCACAGTGCCGGGGCTCGCCTCACCGTCTCAGTCTCCCAGTCTTCTGTTTACAAAGAGCCCATGATCCTCGTGGGTCCTGAAAACCTCACTCTCACCGTTCACCAGACGGCCATCTTGGAATGTGTTGCTACAGGATATCCCCGCCCCATCGTGTCATGGAGCAGGCTTGatgGCCGTCCGATAGGTGTGGAGGGCATCCAAGTGCTGGGTACAGGGAACCTGATGATCACAGATGTCGGGGTCCAGCACTCTGGCGTCTACGTCTGCGCTGCCAACAAACCAGGGACCCGTGTACGCAGAACCGCTCAGGGACGTCTGGTGGTCCAAGCCCCAGCAGAGTTTGTGCAGCCTCCCCAGTCCATCTCCCGGCCGGTGGGCACCACTGCTATCTTCACCTGCCAGGCGCAGGGTGACCCTGTGCCAAAGCTCACCTGGCTGAAGAACGGCCAGATCCTGGAGCCTGGAGGGCACGTCAAACTCAGGAACAACAACACCACGCTGACCATCTATGGCATCAGTCAGGAGGACGAAGCCATCTACCAGTGCATCGCTGAGAACAGCGCCGGCTCCACCCAGGCCAGTGCCCGTCTCACCGTGCTGTGGGCAGACGGCCTGCCAGGGATGCCCAGTGTGGTGCGGGCCGAGGCCCTCTCACCCAACGCCATCCAGGTGTCCTGGAAGGAGTCTGCCCAGAACACTCAGGAGATCATCGGCTACGTGCTCCACATCCGCAGGACCACAGaCCCTGTGGAGATGGAGTACCAGGAAGCCGTCAGTAAGGTGACTCTACAGCAGGTCGTGGGTGATCTGGAGCCCTCCACCGGCTATACCTTCTATGTGAAGGCCTACACGTCCCGCGGAGCCAGCAAGCCCTCCGAGAGCGCCACCGAGAGCACACTGGGCGAAGtgccaGCACCCCCGTCACTGTTCATTAAATTGGTGAACAGCAGTGTGGTGCAGGCGGTGTGGGAGCCATCCTCTAAGATGGGCCAACATGAGGGCTTCAGGCTGTACTACAGGAGGGTCCACACCCCCCTCTTCACCGGACCACTCACCTTCACCCGCAACGTCACCCAGTACAACATCACCCAGCtggatCCAACCCTGGTGTATGAGATTAAGGTTCTGGCCTTCAACCAACACGGAGACGGCAACGCCACCATGCGCTTCGTCTCACTGAAGGAGGCTGTGGAGAAATCAGTGTTGAACACCCCCTGTGACTGTGTGAAGGATGAACAGAGCAAGACCTCTACAGCCGGCATCATCATCGGCATCCATATAGGAGTCACCTGCATCGTTTTCTGCGTGCTCTTCCTCATGTTCAGCTACAGGGGGAGGTTGATGACGTGTAAGACAGTGCAGGCCACCCCCCAGGTCGGGCGTAACATTTCCCTAGAATCGTCGTCCTCCTCCCAGGGGGCCCTGGCCTTAAACGGGGTGAGCAGGTCAGGCATGGAAGTGAACGGAAGCGTTGCTGGGAAGAGCAGGGGAGACAGTAACGagctggagagactcttctcagGCCCGTCCCACTGTGGAGACCTAGCTGACAGTTCACGCATGttgGATAGATCCCTGGTGTCCTGTGCGCTGAACGAGACCCAGTTGTCCACTCTGCCGTTGGATGACTTCAGCCTtgtggaggaggacagagagacgcAGTTCCAGAGGCCTCCAGCAGAGGGCCGGGGGGCCAGTGACAGGGCTGTGGCCGGGGTCACCCAGCAGGACCAGACCTGATAGAAGCATGAAGGTCAAGTCTGTGACACGGTCACAGTGTCACCTCAGACTCGTATCACACTCAGGTCGACCGAAGTATTTCTTTTCATATTCGTTTTTCTTTGTGCAAAGAATTGTATTATTGGTAAGTTAAATAAGTCGCTTTCTGGAAAAGTTATAGGGTCTTGGACTCGTTCTTGGAGGTCTCCCCGGCCTAGGTTTTTGGTGCGCTTTTGTGATGGACGGCTAGGTTTTTACCTTCGGCAGGTGAATGAtgtgttcttgttttttttttttacctccttCATTTCCTGGTTGCCGGCAGCACACGGAATAGATGTCCAGAATGTCTTTGTTATACACTCATCATTTTATCTCAGAatcaaatatgtttttatttctcTACTATCTCACTAAATGGTATTAAGTTATTGGCCTTATTTCTACTTTTTCTTTCCATGTCAAAGACTGCTGCCTCCTCTTAGCCTAGCAAGGATTCCACAAACGCATCCAACGAAGACTAAGGCCTTCTTCCAGTGATTTCATATAttctctgtctcaggactttTATTTTCAGTGAtatcgtttttttattttttttattagttCTCGGCCTTCATACAGGTTCTCTACTTTCTCTGTGAACCTTAGAATTCAACAAAAACCTACCTCAGCCGGAATGAATGTGACGTGGGAAACCTTTTGAATCCGTCTTTTCCCCTTGCGTTCAGTTACTTTTACATGTAGAGCGATCGGTTCGTAAAACACGAGAACAGGTGCCACGCTACCTCAGATGTCAAGAACCGTCGCTCTCCTGCTTGTCGAAAGccggaaaaaggagagagagaaaaaatctaACGGAAAAGCACTTCAAGAAAACGCTGAAGTCCACGTTCTACCTCAAGATAACAATGTTGTAGTTGTTCTTTCTTTCATAATGAAACATGTACTTCTGTTGTGAGAGCTCCTGGCTTCCCTCCGTCGATGAATTGCTGTTTGTGGATATGTCAGTACCTCATGCAAGTTGACAGATGATATTGTTGTATGTATTCTACTTGTAAAGACATTTTTCAGCGTTTTCCATCGTGTTTGTCTGAGatattttgtctttgtttttaTTTGAATCTTAGTTGCTTCTGTTGATTGAAAAGACTGTTAGCGATGCACTGCACAGCCACTAATCATTTCAGGACAGTTTTACTGCTATGTGAGAACTGCTGCAAATATTCCATTGGGCAGGTGAGGATTTAGTTACATTTACACTCGATTGAGACATACATTATATGTGTATTTATGAATGATTGCGTGACGGAACTgtatgtgtgcgcgcgtgcgtacttgtctgcctgcctgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtttttgtgtgtgtacgcTAGATACCGAGTGAATGTGATGTATAAAGAAAATGAAGCACAAATGTATCACAATGTCATTCTAGGCGTTGACAACCACAAATGTTAATGTATCTGATATGATACCAGGTAATTGGCTCTTTAATTGACAATAGAGTCGTTCTAATCTGATTTTTGGCCTGCCTGTCACTCACTCGAAGCTGTGGCACAGTGCACTCCTTTGTTATATTTAATCAgggctcaaatcaaatcaattcccTTCTGTCATAAAGGAATAGCCCAGACTTCTCGGGCCTGTCCATCCCagatccctcactccatccctcctccacacTGACAAATGAAAGTGCTTCAGGAAAACCTTTATCACACTGCTGCATGTAAATCCAGAGGGAGATGGTTTAACAGGTGGACCACAGCTATTAACTCACAGGTCTGAGTTCAGTGTGCTCATGCTGTCATCTTCCTGAGCAAACACACAGTCAACTTGATGTTATTAGACTTGGATCTGATCCAGGGTCAGATCTGGGACCACTGCTCCACCTGTTCCTCCAGAACCATGCTCTCTGGAGCTGGAGCTTCCCTGAGGCAGAGCCAACCTGAGCCAGGCCAGTACTCTTACGGTAGCCTGGGTTAGGGCCGCTGTCCGACGGACCCCCTGTCttctccctggctctctcttctGTAGAGATAGATCCCCTATGAACTCTATGCTCTCTACTGTGTCTCAGTCACGTAATGGCCTAAAGCAGTATTACTCTGGTACCTACCTCAACCCCGACACGACAGGCCTGCTCTCAGGTTGCTCCTTCTCACACTTCTATATGTGCATAaatatacaccacacacacacacacaaacgtaatgacacacacactcctagGGAAGGGAGGATGTCTTCAGGGCCTTGTGGTAGTGCATTTGTGTGACAGAAAAACAGTTGTTTTTGTCTTTATGCTTAGCTTTTGTGGATGTGAATGTATCACAAttgtttttattacatttttgttgTATCAGAAGCTTTTACGTTTTTGTTTTTCCA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>TU604146
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>TU604147
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>TU604148
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Function


