G537615


Basic Information

Item Value
gene id G537615
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 67757125 ~ 67762036 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU608683
AGAAGTTAGCTGtaacaataaaaatacaatatCTTTGTGTCCTTAAGTACATAGAATTAAAacagcaaaacaaaaacaaaacagcatTAAGTAGTTCACAGCGGTACAAATATACAGTACAAATCTATTTTATTCAAAAAgggtacaaataaaaaaaacgcAACAAAATATAGTTATTAATGCTTTGTAAAGTTCAGGTAGGTGTAGGGTACTGTACTCTAAGGGAGCACTTTGGGTGGACAACTAAGGCTTTTGATAAGAATCAATACATATTGGTACGGCCATACGATATTAAAACTCACTATACAAAAGTTTATACAACCTGGATTATATTTGAGGATTGAATATTACATATACATCATTGCATATATTTTGCAGATTTTATACTTTAAAAAAAGGATGCTGTTTCTTTTAAAACTGGTCAAATGTCACGTAAAAAGCAATAACTTTAGTGCCAAAATAcaaatgtcaaatctgaaaataCACAACTCCATTAAAACTTTTAACCATTCTCATCTTCCTGATTTAATTCTGCATCTCTAGTGCCTGGCAACAACACCATCCCGTCCAGTCTATTTACCTCAGTCATACAAGATCAGACCAACAGGGCTACTTTATACAGGGGTCATAAAGCCTTTTTCCAGAATCACAAAACAAAAACGGACCGTACAGTTAATTATAAAGGAACGCTGTCCCTGGTTTGAAAAGCCTCACATGTAGATCAGACAGGACCAGAACTACAATACATCGACCACAACCTCACCTTCAGGGACCCACTCCCAACGTCCACTCACATTAACAacagagggtggtgtgtgtgtgtgtgtgtaaaaaacagcgagtcagttactggtccagcTTTCAAGCAATGCTAAGGACTCACCCTAACATGATCCCTCACTGTAACCTCTCCCTATCCAGAGATACAGCCCATCTCCAAATGCCTTTCTGCTTATGAATAAAACACCAGGAGAGTGCCAAGAGGGGTCAATACAACAAGAGTGAACTGATCCACCTTTGCAGCTACAGAAAAACGGGGAAACTGGGTCACTTGGAAGCATCATTCCATTAACACATTGTACAGACCTTAAGGCGTTATTGACAAGCTTGATAATAGCCATACAAAACATTATCTCTACAAACATGCACAACTGTCAAGTGATTGTTTCATTGGGTTTTGTGTTGTTTAGCGCTAATAATTAAAAACTTCAATTAACCAACCGTTAATTTTATAATACTATAAAGGATGGCAAATTAGTGCAATTTTCTTTCTTGAATAAAATTGTAATCAAAAACGTACAGGTCAAATGTTTCCCCTTTCTTACGATGGTTAAGTCAAGAGAAGAACCTAGAAAACTGCTGAAGTAGCACTTTCACGCTCCGAGCAGAAGTCTGAGAACGATGCTAGTCTGACTAACAGAAGGCGTGCTGCTAATGTGCCTGTCCACTTGACTGTCTGCTGAGAGTCAGAGTGGTCATACAGCCACTACCACATACTGTGTtcaagacagagaggaagaggtaaatAAACAGGAGGCACTGCTTTGCACCTAGAATGGTTGTCCCAGACCAGAATACTGAGTTTGATACACATGTTGTGTAGCAtggcaaagggaggagaggaggtggtaaGACACAGAAGTGCTGTTTGTGCATGTGAGGAGTTATGTTAATAATATTTTACTGAAGTAAGAATATCTGGAGGAAAGAGTGTGTTGATGAGCAGTGGGGTGTTCCAGGAAGCAGGATCATTACCTTAGCCAGTTAACTTTGATAGGCAGCCAAACAAATCTCTTGATTTTCATTGAGAAAACTAAACCCAAATATGGATTGTTGGTTGTCAAGTCAATTATACCATTACCACTTTCAAGTTGATAATTCTCGAAAAAAATGCAGGTATTTACGTTTTTGGGGGGaccgttagctggctaactcattgatcctgctttctGGAACAGCCCCCAGGGAGGTGGGACATGAGATGCAACCCATTCACAAAACATTTGACAACAGTGCACAGACACAGGCAGGCTGTTGACAGTGTCCTTTTTCAGAGCATCTGCACTCTCCACACCATCTCCTATAAAATGTGAGACAGGCCCAGCTGAGAGCCCTTGGTAAGGCAGTGGATTTTGGAGAGTAAAAGTTCACCAAAGAGAAGACTCTGACCCTACAGGGCTGAATACACACCGTAACATTCATACCATATCTAAACAAGGTATTGCTACACGTGACCAAGAGAGATCGTAAGGCCAAAATCTAACTGGATTTCCATGCACATAATTTGCATATCAGCACAAATCCATAGATGTCAATGACAGATTTACATCAAAATTTGAGTTACACATGCATACCCATCTCTAGTTATGATTTGGCCCGTACTGCTTGGCAGCGGAAGGTGGAGGTAATAGGCTGAACTGACTGGAACAAAACACTGTGCTGAACTTAGGTTAGTGACAACTAAGGGTCTGAACAAAAACCTAACAAAATAAATCCACTATATTCAGACACCTAAGAGTGGGCACTGATAAGCAATAGTACTCAGAGAGATCAGTGTACAATGACTGCATCAGCCACCTTTTTAAATAGATTACAAACCTGTCCTACCCCGTAGAAGGTACACTTGGACACTGAAGAGCAGAATACTTCAGAGTTTACTGCATAGCACATGCTTATACTACATGACGTTTTCAGGTATTCTGTGTAACTGTATTGCTTATAGCATAAAAAATTTAACAAAACGTGATCACTGTAAAAAAAATGAATTAATAAGTATTGAGAGGTTTAGGGTTAAACGTCTACTGCTCCACTGTGGAAAATCATCCAGCTCATCTCTGTATGGCATTTGACCACTACCGTATTTAAAAACATTGATATTTCAACAAAATGTCAAATTGGTTGTCATGACGGTATCAAATGGTATGTGACTCTGCCCTGATCAGGCCTAACggacctcccctctccctctccttgttgTTGAAGGCGGTCAGAGGTTTTATCCTCAGTGAACTGTGAGTCCTTGGGGGCTCCACTCAACAGAAATGTTGTGGAGGCAGTAGGGTTGGAAGGGGTGTATGAACTAGATTTGACACAGCCATCTATAAATAGTGTGGATGAGGGACTCCAGTCCATTAGAAGGCATTGGGTGTCATCACACACAATCACCAGTCTTCACCTCAGAGCTCAAAGACCAGGATACAG
>TU608681
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>TU608682
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU608683 False 3201 lncRNA 0.40 1 67757125 67760325
TU608681 False 4805 lncRNA 0.38 1 67757232 67762036
TU608682 True 3094 lncRNA 0.40 1 67757232 67760325

