G463671


Basic Information

Item Value
gene id G463671
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 20723 ~ 41646 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU526299
tactgtctctatctctcttttatattatgacagaccagctagatctactgactctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacataccagttagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccgtctcaatgtctccattatattatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgaccgaccagcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccatcaagatcaattaaaatcaaatcaaatgtatttatatagccctttgtacatcagctgatatctcaaagtgctgtacagaaacccagcctaaaaccccaaacagcaagcaatgcaggtgtagaagcacggtggctaggaaaaactccctagaaaggccaaaacctaggaagaaacctagagaggaaccaggatatgtggggtggccagtcctcttctggctgtgctgggtggagattataacagaacatggccaagatgttcaaatgttcataaatgaccagcat
>TU526298
tcagctaaatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctccattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattataatatgtcagaccagctaaatatactgtctctatctctcttttatattaagacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatttactgtctctatctctcttttatattatgacagaccagcgagatctactgtctctattatattatgacagaccagctataactactgtttctattgtattatgacagaccagcgagatctactgtctctattgtattatgacagaccagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgtcagaccagctacatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctacatctactgtctctataatattatgacagaccagctagatctactgtctctgtgtctccattattttatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgGCCAACCAGcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccgtctcaatgtctccattatattatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgaccgaccagcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccatcaagatcaattaaaatcaaatcaaatgtatttatatagccctttgtacatcagctgatatctcaaagtgctgtacagaaacccagcctaaaaccccaaacagcaagcaatgcaggtgtagaagcacggtggctaggaaaaactccctagaaaggccaaaacctaggaagaaacctagagaggaaccaggatatgtggggtggccagtcctcttctggctgtgctgggtggagattataacagaacatggccaagatgttcaaatgttcataaatgaccagcat
>TU526300
ctattatattttgacagacaagctagatctactgtctctattatattaagacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctataatattatgaaggaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattacaatatgacagagcagctagatctactgtcgctattatattatgaagtaccagctagatctactgtctgtattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaagtaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttactgtctctattatattatgaaggaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagagctactttctctattacaatatgacagaccaactagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctccattctattatgacagaccagctagatcttctttctcttttataatatgacagaccagcctgaactactgtctctattaaattatgacagaccagctagagctactgtctccattatattatgacagaccagctagatcttctttCTCTttgataatatgacagaccagcctgaactactgtctctattatattatgacagaccagatagagctactgtctctattacaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagtcgagctagatctactctctttaatatattatgacagaccagctagatctactgtctctgttatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttacagtctctattatattatgaaggaccagcttgatctattgtctctattatattatgacaaaccagctagagctactgtctctattacaatatgacagacgagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactctctttattatattatgacagaccagctacatctactgtctctatgtctccattatattatgacagacaagctagatcttctttctcttttataatatgacagaccagcctgaactactgtctctattatattatgacagatcagctagagctactgtctctattacaatatgacagaccagctacatctactgtctctattatattatgacagaccagttagatctactgtctctattatcttatgtcagaccaggtagatctactatctctattatattatgaaagaccagctagaactactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactctctttattatattatgacagaccagctacatctactgtctctataatattatgaaggaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattacaatatgacagagcagctagatctactgtcgctattatattatgaagtaccagctagatctactgtctgtattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaagtaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttactgtctctattatattatgaaggaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagagctactttctctattacaatatgacagaccaactagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctatgtctccattctattatgacagaccagctagatcttctttctcttttataatatgacagaccagcctgaactactgtctctattaaattatgacagaccagctagagctactgtctctattacaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattaggacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagttctactgtctctattatattaggacataccagctaaatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccaggtagatctactatctctattatattatgacagacctgctagatctactgtctctattatattatgacacaccagctatatctactgtctgtattatattatgtcagaccagctacatatactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagttagatctactgtctctattatcttatgtcagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagaattacagtctctattatattatgaaggaccagcttgatctattgtctctattatattatgacaaaccagctagagctactgtctctattacaatatgacagacgagctagatctactgtctctattatattatgacacaccagctatatctactgtctctattatattatgtcagaccagctacatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctacatctactgtctctataatattatgacagaccagctagatctactgtctctgtgtctctattattttatgagagaccagctagatcttatttctcttttataatatgGCCGACCAGCCTGAACTGAgcctctactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctaaaatattatgacagaccagctatatctactgtctctattatattatgaaggaccagctagatctactgtctatatgtctccattatattatgacagaccagctagatctactgtctccattacaatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactctctttcttatattatgacagaccagctacatctactgtctctataatattatgaaggaccagctagatctattgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattacaatatgacagagcagctagatctactgtctctattatattatgaagtaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgaagtaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttactgtctctattatattatgaaggaccagctagatctattgtctctattatattatgacagactagctagagctactgtctctattacaatatgacagaccaactagatctactgtctctattatattaggacataccagctagatctactgtctctatgtctccattctattatgacagaccagctagatcttctttctcttttataatatgacagaccagcctgaactactgtctctattaaattatgacagaccagctagagctactgtctctattatattatgaaggaacagctagatctactgtctctattataatatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgtcagaccagctacatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctacatctactgtctctataatattatgacagaccagctagatctactgtctctgtgtctccattattttatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgGCCAACCAGcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccgtctcaatgtctccattatattatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgaccgaccagcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccatcaagatcaattaaaatcaaatcaaatgtatttatatagccctttgtacatcagctgatatctcaaagtgctgtacagaaacccagcctaaaaccccaaacagcaagcaatgcaggtgtagaagcacggtggctaggaaaaactccctagaaaggccaaaacctaggaagaaacctagagaggaaccaggatatgtggggtggccagtcctcttctggctgtgctgggtggagattataacagaacatggccaagatgttcaaatgttcataaatgaccagcat
>TU526301
ctattatattttgacagacaagctagatctactgtctctattatattaagacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctcatattatgacagaccaaatagaactactgtctctattatattgtgacagaccagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattaggacataccatctagatctactgtctctataatattatgaaagaccagctagatctactgtctctattatattaagacagaccagctagatttactgtctctataattttatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatttactgcctctattatattatgaaggaccagctagatctagtgtctctattatattatgacagaccagctagagctactgtctctattatattgtgctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactctctttattatattatgacagaccagctacatctactgtctctatgtctccattatattatgacagacaagctagatcttctttctcttttataatatgacagaccagcctgaactactgtctctattat
>TU526302
ctattatattttgacagacaagctagatctactgtctctattatattaagacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatctgctgtctctattatattatgacagaccagctagatctaatgtctctattatattatgacagaccagctagatttactgtctctatctctcttttatattatgacagaccagcgagatctactgtctctattatattatgacagaccagctataactactgtttctattgtattatgacagaccagctatatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgtcagaccagctacatctactgtctctattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctacatctactgtctctataatattatgacagaccagctagatctactgtctctgtgtctccattattttatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgGCCAACCAGcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattttgacagaccagctagatctactgtctttattatattatgacaaaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctaccgtctcaatgtctccattatattatgacagaccagctagatcttatttctcttttataatatgaccgaccagcctgaactactgtctctattatattatgacataccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccagctagatctactgtctctattatattatgacagaccatcaagatcaattaaaatcaaatcaaatgtatttatatagccctttgtacatcagctgatatctcaaagtgctgtacagaaacccagcctaaaaccccaaacagcaagcaatgcaggtgtagaagcatggtggctaggaaaatctccctagaaaggccaaaacctaggaagaaacctagagcggaaccaggctatgaggggtggccagtcctcttctggctgtgccgggtggagattataacagaacatggccaagatgttcaaatgttcataaatgaccagcatggtcgaataataataaggcagaacagttgaaactggagcagcagcacggccaggtggactggggacagcaaggagtcatcatgtcaggtagtcctgatgcatgg

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU526299 False 884 lncRNA 0.37 3 20723 41542
TU526298 False 1355 lncRNA 0.37 3 21201 41542
TU526300 False 5076 lncRNA 0.35 6 23102 41542
TU526301 False 853 lncRNA 0.34 3 23102 27390
TU526302 True 1395 lncRNA 0.38 3 23102 41646

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118964799 isca1 coding downstream 2250 43896 ~ 52580 (+)
LOC118964800 LOC105008036 coding downstream 14427 56073 ~ 77877 (+)
LOC110525138 rufy3 coding downstream 401070 442716 ~ 549899 (+)
LOC118964801 NA coding downstream 501458 543104 ~ 545704 (+)
LOC110525134 NA coding downstream 510135 551781 ~ 554254 (+)
G463724 NA non-coding downstream 47282 88928 ~ 90024 (+)
G463732 NA non-coding downstream 61325 102971 ~ 103720 (+)
G463786 NA non-coding downstream 167720 209366 ~ 210014 (+)
G463813 NA other downstream 223763 265409 ~ 268151 (+)
G464705 NA other downstream 1187059 1228705 ~ 1229099 (+)
G465203 NA other downstream 2020682 2062328 ~ 2064067 (+)

Expression


Co-expression Network