XLOC_024816


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_024816
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 34933831 ~ 34938131 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00049422
tatatatatactgtatatggcaTTTACATACAGACATAATGCATAGCTTCAGGTTACAGGCTTTAAAAGTTATAATACACGTACAAAAAAAAGAGCATATTTGCATTTGATTGTGAACTGCAAGCTGCCATGAATGAATTTTGGTTCCAACATTTTTCTCCTCAACATAAAGGACAAATCAAACATAAAACTCTGGAGGAATAAGGAAACGAGGCATGGGTTTATAAAGTACATTCATCGTCTGAAGCATTGGTCTCAAATCTCACTCACAAGTGCAATTCTTTAACCTACTCATGGGtttttaaaacagttaagacAATGCATTGGTTCATCAGAAACATAAATGGAAATCATGTGACTGAACATAAAATCCACCATGGTGTGTGTGACAGGGGTGTGTGATATTAccgtaaataaaatacaatttcttttgataatgataattaaacaatattttgttgtgcatgtttttgtggaTGGTTTTACATCTGTTTtggataaataaatgcaaaatagaaTCTCCAGTAGgtggcgacaagaGCCAATCTAAACGAGCCATTTGTTGAATTACtcacttaaatgatttgttcaaaacagcTGACTCATCTATAAAGCATGTGGCTgtcttttaaatgaatcattgattcaGTGACTTCaatgatttattcagaaatttattcatttagggGGGAAAATGGCATTGTTGTTTTGACAAATATTTTCTACTTTGGTTTTGATTGGAACTTTTAATTAGCGAAAAAGTTAGATTTCTTTCGATAAAcagaattaaacaatattttgatgTGCATGTTTTTGTTGCTGATTTAATGCCTGTTTTAGATTAATAAATGTGAGACTAAAACAACCAGTTTGTGTCAACAAGTGCCTGTTTAAACGAGCCATTCGCTGAATTACTCACTTGTTCATTCTCTTGTTCAAAATAGCCAATCCGTTTAGAAATGAAGAATTTAACtgttttttaatgaatcattGATTCAGTTacacaaatgattcattcagaaattgATTAATTAGGGAACAAAACAgtgttgttttgaaaaaaaaaatctcaatattGTTAAGATTAAACAGTATTTTGACGAGCATGTTTTGTGGCTGGTTTTACGCCTGTCTtagataaataaatgttacacTAAAACCACCAGTAGGTGGCAACAAAAGCATGTTTTAATGAGCCATTTGTTGAATTACTTGTTCATTCACtttttcaaaacagctgatttatttggaaatgaaGCATGTGACTCGTTTTCCATGAATCACTGATTCAGttactcaaatgattcattcagaaattgattcattcaaaaacaaacCATCAAACAGTGCCGTTTTGACAAAAATCTTCTACTTTGGTTTTGTTTAGAACACATTCAATAAGCGGAACaaaaaaaaaggatgatattGTTGTCTGAAGTGTCAAAACAATAAATGGCAATGATATTCAGTGAAACATTACACTTACTTGCGTATTATTATCAAATCATTACAGGAAATATTACTGGATCTCCTAACTTAcaatcatttttgtttagttttttttgttcttttttttttatagtgattGACTTATTTAAAACGTTGACGATGAATATCACACACCCCGAACTCAAGAACAATCGCTAATTACAGCCAAGAGTCATCTGTCCTCTTATTGGACGCTTCAGAAGAAACCAAGTTCTCCTGGTCAGTAATACTTTCCTTTTTTTTGAAACATTACGGTATTGGTAAGTACAGTAGAGTGTAAAAGATTAAGGGCACTTAAAGCAGAGGCTGCATGTGCATTTGCTGTATTTAAAGTAAACCTCCCCATCTCAATAATGGTTAGATATTGCATCAGTAAAGCTTGTGCAGTGGTTATGAAGGAATGCTTgatcgtacaatctcattcatatacTGTTCCTATAAAAAGACATACTGCCGAAAATGTGCAATGAAGGAATGTCTTCAATACTGTGAAAGTCTTCTGCTATCCTACAATGTGAAATAATGTGCTCATGCATTAGATTCAACGCTAACATATTAACAAAGATTATACTGAAGCTATAAATGATTAGTGACAAACCATGCATCAAACAGTGCTAGTAATCGGACCAATGAAtttaaatcactttttacagCCGTGCATCAACAAAACGGCTTTAGATTGGTTATTATTTATGACTAAATGTACTTACAAAGGCTAGAAAATGTTCAATGGACTACAGAAATAATTAGTCCACAATTTCGTTAATTTCCTTCACATTTCCAGGCATGGAAATCAGAAAATTTCCTgatgtttgcagtttatttaagtgACGGGATACTGATCTAATGCTGATTAAGCAGCAGTATGTTAATATAcagcaaaacaaatgaaaatagaaatagtttgttttaaaaacatcaagGCCTGGAGCTGGTTTGGTCAAACGAGAAATATGATGTGTGTAAAAAAACTTCCTATATTTATACTGATTTGAAAATCATCTCAGAAGTGAATGAATCAGGGTCAGAAATTAGCTTTAGTAGCAATTAAGTggcagtttctgcattttttgaccaaaaatgaactttttttttgtctgttttgtcaaatatttcaATGCAATCAATcgattaatataataaaaacggTTACCAACAACACCAAACATGTTGCAATTGTATATAAATGATACATTTAAAGGAGGAACTCATTATATAACATGGTTGTACTATTATGATACTATTATTATTTGGTTGATCAGCGCTCTTGATGTTGTAATAATGGTTATAAATGCTAAAAATACATCATACGGGGCATGAAGTTGACTTTTTATTGCATcatatgaataaaaaatgcattgtttaGTCAAATATCTAATCAAAATGTTGTTATAttgagttttcttttctttttatctgAAAACAACAATtggttttcatttgttgtgactGGAAACCACAGATCGTCCACAAAATATGGATTTTATTTGAACTATTATGAAAAACAAGCttcctttttgttattttttgcaaaaaaaatgctctaaatcaccttttttattttaattttagagtCTATAAGACAAATCTCTTACATGGTTGTCGATTATGTGTCACTTTTGTTCGCATTGATGCCCTTTTTGTCACAAGACGCTTGTTGAATCCACCCTGAAATCAATCATATTCAAAACACTTACAGCTCAGAGAGGTTATGTTTGGTCGGCCGCATACAGGAATGCACTTAAAGCTTTGTTTTCTCCATATTCGCATATGCAGCAGTCTTAATGTTACTgccacattcacatacacacactgtataTTCACTCAAGATGATAACACACATATGTAACAGTCTTTGCCATGCAATACACATTATAAACATAAACACAAGTGAGCTACGTGAAAAAAACTGAGATAATACaagaataaatgttcatttagcaAAGCTTTAAGCCTGAAAAACATGTGAAAAGCTCTAGATGTGAAGGCACGACTGGTGTGTCCCTGATCTGAGGACAGTAAGATTGTGTTTagaaagacacacaaacacacatacgaacatatacacaaacaaacagacacacaaataaacacacatacacactgtgtTGGTTAGAAGTGTAACTGTGAAACACTGCTGAAgttgtgaatgaatgagtgaaggaAATCTCCAtcatctgctgtgtgtgtgagtgtgtgtgagtgtgtgtgagtgtgtgttttttacGTCAGCAACCCCAATCGAGCCAGTTTGGCTGAGAGGAACGAATGAAGCACAAACACCACAGGCTTTGGTCCCGAATGAAGCTCAAACACC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00049422 True 3805 lncRNA 0.33 2 34933831 34938131

