G538991


Basic Information

Item Value
gene id G538991
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 69241293 ~ 69275222 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU610397
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>TU610399
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>TU610403
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>TU610404
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>TU610406
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>TU610407
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>TU610410
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>TU610411
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>TU610398
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>TU610402
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>TU610405
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>TU610409
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>TU610412
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU610397 False 820 lncRNA 0.43 3 69241293 69274586
TU610399 False 1072 lncRNA 0.40 3 69241293 69274586
TU610403 False 824 lncRNA 0.43 3 69241293 69274586
TU610404 False 992 lncRNA 0.41 3 69241293 69274586
TU610406 False 1044 lncRNA 0.40 3 69241293 69274586
TU610407 False 728 lncRNA 0.44 3 69241293 69274586
TU610410 False 823 lncRNA 0.43 4 69241293 69274586
TU610411 False 960 lncRNA 0.41 4 69241293 69274586
TU610398 False 1303 lncRNA 0.39 2 69273004 69274586
TU610402 False 1209 lncRNA 0.40 2 69273004 69274586
TU610405 False 1415 lncRNA 0.39 2 69273004 69274586
TU610409 False 1443 lncRNA 0.39 3 69273004 69274586
TU610412 True 1883 lncRNA 0.39 2 69273004 69275222

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rhcg rhcg coding upstream 12808 69222165 ~ 69228485 (+)
LOC110526459 LOC106562249 coding upstream 51327 69148330 ~ 69189966 (+)
LOC110526458 LOC106587394 coding upstream 107677 69030882 ~ 69133616 (+)
LOC110526955 LOC106587395 coding upstream 222879 69007055 ~ 69018414 (+)
LOC110526456 LOC106587398 coding upstream 253154 68978897 ~ 68988139 (+)
LOC118964925 NA coding downstream 4963 69280185 ~ 69293194 (+)
trnar-acg-7 NA coding downstream 27110 69302332 ~ 69302404 (+)
LOC110526466 LOC106587388 coding downstream 112103 69387325 ~ 69422563 (+)
LOC110526467 LOC106587383 coding downstream 166147 69441369 ~ 69526649 (+)
pdcd5 LOC106587385 coding downstream 255965 69531187 ~ 69539723 (+)
G538977 NA non-coding upstream 24746 69215567 ~ 69216547 (+)
G538891 NA non-coding upstream 96358 69044070 ~ 69144935 (+)
G538931 NA non-coding upstream 197266 69042621 ~ 69044027 (+)
G538925 NA non-coding upstream 222240 69018849 ~ 69019053 (+)
G538878 NA non-coding upstream 248454 68990838 ~ 68992839 (+)
G538993 LOC106587389 non-coding downstream 32757 69307979 ~ 69309980 (+)
G539105 NA non-coding downstream 133526 69408748 ~ 69427787 (+)
G539138 NA non-coding downstream 194762 69469984 ~ 69471242 (+)
G539139 NA non-coding downstream 199126 69474348 ~ 69477339 (+)
G538877 LOC106582599 other upstream 238465 68996083 ~ 69002828 (+)
G538859 NA other upstream 334446 68906045 ~ 68906847 (+)
G538607 NA other upstream 429403 68811119 ~ 68811890 (+)
G538561 NA other upstream 536597 68704398 ~ 68704696 (+)
G539068 NA other downstream 86419 69361641 ~ 69367642 (+)
G539959 NA other downstream 741120 70015270 ~ 70019477 (+)
LOC110525047 psf2 other downstream 760972 70036194 ~ 70039507 (+)
G540179 NA other downstream 1206728 70481950 ~ 70484368 (+)
LOC110526485 fam92b other downstream 1276573 70551763 ~ 70558098 (+)

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