G559452


Basic Information

Item Value
gene id G559452
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048570.1
NCBI id CM023224.2
chromosome length 101096859
location 91323737 ~ 91331548 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU634482
atggtcaggtatggtcaggtgtatctatcctacctgcagtattcctcccctggtgctgtctagttggtactgtaaggtgagtatggtcaggtatggtcaggtgtatctatcctacctgcagtattcctcccccggtgctgtctagttggtactgtaaggtgagtatggtcaggtgtatctatcctacctgcagtattcctcccctggtgctgtctggttggtactgtaaggtgagtatggtcaggtgtatccaggtgtatctatcctacctgcagtattcctcccctggtgctgtctagttggtactgtaaggtgagtatggtcaggtgtatccaggtgtatctatcctacctgcagtattcctcccccggTGCTTTCTGGGTGGTGATGGAGGAAGAATGTGGGGAGACCAAGAGCTTTACACAACCAATCCATCACGTTCATCTCCAGCTCTGTACACGCCGGGCTGGAGGCCTGGACCCAACACACAACAACATCATGTTATT
>TU634483
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>TU634485
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU634482 False 506 lncRNA 0.50 3 91323737 91330082
TU634483 False 517 lncRNA 0.50 2 91327523 91330082
TU634485 True 408 lncRNA 0.50 3 91328125 91331548

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110511526 LOC106592072 coding downstream 36776 91248205 ~ 91286961 (-)
LOC118965056 NA coding downstream 254831 91063850 ~ 91068906 (-)
LOC118964969 NA coding downstream 297320 91022853 ~ 91026417 (-)
LOC118965055 NA coding downstream 334563 90987522 ~ 90989174 (-)
LOC110527014 NA coding downstream 372615 90942792 ~ 90951122 (-)
LOC118964970 LOC106593544 coding upstream 11650 91343198 ~ 91356880 (-)
LOC110519163 LOC106593544 coding upstream 39386 91370934 ~ 91381714 (-)
LOC110515052 LOC106594640 coding upstream 51330 91382878 ~ 91406945 (-)
LOC118964971 NA coding upstream 172469 91504017 ~ 91505014 (-)
LOC110518475 fsd2 coding upstream 388812 91720360 ~ 91763932 (-)
G559387 NA non-coding downstream 15929 91307489 ~ 91307808 (-)
G559369 NA non-coding downstream 27526 91295801 ~ 91296211 (-)
G559368 NA non-coding downstream 28076 91295401 ~ 91295661 (-)
G559358 NA non-coding downstream 66539 91256818 ~ 91257198 (-)
G559461 NA non-coding upstream 7020 91338568 ~ 91338954 (-)
G559462 LOC106587893 non-coding upstream 10358 91341906 ~ 91342134 (-)
G559463 NA non-coding upstream 14019 91345567 ~ 91346572 (-)
G559445 NA non-coding upstream 19654 91351202 ~ 91353753 (-)
G559488 NA non-coding upstream 127466 91459014 ~ 91459228 (-)
G559364 NA other downstream 33400 91289092 ~ 91290337 (-)
G559163 NA other downstream 330788 90992436 ~ 90992949 (-)
G559162 NA other downstream 331560 90990830 ~ 90992177 (-)
G559123 NA other downstream 399902 90923098 ~ 90923835 (-)
G559772 NA other upstream 332050 91663598 ~ 91665349 (-)
G559773 NA other upstream 335178 91666726 ~ 91669659 (-)
LOC110500502 LOC106562864 other upstream 472625 91804173 ~ 91969990 (-)

Expression


Co-expression Network