LOC110526615 (pcat2)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110526615
gene name pcat2
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 77848962 ~ 77866316 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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>XR_002473981.2
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>TU620987
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>TU620990
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>TU620991
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>TU620994
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Function


NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU620994 True 1524 lncRNA 0.40 2 77864284 77865868

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110526613 LOC106587615 coding upstream 118473 77723825 ~ 77730489 (+)
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LOC118965105 NA coding downstream 96933 77963249 ~ 77963303 (+)
LOC110526617 LOC106562414 coding downstream 101851 77968167 ~ 78042147 (+)
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LOC110526620 lt4r1 coding downstream 222591 78088907 ~ 78090301 (+)
LOC110526621 LOC106587617 coding downstream 237579 78103895 ~ 78127426 (+)
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G547884 NA other upstream 569608 77277992 ~ 77279354 (+)
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G548703 NA other downstream 554544 78420860 ~ 78496470 (+)
G549342 NA other downstream 902940 78769256 ~ 78769907 (+)
G549345 NA other downstream 905796 78772112 ~ 78772557 (+)
LOC110526645 unc13c other downstream 1285048 79089592 ~ 79354959 (+)
G550054 NA other downstream 1613165 79479481 ~ 79480078 (+)
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Expression



Co-expression Network