NR:

description
PREDICTED: immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021607201.2 False 9473 mRNA 0.46 14 63823887 63944930
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TU604148 True 200 lncRNA 0.38 1 63830093 63830292

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
cilp LOC106587239 coding downstream 50822 63764660 ~ 63773065 (-)
terb2 terb2 coding downstream 485946 63334916 ~ 63337941 (-)
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LOC110526941 LOC106562155 coding downstream 583234 63235956 ~ 63240653 (-)
LOC110526314 LOC100196237 coding downstream 588604 63224573 ~ 63235283 (-)
igdcc4 LOC106587237 coding upstream 8103 63953033 ~ 64013404 (-)
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LOC110526336 LOC106562141 coding upstream 472934 64417864 ~ 64492865 (-)
LOC110526338 LOC106587230 coding upstream 564813 64509743 ~ 64642634 (-)
LOC110526341 LOC106562136 coding upstream 752274 64697204 ~ 64715114 (-)
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G533325 NA non-coding downstream 36101 63787584 ~ 63787786 (-)
G533317 NA non-coding downstream 40613 63783063 ~ 63783274 (-)
G533637 NA non-coding upstream 142334 64087264 ~ 64087490 (-)
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G533667 NA non-coding upstream 165154 64110084 ~ 64110373 (-)
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G532763 NA other downstream 971070 62851696 ~ 62852817 (-)
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G534201 NA other upstream 553523 64498453 ~ 64499614 (-)
G534349 NA other upstream 633868 64578798 ~ 64614796 (-)
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G536183 NA other upstream 2317556 66262486 ~ 66276289 (-)
G533512 NA non-coding upstream 63185 63893477 ~ 63898023 (-)
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igdcc3 LOC106562146 other downstream 3003 63823887 ~ 63944930 (-)

Expression



Co-expression Network