XLOC_024800 (CABZ01046954.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024800
gene name CABZ01046954.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 33266586 ~ 33275666 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00048869
ctcatgtgttcaatacattttttCTGTGTTACTTCATTTTatcacacataacttcatttttaaactaattaggtTTGTTTTCTATATGGATtcctttggttgttaccaacatctggtgaaaatttgaAGTGAACAGCACCTTAGAAATATGTCTTCTTCACCATAAACATTCCCAGTAACATCTGCTGTATAAATGTCACATACTTTCTTAATGCATTGCTTTTCTGAAAACCTGCCTCTGTCCCGCAGCTGCAGTGCCAACTACGAGGGCAGCCGATGTGAACATCTCCAGCTCTTCAGTTTCTCCCACAGCAGTGAAGAGAAGGGCCTGATCGCCGCCGTGGTCATCATCGTCCTGCTCATCATAGTGGTGCTCGGAGTGGTCATCTATTACATCTGCAAAATAAAGAAGGatcaaaacaagaaaagaaaccaacaAAGCCAGCAAAATCCCACAGAGTATTGGAAAGTGAACACCAGCTCGACCCCTGATCAGAAAGTCTGACCCGCTCCCGAATCTCGACTTCATTTTCTAACATCGCCCTCTTGTGGAGACTTTGGACTCAACCGTGAAAATGTGTCGGATCTGCACAGAAGCTGGAACTGCCTACAAAATACCTTTGTAAATATTTCTGTCAATTAAAGCAGGTTAAGTTGAACATGTAACAAACGGATGCAGATTTTACAGTAATCATGTCAGCGAtacaaagcaaaacatttcaaaagCAGCATCCCTACAGTAGATTTTCACTTTAATTACATATAGAAGACTTATCGATATTTAAAATACTACTTGCATGTGATATGTACATACATTTTTCTaatgtgctgtttttgttttggctgtaattattttcttttttaaatattttcctttttatttgtaCTTGTcttatattgttattaatatgcttTCACTTTTAACAAAACCGGTCTCATTTATATATGATCATAGTCATCCTATTTACGCAGGATTAATCCTAAAGTCGGTTTGCAGTATGCAGGTTTTCTGTCTAACACCTATAGGACCAAGTGAATGCAATCGTATCTGGATGCAggcttgatgatgcaagctgagactgcatatctcagtaatgcaatgtcacacacaatgcactcagtggagctagagacgtcactgtgaggggtggggttagagaTAGGTTGGGATGAATGCATTGAAAAGCTTTGGATGCAACTAAGAGCTAGTGACAACaatgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactatgagctagtgacatcactgtgaggggtggggttagggatGGGTTTGGATGAATGCATTGAAAAGCTTTGGATGCAACTaagagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactaagagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactatgagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactatgagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactatgagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactatgagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactaagagctagtgacatcactgtgaggggtggggttaggatgagtgcattaaaaagcattggatgcaactatgagctagtgacatcactgtgaggggtggggttagggatGGGTTTGGATGAGTGCATTAAAAAGAATTGGATGCAACTAAGAGCTAGTGACAACACTGTGAGGGGTGGGGGTAGGTATGGGTTTGGATGAGTGtattaaaagcattggatgcaactAAGAGCTAGTGACttcactgtgaggggtggggttagggatGAGTTTGGATGTGTGCATTAAAGAGCATAGGATGCAACTAAGAGCTAGTGACttcactgtgaggggtggggttagggatGAGTTTGGATGTGTGCATTAAAGAGCATAGGATGCAACTAAGAGCTAgagacgtcactgtgaggggtggggttagagaTGGGTTAGGatgaatgcattaaaaagcattggatgcaactAAGAGCTAGTGACAACACTGTGAGGGTGGGGTTAGAGATGGGTTTGGatgaatgcattaaaaagcattggatgcaactaagattgcactgcaccaagtctgcatccagacaccTCTTAGTGAATGTGCTGAAAATGTGAAGCATACCATCTTATTTGTCCCAAAATGCAATGTGATTGCCTTAAGATGCATTAATTAGATGGAGGAGTAATCAACTCTATTTTTACCAGCATTTTCTTGTCTCTATTAAGTCTGAAGGTCTAAAGTTAACATATTTttgaacatacaaaataaaaatatatagaaaataagtTTCAAATCATTTTcttacagacacacatacacacgcatgcACCTACAAACAACTGTTTTAAGGTACATTTTGGAAAAATCTGTTTATACTTGCTACCGTTTTGCATACATGCACTAAACAGGGATAGGATGTTAAACaccattgaattgaattgaatgttgtttgacagattttagacaagctgtagaaaaatacaagtatcccatacattttgaaataaaaactgtcgaggataaaaacacaataaagccctgggcttgttTCCATTGTTGTCCTcgctgttaaataaaaaaaagtatgggtttaaaatacagattatgcataaaataaacagtacctgcacattttaaaacaggaacaaaattattcacaaaatacattcatgtttattattattattattattattaatattattattgttgtttttattattatgtttggatataacttttaaGAATGGCCTGTAGAGAGCAtcagatgttttaaaatattcaataagatttttttttgccagaaAGTTTCTCAAACATCTTTACAGATTCCTTGAATACATATTtatactggttaaaaaaaaaaaaataaaaattaaacattacatatattactgagcaacattttttaaattaaaaacctcAAAAGAAGGCATCTGTTCTGTATTTTTAGAAAACAATCATCTGAACGtgtattaaatattaacaaaaccTAAGATTCCCAGTTTATGATGCAGCACTAACTTTGATACACATTTTGGTTTCTCAACGCagttatttaagactttttagtgctacatttaaattaaatgccTCCAAAAATGACAGTGCTACTTTAAATTGTGCTGTCTACTTTCTAAATATTGTCAAACATGTGAAAAAATATGGATTATATCACTTCAATCAAACACAAAAATGGTAGCGTCCTTACTGTATGTGGTCAACAAAAGAAACTAGATGACGTCTAATAGTAATGTTTGATACGGCACCCCAAAGAAAATCCTACTGAAAGCTtattttttgagatatcaacttcaaatttgggaaataatttgttaaaatattaagcTTTGCTTTTTGATCaattttaggcaaaaaaagtttttaaaaacacattttatatctaaaataataataatgtatattataatatgtaCAATAAATTCATTTTAGAGTTTTCTTAAACTTAAAGGCACATGACTTTTGTTTaccgttttattttttattttgagtgaacGATGATGGAAATTGGTTTCCTCAAGTGGTTTGAGTTTCCTTGTCTTTTTGGGTTTTACCGTGTACactaaacaaaaatatgacaCTGAACATACAGATTTTTTTGTTAGTGTAAGTTTTAAGAATGGCCTGCAGAGAGCAGCagatgttttaaaacattcaagattttatttattttttactagaaAGTCTCTCAAATGTCTTTATAGTTTCTTGAATACATATTTATAGCAGTTCAAAGCCAAAAAATATATCACAGATATTACTCagcaacagttatttattaattaaaacccTCAAAAGATGACATCCATTCTGTATTTTTAGAAAATCAATCGTCTGAACGtgtattaaatattataacaaaactAAAGATTCTCAGTTTGTGATGCAGCACTAACTTTGATATGCATTTTGGTTTCTCAACGTAGTTAAGAGTTTTTAGAGGCTACATTTAAATTGAATACCACTAAAAGTGCCTGTACTACTTTAATAAGTGATATCTACTTCCTAAATATTATCAAAAGTTtgcaaaaaatatgaataatttcgCTCAAATCATACACAGAAAAGTGGCTGGATGTACTActgaaagctattttttttaagatatcaacttcaatttgggaaataatttgttcaaatttttagctttgtttttcgATCAATtttaggaaaaaatatttttaaaaacacattttatttaataaaataatatttataattcatttgttttactgttttcttaAACTTAAAGGCAtatgacttttgttttatttacgtttttatttttattttgagtgaaTGACGCAAACAATATAAGAGAATTCTAAAAGTGCCAGTACTTTAAAATGTGACTTTAAAATCTACTTCATAAATATtgtcaaaagttaaaaaaaaagacaaaaggataACATCGCTTAAATTATACATACAAGCAGAGGCGTCATTATAATGGTCAAAGTAAGCTGGATGTAGTCTAGTGGTGATGTTTGGTACTGCACCCACACAAAATACTACTGAAAGCTcttttttgagatatcaactttgatatttaatataatatatagtcaaatatttagCTTtggtttttagtcatttttaggctaaaacatgtttagaaaaaataca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000116445

