XLOC_024803


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024803
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 33939113 ~ 33952194 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00049416
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>TCONS_00049417
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Function

GO:

id name namespace
GO:0007399 nervous system development biological_process
GO:0050803 regulation of synapse structure or activity biological_process
GO:0099080 supramolecular complex cellular_component
GO:0099081 supramolecular polymer cellular_component
GO:0043005 neuron projection cellular_component
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GO:0005875 microtubule associated complex cellular_component
GO:0099512 supramolecular fiber cellular_component
GO:0099513 polymeric cytoskeletal fiber cellular_component
GO:0015631 tubulin binding molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00049416 False 682 lncRNA 0.45 2 33939113 33952164
TCONS_00049417 True 13082 lncRNA 0.42 1 33939113 33952194

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024802 NA coding downstream 176687 33750799 ~ 33762426 (-)
XLOC_024801 NA coding downstream 503965 33434412 ~ 33435148 (-)
XLOC_024800 CABZ01046954.1 coding downstream 663447 33266586 ~ 33275666 (-)
XLOC_024799 NA coding downstream 736923 33186873 ~ 33202190 (-)
XLOC_024798 NA coding downstream 932068 33004227 ~ 33007045 (-)
XLOC_024804 NA coding upstream 10985 33963179 ~ 33970065 (-)
XLOC_024805 NA coding upstream 55613 34007807 ~ 34008484 (-)
XLOC_024806 foxb1a coding upstream 201977 34154171 ~ 34156152 (-)
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XLOC_024811 NA non-coding upstream 689246 34641440 ~ 34643204 (-)

Expression


Co-expression Network