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110526406 LOC106587353 coding upstream 3728 67736810 ~ 67753397 (+)
LOC110526949 mald3 coding upstream 112552 67643814 ~ 67644573 (+)
LOC110526401 LOC106587347 coding upstream 212269 67528142 ~ 67544856 (+)
LOC110526948 LOC106562086 coding upstream 980793 66756330 ~ 66776332 (+)
LOC110526393 LOC106587180 coding upstream 1003685 66748816 ~ 66753440 (+)
LOC110526410 myo1e coding downstream 87238 67849274 ~ 67897779 (+)
LOC110526412 LOC106587340 coding downstream 197778 67959814 ~ 67973591 (+)
adam10a adam10 coding downstream 244992 68007028 ~ 68116406 (+)
LOC118965064 LOC106577244 coding downstream 298600 68060636 ~ 68063992 (+)
trnar-acg-5 NA coding downstream 357794 68119826 ~ 68130306 (+)
G537612 LOC100194703 non-coding upstream 7247 67749622 ~ 67749878 (+)
G537589 NA non-coding upstream 48405 67703515 ~ 67708720 (+)
G537533 NA non-coding upstream 122535 67607254 ~ 67634590 (+)
G537529 NA non-coding upstream 125458 67600561 ~ 67631667 (+)
G537528 NA non-coding upstream 156939 67599741 ~ 67600186 (+)
G537630 NA non-coding downstream 31903 67793939 ~ 67803569 (+)
G537632 LOC106587318 non-coding downstream 34039 67796075 ~ 67824783 (+)
G537635 NA non-coding downstream 51007 67813043 ~ 67830909 (+)
G537636 NA non-coding downstream 51349 67813385 ~ 67821093 (+)
G537638 NA non-coding downstream 69478 67831514 ~ 67831871 (+)
G537606 NA other upstream 507 67754556 ~ 67756618 (+)
G537032 LOC106587324 other upstream 646497 67109676 ~ 67110628 (+)
G537029 zfhx3 other upstream 652217 67104306 ~ 67104908 (+)
G536995 zfhx3 other upstream 738472 67013220 ~ 67018653 (+)
G536406 NA other upstream 1153072 66602785 ~ 66604053 (+)
G537617 atxn1l other downstream 4720 67766756 ~ 67767613 (+)
LOC110526436 LOC107688027 other downstream 917341 68679317 ~ 68681675 (+)
G538561 NA other downstream 942362 68704398 ~ 68704696 (+)
G538607 NA other downstream 1049083 68811119 ~ 68811890 (+)
G538859 NA other downstream 1144009 68906045 ~ 68906847 (+)

Expression


Co-expression Network