G517877


Basic Information

Item Value
gene id G517877
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 50911814 ~ 50922098 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU587446
GTCAGAAGGTTTATTCACGAGAGcgttaaaaatcatacaatgcacATAGCCTTTTATACCTCACATTTGGTAATATAAATGCCCCTCTAACACTGTCAATGCTGTTTACAAGGTTTCTCCAACACATACCTTGCTTATCATATCCTGCAACATGTTACACAATCTACTGCAAGCCCAACGGTTTCTCCCCTTCCTGGGTGGGGAGACCTCCTTCCCTGTTATCAGTTTCACAGTTGTCACAATTGTCACAAGTTGTCTGCCACAGTCTCTTGTCTGGTAACAGTTCCTCTTTTTTATGCACATACAATCATGAATTCTAGTCTTatgattcaaacacattttactCCATTATACAGTGACAGGGTGGAATACTGTTAGTTATGGCCTTAACATGAATTGGAACGTATTAATCATTTAGTCATTATCTTACCATTACCTTAACCATGTTAATCCCCATAACAATGTACAAATACAccagtagtataaaccagcctctattcttgaaatctttggttgtttagtacatggcctcacatgttaATCCTTAAAATGTTGAGCGGggttaaggcttaagagggtgtgaacaatgctgaatgggtgtagacaaataagagctctccagtaggtttaccaaaacattcaagggccattttttcaaaagtgaggttaagtttatcaactttcaaaactGAATTACTTTCCTATTGTTCCTCAACTCTAGTGTACGAAATTATGCTTAGAGTCCAGTCCTGGTCTTCCCGTGGCCACTAGAGTCGCCAACGACAATTCGTCACCTGGGTTGTGGGGAACCTCCCTGCAGTGGCTGACGTGAACCTAAGTAGACCTCTGCATCCTTCACCACTGTCTGTGTTGTCTGGAGCACCTGGAATGGACCAGTCCAGCGCTGTTGGTGCCTAGTCTTTCTGCGGTGGTCCTTGATGACCACCCAATCGCCTGGctgaagtttgtggagtggtcCAGCTAAAGCAGCTTTTACCCTGGGTAAAAATAGATTTCTGAACATTGTTAAGTGCAGGACAGTAACTTACCATTTGGTCTGTTACTAATGTGGgcggaccaagtaattgggcgtcactctaaagcgggaaggtggaataaacgagtcaggagtgggttttcttgattgaacacagttctctattgagggcatttggtcaacacaaacactccaacataatcaatgaaaaccttccaaggaaaaacatacatcttctccagatgaaacaggAACGCGATaggattatctttaaactacaacaaaagtCACAGgattgtcaccgtcttagtggttcttcctggatagctcctctgtctcggtggccatcttccagagatagtgttcccctcctctctctactggttccattctctctcttttataggggaaggagaatatgtcattagtaccgtcagctgtgctcaattgcctctggttaccttgtctcccatgccttgttgggctactatccgtgagcccagcctgccctctggtgggcCTTCCACATACTTTCCCCCCCAGGACCTCACCGGAGGGTCTGGCTCCAGACGCACCATCTTGGTCCTGTCGGGACAGCGCGTCTGCATTCCCGTTCCTCGATCCGGCCCTGTGGATGACATGGAAAGAGAACGGTTGTAAAGACAAAAACCGTCTGGCTATTCTGTTGTTATTGTTTCTCTTACCAGCCATCCACGTGAGGGGCGCATGGTCAGTAACTAATGCCAACCTCCGACCCAGTAGGTAGTACCGGAGATAATTGTGGGCCCACTTGATGGCTAAGGCCTCTTTCTCTACGGTAGCATACCTCTGTTCCCGATCGCTGAGCTTCCTACTTATGAAGAGAATCGGCTTCTCTGCTTCGCCTTTACCCTGAGCTAGTACGGCCCCGAGCCCCGTATCCGATGCGTCGACCTGCACAATGAACTCTTGTGAGAAGTCCGGAGCCTGTAGAACGGGATCAGAACACAGGCCATCTTTTAGCAATTGAAAGGCCTCTTCTGTCTCGTCTTTCCACTCTACCTGGTTTGGCAGGTTTGGCACTGCTTATTTGACacaatgctcgcttaacccagaagccagccgcaccaatgtgttggaggaaacaccgtacacctggtgaccgtgtcagagTGCAAGCgccctgcccgccacaggagtcggcTAGAGCGCGATTGGACAACAACGTTTGGGCGGACAAACCCCCcccttaacccggacgatgctgggccaattgtacactGCCTTACGCTGCCTTATGAGTCAGTCTGTGGCATAAAAATGCCTTTCTGTTTCCAACAACTGCGAGTAGTTGAGAAAATATTGTCGATAGGATCACAGTGTGATCTATCAATATCCTGCATGTCCCATGCATAGTACCAATCCCATGTTGAGACCGTGTCGGACAGCATCACGATATTACATTTCTCCGGGGGCAGTACAACACTGAGGCCCTTGTCTTTGCAAAGGATGTTaactctctgggatatgtgggacagtagcgtcccacttggccaaaagccagagaaaatccAGAGCGCCAAAATCAAATACATTCCTATAAAAATCAAACgctcatgaaatcacacatgtaagataccaaattaaagctacacgtgttgtgaatccagccaacatgacagatttcaaaaaggcttttcggtgaaagcaaacaatgctattatctgaggatagcacctccgtaaacaaaagaaagaaaacacatttcaaccctgcaggcgcgacacaaaacgcagaaataaaaatataaatcatgccttacctttgacaaacttcttctgttggcactccaatatgtcccataaacatcaccaatggtccttttgtttgattaattccgtccatatatatccaaaatgtccatttatttggcatgtttgatccagaaaaacactggttccaacttgcgcaacgtgactacaaaatatctcaaaagttacctgtaaaccttgccaaaacatttcaaactacttttgtaatacaactttagttgtactttttaaagtaaataatcgatcaaattgaagacgggatgatctgtgttcaatacaggaagaaaacaaactgacgccagctttctggtcacgcgcctctatcaaaTAGTACCTCGTTTTGAACAGggatacttcttcattacacaaaggaaaaacctcaaccaatttctaaagactggtgacatccagtggaagcggtaggaactgaaagcaagtcccttagaaatctggattcccaatgaaacaccaaaaatctgaatggtttgtcctcggggtttcgcctgctacataagttctgttatactcacagacatgattcaaacagtttcagagtgttttctatccaaatctactaattatcttctggggatgagtagcaggcagttgaatttgggcatgcttttcatccaaaattccaaatgctgccccctatcttAGAGAAGTTAACttcattgggatagggggcagcattgggaagtttggatgaaaagttactcaagcccagaagctaggatatgcataggTATGCATAGAAATACTATAGTTtccaaactgttaaaataatgtctgtgagtataacagaattcatatggcaggcataaacctgagaaaaatccaaccaggaagtgggaaatctgaggtttgtagtttttttaaagtgattgcctatccaatatcctGCGTCTatggggtcagattgcacttcctaaggcttccaatagatgtcaacagtctttagaagttgtttcaggcttgtattgtGAAAGGGGATCGAATAAGAGCTGTATCAAAAAGTGGTCAGGCTGAAAGCCTTTAGTTTAGTCTTGCGCGTGGCCGTGAGCGCAACGGTCGTTCCCTTTCCCAacggaattgtccggttggaatattttTGAAGATATATGATAAAaaatatcctaaagattgattctatacatcgtttgacatgtttctacgaacctTAATGGAACTTTTtttacttttcgtctggactttgTGCCCGCGttttgtgcatttggattactggataaacgcacaaacaaaaaggaggtgtggctgtatggttttctgtggctaggcgctgacctaatataaacgcatggtgtgctttcgacgtaaagcctttttgaaatcggacactgtggctgaattaacaagaagtttatcttttataatggtgtataatacttgtatgtttgaggaattttaattatgagatttctgttgtttgaatttggcgccctgcaatttcactggctgttggcgaggtgggacgctcacgtcccgaacgatcccagagaggttaagtcCCAATTTGCAGAGAAGTTCTCTTCCCATGAAATTGACAGGGCACCATTTGGAGGCGATAAATTGGTGTGtgaaacacttattttaaccaGCAGGATCATTGTGAGCAATTCATTCATTGTTCCTGAGGCCCCCACGGTGCTGACTGATTCATTTGACATAGGAGAGTCAGACATGGTTTTAGAATTTATGACAGACATTGCAGCCCCAGTATCAACTAGAAATTCAACAGACTCACCATTGATGAGGAGAAGAACCATTGGCTCCTCACGAGGGCTTGAAAAAAATCCTTAAATGCTGTCCAAGGGGGTCAACTCTCTACCTCATGTCCGTCAATATGTGGTCGTtttcggcggtcgtcgtcacgtcccccccccccccccccccccactgccccATGTTCGGTAGGTTTGCTTCGACATGTTCTGGCGAAATGCCCCTCCTGTCCACAGATATAGCAGGTCAAGCTATTACCTTGTGATGTCCGTTGTCCAGCCCATCCTTCAGCagtctcctctgcctcctcttcctctaccccttcctttcctctctgtccaccattttgAGGTCCTCCCTGAGCCTGCCGCTGCTGGCCCTGTCCTTGATAGAAGGCCAGCTGTGCAGCTTGTAGTCTCACGCCCTCCTTTTCCATTCTCTGTTTCATC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GTCCGAGGCAGTTTCCTTCTGCTCCTCTCAATCGGAGTGTAGGCTCCCTGAGCCACGTCTTACCTAGCCTCTATGCACAGTTAACGTTGGTGTCCCTGGGAACGATCAGCAAGCGGAATTAGACATCTCATCCTTGTCTCCAAGAATTGTTGTGGAAATTCTAACCCAAATGAAGAGAGACTGTAGATTCTTAAAACATCAACTTTATTATAAGACTTTTAAATCTGAAGCGGTAAACAAATCACTCAATGGTGCAGAGTTAG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106565892

