XLOC_024383 (mon2)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_024383
gene name mon2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 1631828 ~ 1687481 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


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AGACTGTGAGGATTCCTCTGGGCCTGAAATACGCCTGTCCTGCTGAGAGCACCTGGAAACTGGCCGTCTCCTCGCTGCTCAAAGTGCTTTCCATTGGACTCCCTGTTGCTCGGCAACAAGCATCATCAGGAAAATTCGACACGATGTGGCCGGAGCTGGCGAACGCCTTCGAGGACTTCCTGTTTACCAAGAGCACACCTCCAGATAATCTGTCCATACAGGAGTTCCAGAGGAATGAAGCTGTAGATGTGGAGgTGGTGCAGTTGATCAGCTCAGAGATTTTACCATTTGCCAATTTCATACCCAAAGAGTTTGTGGGCCGTATCATGAGCATGCTGAATAAAGGATCGATCCACTCGCAGTCTTCATCATTCACAGAGGCTGAGATGGACATGCGCATGCGGGAGGATTTCTCCAAAGTGTGCTTCGAGACGCTCCTGCAGTTTTCCTTCAGTAATAAAGTGTCGACGCCGCAGGAGGGCTTTATCTCCCGCATGGCGCTGTCGGTGCTGCTGCAGCGGGCGCAGGACGTGCTGCGACGATACGTGGAGGACGAGCGGCTCAGTGGACGCTGCCCGCTGCCCAGGCAACAAGTGACTGAGATCATCTTTGTGTTAAAAGCCATCAGTACTCTCATGGATTCCCTGAAAAAGACGCAACCGGAGAACGTGGATGGGAACGTTTGGGCTCAGGTGATTGCGTTGTACCCAACGCTGGTTGAATGCATCACCTGCACATCTCCTGAAGTCAGTTCGGCCCTTAAAGACGCCCTGGGGCCCTTTAAAGACTTCATGCAGCCGCCCGTCTCCAAAGTGCAGAACGGCGAATCGTGACTGAACGTTTTTACTCTACCGCGAACATGAATATGACTGTTTCATACGCCGAGCGTGAGGACACCGATTCAGCCCCATCGTCATGGTAACCGTTGACTGACAGCTCCGAAATCCCATCTTTCTGAAGTTAATTCTAATATGAGCTGACAATAGTCTCTGATTGGCCGACTTTAACGATGTATTAACTGCTATGTTAAATTTGCAGTGTTGTttttatgggtttatttcttgATCTCCCCCTCCCCCCACTTCCCTCCCCATCTGGAGTTGATGTACAGTGTTTGGTGATAGTGTTAAAGATGTAATTAAGAAACACGTATTTGGATTGAAAATCAGatccaaaaatcatttaaaagagAGAATGAAAAAACTAATCATGATAATTACATGAAGGAtggtcttttttttgtgtgtgaagttTTCTCAACAGCAATGGATTTTATGCAAGATCTTACTGTAACATTCCACGTCATCTTTAGTCGCATTAAGAAGGGTTGAACCTGGTGTGTGTACAATAATAAATGGTACAGTTCTATGAACATC

Function


symbol description
mon2 Predicted to act upstream of or within protein transport. Orthologous to human MON2 (MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking).

GO:

id name namespace
GO:0015031 protein transport biological_process

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-030131-2712 Predicted to act upstream of or within protein transport. Orthologous to human MON2 (MON2 homolog, regulator of endosome-to-Golgi trafficking).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000099798

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00048214 False 9043 mRNA 0.47 34 1631828 1687481
TCONS_00048213 False 9133 mRNA 0.47 33 1631828 1687481
TCONS_00048215 True 1376 mRNA 0.47 6 1635210 1642395

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024382 dre-let-7i coding downstream 2079 1629655 ~ 1629749 (-)
XLOC_024381 NA coding downstream 5910 1624880 ~ 1625918 (-)
XLOC_024380 CR354429.1 coding downstream 160643 1464379 ~ 1471185 (-)
XLOC_024379 itga11b coding downstream 204952 1343161 ~ 1426876 (-)
XLOC_024378 cln6b coding downstream 297324 1325946 ~ 1334504 (-)
XLOC_024384 SLC6A13 coding upstream 8066 1695547 ~ 1720736 (-)
XLOC_024385 NA coding upstream 258887 1946368 ~ 1951444 (-)
XLOC_024386 CR385026.2 coding upstream 286043 1973524 ~ 1974290 (-)
XLOC_024387 wnt7bb coding upstream 315234 2002715 ~ 2081371 (-)
XLOC_024388 CR385026.1 coding upstream 325196 2012677 ~ 2013391 (-)
XLOC_024375 CU861469.1 non-coding downstream 435716 1195282 ~ 1196112 (-)
XLOC_024369 NA non-coding downstream 988722 630933 ~ 643106 (-)
XLOC_024389 NA non-coding upstream 439335 2126816 ~ 2165034 (-)
XLOC_024390 NA non-coding upstream 588044 2275525 ~ 2299749 (-)

Expression



Co-expression Network