XLOC_024804


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024804
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 33963179 ~ 33970065 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00049418
ttgcctgtatgtttTATGAATCACAATGactacagtttcagctaaaaatccaTTTTAATGTTCTACAGAAagcattaaatcattttaattctcatttaaatgttttttaaaaatcttttaacaTTTATAATGCCCCTATTTACAAACAGAAGCCTGTTTTATTGTTGATGTATGCGTGTAATAGTCCACTGCCATAATTAAAGCTTCACAAAACTGCTTTATTTCAATCATATTTGACACTAGGAGCTTTTAAAGTGAATTTTTAAACAGCTCCCCATCTCTTTTTCTGCTGTGGAACTTCAACGACACAATCTGCAGACAGAAGTATGACACACATTGAATAAGAGCCCATTACAAGCGGTAAATTTTATTATGGGATAACAGCACATAAAGCACATCTAAAATCGATGTGTCCAATGCACTTTTAATAAAGGTAATATTAAAGGTACAGTTTCTAAGTACAATATAACAACATTCATATTAGAATGAAAAGTATTTAAAAGACAACATTaaatttcttatttttctttacaGCGGTATTTACAAAATGAATCAAAATACTTATTTCCATATTTAAGAATCAGACAAACGGAAGGAGCAAAACCACTATTGAGAAGAGACTATCTCCTAAAGAGAGTTCCAAAGAGCTGAATAAAAAGGAGCAAAATGCAACCCGTCCCGCTCCAGCCCTTGTGCCCTTCCCTTCAGCTCAACGAGAAATAGAAGTGAAACAACAAGGAGAACACGGAGTGGATTGTCTATTGTCCGCCATTTTGTCTCTGCGAATATCCAAAATACACCCAACCGACTGGATGAAATGTCCCATGTGAAGTTGTTCGGAGGGAAACGGAAAGAGAATGTCAGGACATCACAGAGACCATAAATGTTGTTTCCATGGCTATAAACAAACATGAAATGCCTCATTTACATACGAAAAATAAAAGTCGGGAACATCAGACAGAATTCACTTACGAGTGCAAACACGGTCGAAAAAACGGTGAAAACAATAACGCACGAATATATTTTCTGCATCCTGCACCACTGAGAGGCACTCAGCGTCGTTTGCTAAGAATTATTGCAAGTAGATTCTGCCTTGCTACAAAGATAAAAACAGGAAGTTTCGCAACAAAACTTCGCACAACCGCTTTTGTCCTGTACAGTTTTTAACACTTAaccatgtgagtgtgtgtaagtgtgactttgaaaatgaaaaacaaaacaaaactgaatgtatgaaaaaaaatatatatggaggGAGCCAAAAAGTGGCAGACAATCCGTTAGTTAATCGCGTGTTTAAAGTCCTTCCAGCGTCCAATACAAAAAATAAGCACTGGATAAGAAACGCCTCCCAAAAACGAACACAATACtgctgcttttttttaaattatccatTTTGTAAGCACAATTgtcaaaaatttaaaactgcaacGTTTAACTTAGCCGATACTTGCTAATAATCTTAAAAGTGGGAAGGAAACAAGCCGTGTCCCAAGACTAGCACACTGATACAGGTACTCGCTGGGTATTCGAAAGTAAATTTACTACTATCGTAATCTTTATCATTATAGTTATTataatcgttattattattattattattctttatcgagtcctaatattaataatgcatcaaTACTCAGTGAAATGAATGGACTAAGAGGGTGGCCTAGTCTATGaatccataatttttgttcacaAAAGTAACTTACCTAGCACCACACGTCAGTATAACACAAAAATTAATGTCCGCACACCCTACCGCTAATCGAACTAAGTCTAAAAGAGAGAAGTATACTCAAAACAGATATTGTACAGCATGATGTGTCtgataaaacagataaatatttCGCACTGAGCAGGTCTTAATAGCAGTATTCTCTTCTTACCTATACAGACAGAAGTTACAAAGTTACTTTTATACATGTGATCGATAGAACATTAAATATCGTGAATTAAAAGCCGAAAGGAGGACAGGGAAACGTAGCTGTACAGGCCGTTTTTGACGTTCGTAGTTCTCCACCCGGGAACAGAACTAGTcaatatacaaacaaaactaaaacgaACTGAAAAATGCAAAGCGGAAAAAGAAATTAAACGCGATAAATAAGAAAATGTATTTACATGCAGATGTTCAAAGCCTATGCACAAAATGAATCATAATACACCATATATATTATTGCTTGACATTCGTTTATGGCTAAAAGACTTTTCTTTTCGTCTATTATCTAAACATAGTTCACTTTTAATAACGCGCGTCAGCTGTGCtttaggaaagaaaaaaaacgcaAGGAAAATGAGTGACGTAAATCTTAGTAACCTTCAGCTCGAATGCTGTAGCAAGCATGACACATTTATCAGAATtgcgagaagaagaaaaaaacggtAATTGTGCCGAAGTCCGTGAGTGCATAGGCCTTGTTGCATAAATCTAATTGAAATGTTAACGTCGAAGTGCGGTGTGTCATGCTAGTACAGCCTTGTCAACGGATTTAAGCTCAGTGCTacgtaaaatattttaaatcctgGGAAAGTAACGTAAGATCTAACATACAGTTCACCATCTCACCCTGCTGCGCCTGATCGTTTAAAGCCTTGTCTGGGGGGTTTAACCTTAAGCAGACATTACAAATATCACAAAACACACAGACTTCCGCTTGTATATGCTTTCGCATCCACGTACGGATGTATATTGCTTCTTACAAAGAGGGGACCACAATTAACGAAAATAATAAAGAATTTACAATAAAGACAGAGGGAAAATGGATCTTCCACCTCTACACGTCTAAAAATACCACAGATTCGGAGCTGTTTAAGTACCTTGTGttagaaaaaataaatttttgtccCAAAAAAGTTCTCATAGCATATTGCTTTAAAACGTCAAATACAAATTACACTGACAAAATACGACATGCAAAAAAAGTGGCAAAACGTGACAGCTTTTATGGTGTTGTTCTGAATGAAGATCATTGGACAGCAAAGCTTGTTCATCAAGGGGACTCCACAGCAGTGGTTACCCTGTAGAAACCCGTATTTGTCGAGCGACGGACGTCTCAAGGTGGAGCAAAATCGTGAGGAGGTATTTGGCACATAGACTCGAACAATTATCAGCGACAATTAAAACAAATCCCAAtccagagaagaagaaaaaaacgcaCGTTGTAGCTAAGTAAATTAGCGTAGCACGCTTGAGGTTGGTATCTTGCTTTGTTTGAGTATAGGGAATTAGATCTTGGGTGACTTGATAAATCCAGTGGCCTACGGGGGGAATAAATGAAATGACACATTTCGCATTGTTTATGATGTACAACTGTCTTCCCTTGACTTGACAGCACTCATGCTAGTGAATAACGGGGTGCGACATGAGCACGAAATTGCCAAAGATGAAAAATGAGGATTAAAGAATGAACAGTGACAGATTTGTACTTTTAACACAATACCAGGTTCTTTTTTTGGTTCAGTTCTGTTCCTAGTGAGCTGCCTTGTATGTTATCTACATAGGCAGCATAATGTAACGTAGCAGAAGTGGTTTAGATCAATCTACATTCACAACATGTGTTTTGTCTCGTCTCACAATTGATATCTAATGTGTTTTaagcaacacaatctcatggcaattcgtaactttttaatttagcagGTAATTCGTATGacttcgtacaatctaatttgcacattttagtacgatttgctcatcccccaatgacggatGGAGGGAGGGGGGGTATGGGGGTTGTtagatgccacgcctcctttttaaaatcgtataatttcgtacgaattagctacttaactgacaaaacgtaaaacacttacgttttctcgtgagatcaggctggttttacgTTAGCAAGTAGCTATGCTAAATACATTCTACTTTAATAACCTTCATTAAGTTAACATTGCTATGCTAAACACATTATACATTAACAAGCTTCACAAAGCATAAACTTTGGGTGAGTATtaactataaaattaaattaaaaacattttttagtaTAGAATAGGATGTAATTAGCACGCCATgttggaagattttttttttaccgcaATACACAATTTAAAAGCAAATCAGTGTAGCACATATTTACTAATTCTCACCATTCTGGCAACACATTTTTGCTGTCTAGATAGGCAACAAAACCTTATTACTTGGGCTATTGTACATAGAAAACATCCCTGTCCACTACAAAAATACCATGTAGCATGTTTGTTTTCTCTTACAGttgatttcaatttaattttacacTAGCATGTTGCTATGCTAAAAGAATGACACAGCACATGCCTTaaaatttaaacataaattagTGAGGGGGAACACTTTTATTTCCCAacttttataaatgtttgtttaacaATGTCATGTAGGCGGCACCTATTTACCAAACGGTGTGTCTTCTCTCAATTGATTTCAATGGAGTTTTTACATCAGTATGCTGCTATGTTAAGTATTGAGCAAATTTCCCACAATTGTTGGGTAAATATTGCACTATTAACagcattttgtcattatttatgaTGCTGAATGGCGTAAATTCATAATTATCATATCTTTTGATCTCATATCTCCATGTTGGAATGGCTTTTCAGCAATATACGgccaaatttggtcaaaataaAGTAGTGAACACACATTTTTCGCTATGTAGGCAGCTCACTAGGTTTGGAACTGATCGCATTATATCAGTTTTCTCAATCATCACCGCATCTCTCTCCCTGAGCCGTGTAGTGCACAAACTGCTGATTTACAACTAAACATGAACCTGGATTGTCATTCATGATGGAATGCATTGACTAATCGTTTAGTGATGTGGTTTACTTATattaaaaatgctatttatttgtTCTAAACAGGCCATCAAGATCAAATTATTGAGCTTTAGATGTAACATAGAGCtgactaacatttttttttagctacCGGCTTCAGAATCGAGTTAGACAGACTCTTCCCTGAGGAAATTATGGGGGGAATGACACAAAAGCTACCAAGA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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00049418 True 6676 lncRNA 0.37 3 33963179 33970065

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024803 NA coding downstream 10985 33939113 ~ 33952194 (-)
XLOC_024802 NA coding downstream 200753 33750799 ~ 33762426 (-)
XLOC_024801 NA coding downstream 528031 33434412 ~ 33435148 (-)
XLOC_024800 CABZ01046954.1 coding downstream 687513 33266586 ~ 33275666 (-)
XLOC_024799 NA coding downstream 760989 33186873 ~ 33202190 (-)
XLOC_024805 NA coding upstream 37742 34007807 ~ 34008484 (-)
XLOC_024806 foxb1a coding upstream 184106 34154171 ~ 34156152 (-)
XLOC_024807 CU914545.1 coding upstream 285080 34255145 ~ 34255273 (-)
XLOC_024808 gcnt3 coding upstream 304626 34274691 ~ 34284144 (-)
XLOC_024809 NA coding upstream 508032 34478097 ~ 34512102 (-)
XLOC_024798 NA non-coding downstream 956134 33004227 ~ 33007045 (-)
XLOC_024811 NA non-coding upstream 671375 34641440 ~ 34643204 (-)
XLOC_024813 NA non-coding upstream 702003 34672068 ~ 34723976 (-)

Expression


Co-expression Network