G497740 (LOC106585045)


Basic Information

Item Value
gene id G497740
gene name LOC106585045
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 33088967 ~ 33103783 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU565502
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>TU565501
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>TU565504
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>TU565505
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU565502 False 703 lncRNA 0.43 2 33088967 33103783
TU565501 False 2390 lncRNA 0.43 4 33098771 33103783
TU565504 False 3322 lncRNA 0.43 4 33098771 33103783
TU565505 True 3320 lncRNA 0.43 4 33098771 33103783

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
sv2ca LOC106585040 coding upstream 84848 32969862 ~ 33004119 (+)
LOC110525793 NA coding upstream 122887 32960820 ~ 32966080 (+)
LOC110525791 LOC106584948 coding upstream 143463 32939914 ~ 32945504 (+)
polk polk coding upstream 152009 32926258 ~ 32936958 (+)
LOC110525789 LOC106585038 coding upstream 205149 32772583 ~ 32883818 (+)
LOC110525799 LOC106585046 coding downstream 31499 33135282 ~ 33165186 (+)
LOC110525801 ppc1a coding downstream 69739 33173522 ~ 33177160 (+)
LOC110525805 LOC106585050 coding downstream 175415 33279198 ~ 33280948 (+)
LOC110525806 LOC106585051 coding downstream 209572 33313355 ~ 33317175 (+)
c6h22orf39 cssa24h22orf39 coding downstream 213795 33317578 ~ 33320353 (+)
G497402 NA non-coding upstream 150877 32937884 ~ 32938090 (+)
G497253 NA non-coding upstream 375762 32653971 ~ 32713205 (+)
G497153 NA non-coding upstream 623555 32464030 ~ 32465412 (+)
G497146 NA non-coding upstream 644429 32441571 ~ 32444538 (+)
G497117 NA non-coding upstream 698149 32390569 ~ 32390818 (+)
G497749 NA non-coding downstream 76532 33180315 ~ 33183152 (+)
G497849 NA non-coding downstream 89295 33193078 ~ 33197388 (+)
G497852 NA non-coding downstream 94359 33198142 ~ 33198539 (+)
G497853 NA non-coding downstream 95482 33199265 ~ 33199491 (+)
G495920 LOC106584987 other upstream 1776230 31294946 ~ 31312737 (+)
si:ch211-225b11.4 LOC106584980 other upstream 2078363 31006547 ~ 31022524 (+)
G495132 NA other upstream 2356077 30732352 ~ 30732890 (+)
G495076 LOC106585256 other upstream 2512211 30576105 ~ 30576756 (+)
LOC110525816 LOC106585060 other downstream 357852 33447246 ~ 33465055 (+)
G499111 NA other downstream 1047357 34151140 ~ 34151737 (+)
fancc fancc other downstream 6166176 39269915 ~ 39312098 (+)

Expression


Co-expression Network