XLOC_024051 (zgc:101783)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024051
gene name zgc:101783
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 19733704 ~ 19752145 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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>TCONS_00047729
cacatgaAGAATGACCGGGACACCAATAAGTATGATGGATGGCCAGAAATGATAGAGATGGAAGGTTGCATACCAAGATTACGCTGATTTTCCTACTGCACCAAAGAACAGTTGCTTGTCACTTTTAAATCTGCCACTGGAAGCTATTTTGCCATCTTTGGGTATCATTTCCCCCAACCCCAATGATGTAATTAAAAACATGCGTGTGCATTGGTTTGGATACCAATATATGGGAATATGTACTGAGAAACTTGTACTTGAGTGTGAGACGcttttgatataaaaataaaaaattcatcatatttaacgttttttttttcctaaaaattTAATTATACAGGCATTttagttctgtgtgtgtgtttttgttaaaaggtggTAGTAGCCTACAACAGGGGTTAAAAACCTTTTTGATCCAAAGTATTAAGTGGCCATTATCAGTATTTTCGAATGCAAagtggcaaaaataaaaatatgtgatgTCTTTTGTGACTTTTGTTGGACAGACTGTCTTCTAAAGATTTGTTTTAGTTGATGCACAACAATTATAGATAATGATgatgtatattatataattaagttaattatgctttttttaatccctgggtgttttattttaaaaatcatcgCCAGTTTAATGAGTACAGTTGAAACTAATGCTGTTATCTCTATGTGGTTTATGATGCTGTTGTAGTATAGTTTGTATGCCTCataaaacatttcagatgtttagcATTTAGTATTTGAACGGGTTAAAAtcaaaatgaattaattacattttgctaGTTATGATTATGACTTAAATCATGGtaaagaaatattattttttatgaccAAACAACTTGCAACGTGCCAAATCGAAAGCATACATCGCACGCTTGCGTAAACTGTGCGCAGCGTTGATCTGCAAACGACACGAAGCCACTCCCATCACTTCAACGCAGTAATGCACCGCGTCAAGTCATGGACCAAAATGATAATGACCTTCAGGGAACTGATGGTTCTGGATCACTTGGAGGTCTTGATGTTCGCAGACAGATCCCAATCAAGTTACTGTCTAAACAGACAATGAGAGGCAAACCACCTGCCCAACCTCAGCGTCCAGCCACCAGACTGCCCTCAAAGAGAGAGGAAGAGCCTTTCAGATATAAACAGGAGGAAAGATTTGAGTGTAAATCAGGTGATGCATATGGAAGCCATCGCAGATTCCCTCATCCAATCTTCTGGGATTATAAGCTCAACTTGGTTGGAGTAAAAGATGACACTCCAGTCCATTTCTGCGACAAGTGTGGCCTGCCCATAAAGATTTATGGGCGAATGATCCCCTGTAAACATGTTTTCTGCTATGACTGTGCAGTGTATTACGAGAAGAAGTGTGACAAAATGTGCCCTGGTTTGTCCCTGTACAGCTGCACAGACCCAGTCCAGCGCATCGAGCAGTGCCAGCGTGGCTCTCTCTTCATGTGCAACATTGTGCAAGGCTGCAAACGCACCTACCTCTCACAGCGAGACCTGCAGGCCCACATCAACCATCGCCACATGAAGGCCAGCAAGACCGAAAGTTCTCGCCCAGATCCATCACTATGGGGCTCCGACCCATCAGACCGCTTCCGGTTACCACCACCTCCACATTTGACTAAATCACACCCTCTCATTCCTCCTCCACTGCAAGGCCACGATGCCTTCAACCATCCACCTCCAGCTTCACCCTCCGATTTGGGTCCTTCCCCACGATCCCTTCCCCCAGAAACCTTCCGGATTGCCACATTGTCTACACGCAAACATAGCAACCTCATCACAGTGCCCATTCATGATGACTCAGGAAGCTCAGGCCTCTTGCACCCACATACACCCCCTGGCCCACCTCCACACCATCACTCTGGTGATTACCCCAGCCAACCGGTGGTTTCTCACCCACATCACATTATGCCTCCACTACAACAACCACATTACGGGCCTCCGCCACCTCCACCACCCCCTCTAAGCATCCCGATGCAACACCCGCCACAGGGCTCTGCCACACCTCACATGATTTACAACCAACCACCTCCAATGTCAACACCCCCTCCACCCGGACACATCATCAGCCCAATGCCACCATTTATGAACCACCCTCCACCTGGTCCCATTCCCCCAGTCAGTCCACACCACTACAACCCAAACTCAATGCCACAGGACCAAGGCACACTAAGCCCACCTTTTTCCCAACCAGGCGGCATGAGCCCAGGAATTTGGCCCAATCCACGTGGGCCCCATCAGCCCTGTATGCAAGGGCCACCACCACAGGGACAAAGGCCAGGGCCTCACCACCCAGAACAGTCACGATATAGACCATATTACCAGTAGAATGTGCCACAGTCACAGTTTGAGTGCACAAAGTATCGTTTCTGGTTGGATATGGTCAACCTGGCCATGTGTGTTTGATGATAACGTGATATAATCACCGTTGCTGGTGCTTTTTGTACTAGTGTCCCTCATTCAGGGCAGTTCCATTGAATTAAAAAGAACTATTACTTGAATGGAAAAAAATAGACTTTGTTTGGAATAATTTATCATGGTTTTGTTTGAAACATTTACATAATGTTGTACCCAACGACTGCAATAAATTAAACTTGAACATATGAGCTTTATATAAATTTTGatttaaatgttgttatttttgaGCACAGAGATAAACTAGTTAAAGGGTTAGCTCATCTGAAAATGACATTTCTGTTAATTAGTGGTGTAACCGATCAGAAATCTCACGGTTCCAAACACATTATGGTTTTTTAATCACGGATCAGACCATTTTGCGCATCACACAAAAAGGTGTGGAGACAAATGTAATatgcttttcatttattacaaaatcagtactgcaagacacttctggatttaacaaacagaacttagaacgtTGTTAAATATATATGACAATGATTTTAATGTTTACCGCAAACATCAgcggttttatctaaactattaaCTGTTAtgccagtacttctgtgttatttaactGTTTGTACCTCAttataactaactcaaaagactaaagtctCTATCTTAGGATGAATAAACGTATGCAAAAAcctataatttatcatttatgttgcgtgggtgttgagatcccgatcttttaatgattaatcgtgcagcttaaaCTAAATGCATTAACGCAGGCTAAACAAATAGGGACTGAAAACGCCTTTAAGGAAACCCACTACTTCCCCACTActaacccaccacaacttcttcagtcatcattatattttacaggacaGCCTagatgctttcatacatgtgatttgaacaTGAGAGGCAATCTCTCTCTGTGATTCTTACAAATAGGATTAATCTAccagtaaaacaaaaaattaacctGTTGGCCACGTTTGTTTCGAACCGTAGGTTGTGATCCGTATTTTTCACAGATCAACCGTGATCCTTTACACCCCAACTGTTAAGTATCCTTCACCCTCTTGCCATTTAAATCCCCTGAGATCGATCAAAATGCAAATGAAGATTTTGTAGTTAAAATCCTAAAGCTCCCTCCTCCATATGCAGCAACTGTTAGTTAGAAGATGTTCATAGTCCAGAAAAAGAGCCAAAAACATCGTCAACAATCCATGAGACTTAATCATAACTCCAGGAACACTTTTGAGtgtcacaaaaatgtaaaaacaacttAGTTTGCCAGTGTTTTCTCTTCCTTGTCAGGTCCTAGTGTGTTTACTACGTAGAATATGATGCTTGTGTGTAATGCTGCGGACTTTAACGTGTCATATTGCTTTTAGTTAACAAATACACTGATGATCTAATGAggataataaaacaacaaaacaatggaAAGTTTTTTGTTGCATAAAAGTGTTTTCAGAACTTGTATTACAGTTCAACTACTGAAGACACATGGGATGTTTTCAcaatgttttggtttgttttctggactttaaactGCTCTGGACTGTTGCTGTATATGAAAAATCAGAAAGCTGCAATTAAGCAATCTTAATTGTCTTAATCTGTGTTTTAAAGATTATCAGTGGTTTTAGGGAATTGAAACATTGGTTGATATAGATCATTTTGagggtaaacaaaaacaatatttccaacatatttcctttttaatattttaaatttttatagttttcgagaatccaaaaagagtcaTATTGatcaataatgttatgatagctgttttaacatgaagttatgaATGAACTCTCTATTGTTACAGTTCTGAAAtggtttgataacaagcagaacATGttcaatgacatcaccacattgaaattgtCTAAACAGGctataatgtatataaaatttataatgtattgtttttatgtgAACTGCAGCCAGCATTATTTGTGCTAGCATTTATGCACACTGTTCGTAATGCACAAGAATGTGATTCAGAGCTACAGTACTATATACTCACAGTAAAGTTCTTTAATTAGTAGTAAAAAAGAGAAGTTGGAAATACCTTTGCAAGGATATTCTGATAATGAACAATTGAATATCCGAGTGCTGTCCACCCTGCTGAGAGTGAAGTTAAGATGAATGTACTGTAAATACGCCCACAcacataaaataaacacacacatattgtgTTGATACGGATAAGTTTGCACAAGCTCTGCAGTTCATCACGTAGAGAGATAAGGCAATTAAAATTACGcttataatagtttaattatttgaGACTGTAGGTCTGGCTATGTGTGAGGCTACGGTTTGATTTATTTAAGTTCATTCTAGAACACATTAATAATGCTCTTTATTGACTTAAATGTATAGTACTCAATATGAACTCTTTAACCATTATTATTAAATTCATGTGTTGAAGAATGAAAAAGTAAATATCGTGTTTTTATTATCCTATAAAATGTAATCTTTAACAGAACTTAGAAAGTTGTGGaagatctattttttttttttttttttgataaacagatgataaacattaatggatgaaattttcatttattcaccTTCATGCCACTCCAGCTTTCCATgac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Function

symbol description
zgc:101783 Predicted to enable ubiquitin protein ligase activity. Predicted to be involved in protein ubiquitination and regulation of cell adhesion. Predicted to act upstream of or within negative regulation of gluconeogenesis. Predicted to be located in extracellular region and membrane. Predicted to be integral component of membrane.

GO:

id name namespace
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GO:0061630 ubiquitin protein ligase activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040912-48 Predicted to enable ubiquitin protein ligase activity. Predicted to be involved in protein ubiquitination and regulation of cell adhesion. Predicted to act upstream of or within negative regulation of gluconeogenesis. Predicted to be located in extracellular region and membrane. Predicted to be integral component of membrane.

Ensembl:

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RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024050 mxd coding upstream 2449 19718504 ~ 19731255 (+)
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XLOC_024047 zgc:113426 coding upstream 53571 19670273 ~ 19680133 (+)
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Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location