LOC110526613 (LOC106587615)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110526613
gene name LOC106587615
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 77723825 ~ 77730489 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021607726.2
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>XM_021607725.2
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>XM_021607724.2
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Function


NR:

description
iroquois-class homeodomain protein IRX-6-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K24889 IRX; iroquois-class homeodomain protein IRX

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021607724.2 True 4299 mRNA 0.45 7 77723826 77730488

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
irx5a irx5 coding upstream 224392 77495753 ~ 77499433 (+)
LOC110526968 fto coding upstream 685430 76827001 ~ 77038395 (+)
LOC118964933 chd9 coding upstream 1103704 76604690 ~ 76620121 (+)
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nod2 nod2 coding upstream 1958534 75752937 ~ 75765291 (+)
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LOC118965105 NA coding downstream 232760 77963249 ~ 77963303 (+)
LOC110526617 LOC106562414 coding downstream 237678 77968167 ~ 78042147 (+)
LOC110525051 LOC106587608 coding downstream 356727 78087216 ~ 78088746 (+)
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G548317 NA non-coding upstream 72627 77650995 ~ 77651198 (+)
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G548024 NA non-coding upstream 175438 77546357 ~ 77548387 (+)
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G548466 NA non-coding downstream 96737 77827226 ~ 77827884 (+)
G548000 NA other upstream 200402 77512609 ~ 77523423 (+)
G547884 NA other upstream 444471 77277992 ~ 77279354 (+)
G546464 LOC106562315 other upstream 1753151 75928228 ~ 75970674 (+)
G545601 NA other upstream 2301073 75421861 ~ 75422752 (+)
G548703 NA other downstream 690371 78420860 ~ 78496470 (+)
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G549345 NA other downstream 1041623 78772112 ~ 78772557 (+)

Expression



Co-expression Network