LOC110526363 (LOC106587208)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110526363
gene name LOC106587208
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 65441092 ~ 65521598 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021607268.2
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>XM_021607267.2
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Function

NR:

description
AT-rich interactive domain-containing protein 3B-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0003677 DNA binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021607268.2 False 6660 mRNA 0.46 9 65441092 65521598
XM_021607267.2 True 6698 mRNA 0.46 10 65441096 65521598

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110526360 LOC106587210 coding upstream 194 65434411 ~ 65440976 (+)
LOC110526359 LOC106587211 coding upstream 10692 65414289 ~ 65430400 (+)
LOC110526358 LOC106587209 coding upstream 33817 65403608 ~ 65407275 (+)
LOC110526357 LOC106587212 coding upstream 72515 65193659 ~ 65368577 (+)
LOC110526356 LOC106587213 coding upstream 262208 65065380 ~ 65178884 (+)
LOC110526364 LOC106587206 coding downstream 53471 65575069 ~ 65580465 (+)
LOC110526366 LOC106587204 coding downstream 247185 65768783 ~ 65771390 (+)
LOC110526368 LOC106587203 coding downstream 253189 65774787 ~ 65792680 (+)
LOC110526370 LOC106562103 coding downstream 312161 65833759 ~ 65843569 (+)
LOC110526373 LOC106587200 coding downstream 426821 65948419 ~ 66035381 (+)
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G534870 NA non-coding upstream 64711 65375571 ~ 65376381 (+)
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G534982 NA non-coding downstream 62674 65584272 ~ 65584519 (+)
G534984 NA non-coding downstream 64597 65586195 ~ 65586907 (+)
G535020 NA non-coding downstream 114060 65635658 ~ 65642430 (+)
G535118 NA non-coding downstream 274436 65796034 ~ 65797422 (+)
G535155 NA non-coding downstream 302771 65824369 ~ 65824684 (+)
G534653 NA other upstream 323136 65113280 ~ 65169563 (+)
G534453 NA other upstream 593988 64790322 ~ 64847104 (+)
LOC110526344 LOC106587225 other upstream 664756 64769099 ~ 64781704 (+)
LOC100750227 LOC106587244 other upstream 2101594 63338236 ~ 63549030 (+)
G535150 LOC106587155 other downstream 326025 65847623 ~ 65849441 (+)
G536406 NA other downstream 1081187 66602785 ~ 66604053 (+)
G536995 zfhx3 other downstream 1491622 67013220 ~ 67018653 (+)
G537029 zfhx3 other downstream 1582708 67104306 ~ 67104908 (+)
G537032 LOC106587324 other downstream 1588078 67109676 ~ 67110628 (+)

Expression


Co-expression Network