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_024815 gabarapl2 coding downstream 88529 34835553 ~ 34845302 (-)
XLOC_024814 frs2b coding downstream 193204 34727928 ~ 34740627 (-)
XLOC_024813 NA coding downstream 209855 34672068 ~ 34723976 (-)
XLOC_024812 CABZ01080568.1 coding downstream 263418 34662358 ~ 34670413 (-)
XLOC_024811 NA coding downstream 290627 34641440 ~ 34643204 (-)
XLOC_024817 cdk10 coding upstream 18237 34956368 ~ 34973211 (-)
XLOC_024818 NA coding upstream 36952 34975083 ~ 34979558 (-)
XLOC_024819 NA coding upstream 64024 35002155 ~ 35042110 (-)
XLOC_024820 zgc:114046 coding upstream 106393 35044524 ~ 35045250 (-)
XLOC_024821 hist1h4l coding upstream 107672 35045803 ~ 35046114 (-)
XLOC_024809 NA non-coding downstream 421729 34478097 ~ 34512102 (-)
XLOC_024807 CU914545.1 non-coding downstream 678558 34255145 ~ 34255273 (-)
XLOC_024805 NA non-coding downstream 925347 34007807 ~ 34008484 (-)
XLOC_024823 NA non-coding upstream 113925 35052056 ~ 35116923 (-)
XLOC_024826 NA non-coding upstream 163994 35102125 ~ 35139520 (-)
XLOC_024851 NA non-coding upstream 333147 35271278 ~ 35276350 (-)

Expression


Co-expression Network