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00048869 True 4889 mRNA 0.34 2 33266586 33275666

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024799 NA coding downstream 64396 33186873 ~ 33202190 (-)
XLOC_024798 NA coding downstream 259541 33004227 ~ 33007045 (-)
XLOC_024797 c2cd4a coding downstream 378471 32886143 ~ 32888115 (-)
XLOC_024796 tmem266 coding downstream 396792 32787363 ~ 32869794 (-)
XLOC_024795 isl2a coding downstream 514604 32746014 ~ 32751982 (-)
XLOC_024801 NA coding upstream 158746 33434412 ~ 33435148 (-)
XLOC_024802 NA coding upstream 475133 33750799 ~ 33762426 (-)
XLOC_024803 NA coding upstream 663447 33939113 ~ 33952194 (-)
XLOC_024804 NA coding upstream 687513 33963179 ~ 33970065 (-)
XLOC_024805 NA coding upstream 732141 34007807 ~ 34008484 (-)
XLOC_024794 NA non-coding downstream 735718 32518399 ~ 32530868 (-)
XLOC_024789 CR847962.1 non-coding downstream 1245591 32020881 ~ 32020995 (-)
XLOC_024783 CU651671.1 non-coding downstream 1588393 31678079 ~ 31678193 (-)

Expression


Co-expression Network