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU587446 True 10263 TUCP 0.41 2 50911814 50922098

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
lrrc2 lrrc2 coding downstream 33523 50848720 ~ 50878291 (-)
spinb spinz coding downstream 102205 50804638 ~ 50809609 (-)
LOC118965127 NA coding downstream 109029 50802690 ~ 50802785 (-)
mak16 mak16 coding downstream 117074 50790687 ~ 50794740 (-)
LOC110525037 NA coding downstream 128400 50772325 ~ 50783414 (-)
LOC110526129 LOC106587034 coding upstream 11452 50933550 ~ 50950417 (-)
zgc:101664 NA coding upstream 41529 50963627 ~ 50970573 (-)
LOC110526131 LOC106587035 coding upstream 58117 50980215 ~ 50984276 (-)
nudt12 nudt12 coding upstream 96317 51018415 ~ 51031331 (-)
LOC110526133 LOC106587038 coding upstream 109345 51031443 ~ 51075263 (-)
G517885 NA non-coding downstream 9843 50901661 ~ 50901971 (-)
G517865 NA non-coding downstream 32287 50879279 ~ 50879527 (-)
G517843 NA non-coding downstream 66874 50842715 ~ 50844940 (-)
G517819 NA non-coding downstream 111718 50799723 ~ 50800096 (-)
G517813 NA non-coding downstream 130043 50781497 ~ 50781771 (-)
G517893 NA non-coding upstream 9142 50931240 ~ 50933219 (-)
G517860 NA non-coding upstream 31517 50953615 ~ 50953881 (-)
G517897 NA non-coding upstream 32933 50955031 ~ 50955277 (-)
G517898 NA non-coding upstream 33942 50956040 ~ 50957323 (-)
G517902 NA non-coding upstream 38000 50960098 ~ 50960374 (-)
G517777 LOC106587028 other downstream 260395 50636549 ~ 50740638 (-)
LOC110515945 LOC106585521 other downstream 1288071 49622196 ~ 49624916 (-)
G516320 LOC106585521 other downstream 1375529 49535215 ~ 49536285 (-)
LOC118936342 LOC106585521 other downstream 1530992 49379716 ~ 49385907 (-)
LOC110512256 LOC106585521 other downstream 1562678 49346858 ~ 49349193 (-)
LOC110526143 LOC106587046 other upstream 645880 51563139 ~ 51643817 (-)
G520661 LOC106587056 other upstream 2220117 53142215 ~ 53162922 (-)
G521438 NA other upstream 2829018 53751116 ~ 53751623 (-)
G521441 NA other upstream 2831951 53754049 ~ 53754538 (-)
G521418 NA other upstream 2838135 53760233 ~ 53761885 (-)

Expression


Co-expression Network