XLOC_024137 (BX544877.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024137
gene name BX544877.2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 25310063 ~ 25315481 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00047863
aacacaCCCTCAGCtcataagatcaagacactacaAATTGGGGAGCCAAGATGGCAGCGGAGTGAATGGTCACGTTTTTTAGCGCTTAGGTACTACGAGGAGTTTTAAAGTTAACAAAATGGTTATTTTGCATGTAGAATCTTAAATTTTGAAAGTGTATGTGTTCCTGAATATTTTTAACGGACATTTTTAATTTCTGACGTGacaatggggaaaaaaagaaagaatcagTCCCTTCAGGAAAGTGCTATATTGGCTGGATACCTCGTGGAAGAAGGGGACATGGAGTCTGCAAACTTGGAAAATATCGATCTTGAGACAGAAATTGGTGCCAATGAAGAGGTTTTTGCAAAGCCTATTTGTTCTACTCCATCCAAGAATCATACGAGATCAAAAGGTACGGATGAAATATCCTTATCTACACTCCTTGACGCGATTCAGAAGCTAACCGCTAAAATGGATGAAACGCACGACAAAGTGATTTCCATTGACAATACGGTCGCAGTCTCCTGTGAAAAACTAGATAAATTGTCTGAAAAAGTCTCCCACATGAGTGAAGAGATCAAGACGCATGGCGTTAAAATAGCTCTAATTGAGAAGGAGAATAAAGAATTGCGGGCAGAAAATCTACGTCTAAAAGAGAACTTTGACGAAATGCAGCGCTACTCCCGGCGATGGAATCTTAAGTTACAAGGGGTTCCAGAGCGCGACGGAGAAGACACGAGAAGTGTGACGATCAGCATCCTGAAACAGGTGGTCCCTGGCATACAAGACAAGATGGAAGATGTAATTGATGTTGCTCACCGCCTGGGGCTAAGGAGGTCTGACGGAGCACCTCGTAACATCGTGATGCGTTTTACTATGCGTACCTACAGGGACATTGTATGGCGAGCTGCAAAAGAGTCTCGCTATCTAGCGGAAAACAGAATTCGCATCAAGGAGGCGTTAATCAAACAGGATGTGGATGCTAGAGCCAAGTTATGGCCTTTAGTGAAGAAGGCTCGTGAGGAAGGCAAAAAGGTTTCGTGGAATGGCCCCTATGCTTTTGTTGCTGGAAAAAAACTTGAACTTATTCCCTAAAAACTTTACGGAGCATATGTTGCCGAACGTAATTTTTTAGTTATCTAAGCAATCTCCAATTGAAGAATAACTAACGGTATATCTGAGACTTTTCTTTTTCCCTATTGACTGTCATgactatattttatatgtaatttgttCCTTCATAAGTAATTGCACTACTGGCTAAGGTTCATGTTAGCTTTATTCTCCTCTTTGCCGTTACTCGTTTACAGCGGTAAGTTCAAGAAGTGTGCATTGTTAATTTTGTTCTATTTGCATTCAACTTTATTCTAGTTTTCTCTTTTATCTCTgtttctagttattattattatttttttatatgaatgttaaaaactttGAGTTTAACTCTTTGAGTATTGTTTCGTTAAATACCCGTGGCTTGAGAGATCTTACAAAAAGAAaggctttatttttatattgtaggAAAATGAATGTTGACTTAATACTTTTACAAGAAACCCATTCTTGTGAGAATGATGTTCGTTTTTGGAAATCACAGTGGGGTGATAGGGCCTATTTTAGTCATGGGTCTAATCATTCAGCGGGTGTTATCACTCTCATCAATAAATTTAAAGGAGATATTGTTGAATCTCTAGCCTCTACAGAGGGTAGATGGGTTATTCTTGTCACTAAACTTGATAATGCAGTTTTTATAATAGTTAATATATATGGCCACAATTTAACTTCCGTCAATAAAGCATGTATTTCTTTACTACAGATAAAAATTGAagctttaaagaataaatatcATCAGGCTTTTGTTATATTTGCTGGAGACTTTAATGAGGTTTTAGATAATTCATATGACCGATATCCCCCAAAAATGAGTCGCAGTAATGACATTATTTATACTCTGTGTGATTATCTTCAAATAACAGATGCTTGGCGACATTTTCATCCTGATGTGAAGGAATACACATGGAGTAATAATCTGCAAACTTATAAATCTAGAATAGATTTTTTCCTTGTTTCTCAACAGCTGTTACAATTTGTATTTGATGTAAGTCACCAGTATGCTCCATTTTCTGATCACTTAGCAATTAGACTAGTTCTGCAAACGAATCGTAAGGAGAATACCTTACGTGGTTACTGgaaattgaataataatttgttaaacGATAAAATTTTTAATAGTCAGATTAAACATTTAGCTAATGAAATATTCTCAAATTGTGTGAGTAAGTCACATGCTGCTGATTgggattattttaaatttaaagctaGAACTCTAGCTATAAACCGATCTAAAGCCTTAAGAGTGGTTAATGCCAGTAAGGAagctaatttattaaataatataaatgcctTGATTAGAAAAGAAAATCTCTCTGTTCAAGAAATTACTCAGTTAAAATCCTGTCAATTAGAATTAGACCAGTTGTATATAGAAATTGTTAAAGGTGCCTTTGTTAGATCCAGAGCAAAGTGGATTGAGCAAGGAGAGAAAAATACAAGCTTCTTTTTCTCACTTgagaaaagaaattttaaaagaaagagTATTTCTgctctacaaataaataattccttATCAAAAAATCAGGAAGACATTggaaattttatttcaaatttttataGAAACCTATATTCCCTTGACTCTCATGCAAGCCAAAACGGATCTTACCTACAACAAATAGAAAACTATATACCTCAGATAAGTAAtgagtttaaagtattatgtGAAGCTCCAATTTCTTTAAATGAAATTAGGGAtgcaatgaaattaatgaaaaaagggAAGTCGCCTGGCTCTGATGGCCTAACATTagaattttttatacatttttgggaaTTTTTAGAGCAACCCTTTCTTTTAATGCTTCAAGAGTGTTTAGAGAATGAAACAATGACCCCTACTATGAAACAAGGTGTGATATCTCTCATTCCCAAACCAGACAAAGATCCAACTATTATTGACAATTGGCGTCCTATTACACTTCTAAATTTTGATTATAAATTACTTGCTTCCATATTTGCCAAAAGATTAAAAcgacatttacattatattataaatgaaacGCAGACTGGATTTATAAAAGGGCGTCATATTAGTTGTAATACTCGACTTGTGCTGGATCTAAttgattataaaaatgaaatagacTCTGATGCTATTATCCTATTCCTCGATTTTTACAAGGCTTTCGACACCGTAAAGCATGAATTCCTTTTAGACTCTTTGAAAGCCTTTGGATTCCCCTTAAAATTTCTTAATGTGGTACAAATGTTGTACAAAGATATTAATAGTTGTGTAATTCTAAATTCATGTACTTCACCAAGATTTCCTGTGCTTCGTGGTATACGACAGGGCTGTCCCTTGAGcccattcttatttttatttgttgtagaaACTCTATCTATAGATATTCTACACAATAATAATTTGGTTGGTATTAATATCTTTAACAGAGAGATTCGCATATCACAATTGGCAGATGACACTACACTATTTTTAAAGGATAAAGATCAAGTGTCTCCTGTTTTAACCATTATTAATGCATTCTCAGATGCTTCTGGACTCaaactaaatttattaaaatgtgaaattATTTGCTTGTATGACACCTTAGATGCAAAAATTGAAAATATACCGATCAAAGAGGAAGTAAAATACTTAGGaattaatataacaaaaaatctaattagcagacagtttttaaatttttcaacAAGATTatctaaagtaaaatatatttttaatagttggcTCCAAAGAGATTTATCAATTCTAGGCAGAGTCTTCTTAACCAAAACAGATGGGTTATCTAGATTTGTATACCCCTCATTATCTTTAGCAGTAGATAATCAGACCtctaaaaaaattgacaaaatttttcttgattttatttgGAATAATAAGCCTCACAAAttgaagaaacatttattatcaaATAAAAGGAGTGAGGGGGGTCTTGAAGTCCTAAATTTTGATGACAccaataatacttttaaaatcaatTGGCTAAAGAGATGTTTGCTTGGTTCAGACTCTATGTGGTATTTTATtccaaacaatatatttaaaaagattggTGGCCTTTCTTTTTTAATGAAGTGCAATTACTCCATTGgtaaattacctattaaattaGCTCAATTCCATCAACAAGCTCTTTTAGCCTGGAAACTGACTTACAGCCACAACTTCTCACCCCACAAAACCATTCTATGGAATAATGGTGAcattaagataaataataaatcttttttctGGGATAAATGgtttaacaaaaacattatttttgtttctgatCTTTTTAACAGTAACGGTGATCTTTTAACTTATGAGAGTTTTATAAACATGTATCAATTCCCTATTCGCTATATGGAATTCAAGTCAATTATAAAGGCTATACCTAGTGGATTATTATGTCTGATGAAAGCTGCTCTTAGTTATGAGGCAGGTACCAAACAATTGTCACAGTTACTCCTAGGAGGAAAATCTATTCTTAGTAAAGAATGCAATAATAAGTTTATACGTCAAGTGTCCCAGTCACATAACGCAATCACTCCTAGAGGAAAGTTTTTTTGGGGATCCATAATTGTTAATATTCAATGGAGGAAAACATGGTTATTACCATATAAATTCTGTATTCCTAATAAAATGAAAGAGGTGCACTTTAAAATTTTGCACAATATTTACCCATGTAATGCACTTTTATCCAAATATTGTGATGTTACTGatatttgcacattttgtaaGAATGAGAGTGAAGACATTTGtcacttatttttttcttgcgATGTATCATCACTGTTTTGGGATGATTTAAGCTCATACTGTTTCTCCAAGGTTAATATAAGTGGTAATTTGTACCTTAAGGATGTTATTTGCTATTTTGAAAACCAAAACAAGGCGTTAGAAGCCACTGTGAACTTTCTTATACTTGCTGGgaaattttattttcacaaacagagat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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000103976

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00047863 True 5419 mRNA 0.32 1 25310063 25315481

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024136 BX544877.1 coding upstream 103310 25206625 ~ 25206753 (+)
XLOC_024135 ccl39a.10 coding upstream 107540 25202213 ~ 25202523 (+)
XLOC_024134 ccl35.2 coding upstream 133924 25172983 ~ 25176139 (+)
XLOC_024133 ldha coding upstream 178308 25123385 ~ 25131755 (+)
XLOC_024132 si:dkeyp-93a5.2 coding upstream 214292 25092874 ~ 25095771 (+)
XLOC_024138 BX323801.2 coding downstream 52372 25367853 ~ 25400430 (+)
XLOC_024139 LRRC56 coding downstream 122684 25438165 ~ 25447901 (+)
XLOC_024140 rassf7a coding downstream 137740 25453221 ~ 25502640 (+)
XLOC_024141 phrf1 coding downstream 193014 25508495 ~ 25546368 (+)
XLOC_024142 NA coding downstream 235980 25551461 ~ 25554635 (+)
XLOC_023973 CR762411.1 misc upstream 10091954 15217824 ~ 15218109 (+)
XLOC_024129 BX649494.1 non-coding upstream 941973 24367976 ~ 24368090 (+)
XLOC_024126 NA non-coding upstream 1038277 24133854 ~ 24271786 (+)
XLOC_024124 AL954320.1 non-coding upstream 1257836 24051048 ~ 24052227 (+)
XLOC_024122 NA non-coding upstream 1592394 23715365 ~ 23717669 (+)
XLOC_024145 NA non-coding downstream 437488 25752969 ~ 25761996 (+)
XLOC_024147 CR381664.2 non-coding downstream 565402 25880883 ~ 25885453 (+)
XLOC_024148 NA non-coding downstream 653490 25968971 ~ 25970738 (+)
XLOC_024149 BX957333.1 non-coding downstream 729138 26044619 ~ 26046524 (+)

Expression


Co-expression Network