LOC110526484 (LOC106587367)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110526484
gene name LOC106587367
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 70049150 ~ 70058063 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036980865.1
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>XM_036980866.1
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>TU611516
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU611516 True 968 lncRNA 0.39 1 70056061 70057028

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110525047 psf2 coding upstream 10693 70036194 ~ 70039507 (+)
emc8 LOC106587369 coding upstream 20221 70026162 ~ 70028929 (+)
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LOC110526477 mthfsd coding upstream 316494 69724498 ~ 69732656 (+)
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LOC110526485 fam92b coding downstream 493700 70551763 ~ 70558098 (+)
si:ch73-103b9.2 cssa26h16orf46 coding downstream 536684 70594747 ~ 70599188 (+)
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LOC110526495 LOC106587464 coding downstream 1623538 71681601 ~ 71690360 (+)
LOC118964930 NA coding downstream 1903861 71961924 ~ 71967802 (+)
G539980 NA non-coding upstream 2018 70046813 ~ 70047132 (+)
G539959 NA non-coding upstream 32020 70015270 ~ 70019477 (+)
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G539925 NA non-coding upstream 73852 69975094 ~ 69975298 (+)
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G540017 NA non-coding downstream 46592 70104655 ~ 70106006 (+)
G539068 NA other upstream 681508 69361641 ~ 69367642 (+)
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G538877 LOC106582599 other upstream 1046322 68996083 ~ 69002828 (+)
G540179 NA other downstream 423887 70481950 ~ 70484368 (+)
G541903 NA other downstream 1741977 71800040 ~ 71804462 (+)
G542053 NA other downstream 2043317 72101380 ~ 72102474 (+)
G539985 NA non-coding upstream 1565 70054217 ~ 70054496 (+)

Expression



Co-expression Network