LOC110527416 (LOC106575305)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110527416
gene name LOC106575305
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 17536258 ~ 17662496 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021608675.2
ctggtctttgtggttgaatctgtgcttgaaattcactacttgattgagggaccttaaagataattgtatgtgtcagggtacagagatggggtagtcattcaaaaatcatgctaCCCACTACTATTGAACacggaatgagtccatgcaacttcttAAAgagatttgttaagcacattttacaTTCTGAACTTATTAAGGCTTGCCATAacgaaggggttgaatacttgactaACATTTCAGCTTCACATTTTTTATTGATTGCAAAACGTTTCTACAggcaaaattccactttgacattatggtatATCAATTTtaatattcaggctgtaacacaacaaaatgtggaaaatgttaaggggtgtgaatactttctgaaggcactttaggGCTCTGTCACCCTAACATAGCATGGCCTCACTGTGAAGTCGAGTCATGAGTTAATTTAGCCTAAAACTGTCTAATTCCAATTGTCTGTTATGAGTAGCATCATATCCATGCAAACTCTACAAAAATACACATTAGCCTACCTCAAACTTCTCAGCTTCTGCAGTGCAATTCCTTGAAGCCTTCGGTCATGCATTGCAAATGTGTTTAGTGGCAATGTCAGTCAACCTTGCTAAAGAAAGTAGAGTCCTCACTTCCAGACAGATTGATTGGCTACTATTCATTTCGCAAATAATCCTGATTGGACAGCTCTCTTGTCTGCTGCAGTACCGCATACAGTCACTATCACGTCTCCCCCACTCCTTTCTTGCGGTGAGATCAGATGCAGAGCCCAGCGCAGGACGGACACAGTTTCAGCACCTCTTGTCTTGGTGGGATGTAGACAACTAGACCGAGATGGAGTGAAGAGGAAAGAGCCTATCGTTAAGGGCAGGAGCCAGCTGTTTGAGAATCAAGTGCTGGCGAGAAGAATGCAAGGGAACACCCCTAATGGAATGGAATAGTTCAATGGCTGCATTGAGGAAAAACGACAACCCTCCTTTTCAACCAGAATCCCACCACTAGTCTGTATTAAAGCAGTCGAGGGTACTGAATTAATGTCAAGCATCtcgtggaggcagcatcatgctgcacCGCTGGAAGTAGCTGGAGGACCACCCATGGAGATTCCGCCTTCTCGACGTTCTCAATGCTCCTAACACACACCAAGTAAACAGAAATGCCTTCAAAGGTCAGCTGCTTATACTTGTTGACGGTCGTTTGCTGGGCTAGCGCTCTCTGGTACCTGAGTCTGTCCCGTCCCTCCACCTCTTACGTGGGCCAGCTGTCCATCCCCATCCGCCAGAAGACCAAGCTCACCAAGAACGTGACCTTCAACAATATACGGACTCGGCCACTCAACCCACACTCCTTCGACTTTGTCATCAATGAGCCCAAGAAGTGTGAGACGGTGGCACCTTTCTTAGTCATCCTGATCAGCACCACCCACAAGGAGTTTGATGCACGTCAAGCGATTCGAGAGACGTGGGGCGACGAGAGCACGTTCGGCGATGGCGTTCGCGTCCTCACACTCTTCCTGCTTGGGAGGAACACGGACCCGGTGCTCAACCAGATGGTGGAACAGGAGAGCCAGATCTTCCACGATGTCGTGGTGGAGGACTTCATAGACTCCTACCACAACCTCACCCTCAAGACCCTGATGGGCATGCGCTGGGTGGCCACCTTCTGCTCCAAGGCACAGTACGTCCTCAAGACGGACTCGGACATCTTCGTCAACATGGAGAACCTGGTCTACAACCTCCTCAAGCCCACCTCCAAGCCGCGGAGACGCTACTTCACGGGCTACGTCATCAACGGAGGTCCGATCAGAGACATGCGCAGTAAGTGGTACATGCCCAGAGACCTTTACCCTGAGGCTAAGTACCCGCCTTTCTGCTCGGGCACTGGGTACGTGTTCTCGGCAGATGTGGCCGAGCTCATCTACAAGACGTCCCTGCACACCAGACTGCTCCACCTGGAGGATGTGTACGTGGGGCTGTGTCTTCGCAAGCTGGGCATACACCCCTTCCAGAACAGTGGCTTCAACCACTGGAAGATGGCCTACAGTCTATGCCGCTACAGACGGGTCGTAACGGTCCACCAGATCTCCCCGGAGGAGATGCACCGCATCTGGAATGACATGACCAGCAAGAAACACCTCAAGTGTTAATCAGCTACCTACAGTTAGTGCCAATATGAGGAGGTCCggaattcttcttcttctcctttattgcttcttctcttcctcctcctctgccccttcctcctcttccgatCTCTGCTTTTCTTTGTCACTGTACAGCACATGACCCTGAGGGAACAGTACTGTAACAATAACCGTCTGGCCGTTTGCATAGTCCAAGAGACGCTTCGCTAAAAGCCTCTTTATCAGACCAAGGTTTCTCTCTGCCGTTGTAACTCCTGCATTCTCCCTCGTAGCTATTGATGAGTTTAAAGGCCACAGGTAAGAAAAGAAAATAATTATAGACATTttcagaaatacatttgattaaaatGACTCTATGACTTTACTTTACTCTTATGAAAATCAAATGATGTCCCACAATGCAACAGTATGCCATTTGCACCATATGTTGTTTATGAGATGACATCACTAAAACACAGAGGTAGAAGCTTAGCAGTGGAACAGAATAGCTCAGATGCTATTAGGCTAATCTATGTAGGCAACGCTGCTAATTTACAGAAAAGGTCTGGCCCTGTTACTGAAGTAGTAGGGATGATAAGAAATACCAAGATATACAACCTATGTAAAATGTTCTGCTGTCAGTTAGGTTGATAATGAATGTCCACTCTTAATTTGTATATTTAATAAAGATGTATTTGTGGGATATACTGTTTTGGTACCTCAACAGATGTTGTCATAGTGAAAAGACCATGATAAGTATACGTGCTGTAAACATAGATTGAGTGTTCATTGGAATGATCTAAGATTGTTAGAACAGGAGACTAACAGTTCACTGGACCTACTGTGTGACACGACGGACACACTTGCCTCTGCAATTGAGTtgtaatatactgttttaaagaTCAAACCTATTTTCTTACTATGTATTTGGAGTCCTTTGTATTGTACTAGGTAGAGAATGGCTTCATTTCTTGGACACCCGTATTTCTTATGGGACGGTACAAATGGCGATGTAACAATATTAACCACATGCATTCCCAGGTGAATGTTATTCTATCTGTATGTGATGTGCAATAACGTCTTCGCTCTTTAAGCCGCGCTGTGACGAGACAGACTGCAGAGTGTTATATTTTATATTACTTGAAGCCGCATTACATTAAAGACGTATTTCATTTGAGAGTGTATCCCTTTTTGTCCCGCGTATTTGGGATTTTAAAAAGGCTGTAATTTATTGTGTGTGATCCTACTAAGAGGGCAGTTTATAAGATTGTTTAATTATTCAATGAGTTTTATTTCAATACATGCAGTAGACTGCCAAATACCTATTTATACCTGAACTAATGACTTCAGCTTTACCCAAGTCCCTCTCTGTAGTTGCAGTGCATCCGGTAATGAATTGTAAACATGTTCGGCGCTCATTAAGATTGCCTATCAACACAACTCTCTGTGTAAAGCTGTCAACACGCCATGAACAACTACTCAGAGAAACGCCTTCATGCTATGACTCTGAACTACTCGACTGAATACTCAATATTTGCAtttgtagaggtgtgtgtgtgttttgagttgTCAATTAGGCTCCCCATTAGCTGACGCCattggcgacagctagtcttacttgGGTCCGACACATACATTACAGACatttaaaaatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgatgtaAGAATAGAGCTCCAGTAATTGGTTCTTCCTATCTGTGAGAGCAGGTTTGTCAGAtgcagacaggtgtgtgtgtgtgtggcggaggTGAGAACACTTTGAAACACAAGTTTACCATCATGGCTCCTGGGAGCCTCTAGGGAGTGAGGTAGATTCTATATAGAACAAAAGGGGATTCTCAACAGTATATATGTtgaacacacaaagacacactgtGGTAAAACATTTACAGTGTTCTCACAAACAATATTGTCATGAAATCTTTGGGGACAAACACATCCCTATGTCCTAACCGTTTTCCTCAAAATAAGAGTATTCCCAGATGCTGTTCTGGTTGAAAATCTATTTGGTTAACTTGTGATCAACTTGAAACCCCTTGAAATGTAATTGGACTTTTAATACTGTAGATAAATGGTGTTTTGATGGCTTGCTCCATTCTAAATGGATCCACTTAACCACATGTTCATTCCCAGAGATTGTTCAGTAGAATGGCCATTTAGCTGATGGTTTTCTATTAAATGACTCACGGGTGATATATTCAC
>XM_021608676.2
ctggtctttgtggttgaatctgtgcttgaaattcactacttgattgagggaccttaaagataattgtatgtgtcagggtacagagatggggtagtcattcaaaaatcatgctaCCCACTACTATTGAACacggaatgagtccatgcaacttcttAAAgagatttgttaagcacattttacaTTCTGAACTTATTAAGGCTTGCCATAacgaaggggttgaatacttgactaACATTTCAGCTTCACATTTTTTATTGATTGCAAAACGTTTCTACAggcaaaattccactttgacattatggtatATCAATTTtaatattcaggctgtaacacaacaaaatgtggaaaatgttaaggggtgtgaatactttctgaaggcactttaggGCTCTGTCACCCTAACATAGCATGGCCTCACTGTGAAGTCGAGTCATGAGTTAATTTAGCCTAAAACTGTCTAATTCCAATTGTCTGTTATGAGTAGCATCATATCCATGCAAACTCTACAAAAATACACATTAGCCTACCTCAAACTTCTCAGCTTCTGCAGTGCAATTCCTTGAAGCCTTCGGTCATGCATTGCAAATGTGTTTAGTGGCAATGTCAGTCAACCTTGCTAAAGAAAGTAGAGTCCTCACTTCCAGACAGATTGATTGGCTACTATTCATTTCGCAAATAATCCTGATTGGACAGCTCTCTTGTCTGCTGCAGTACCGCATACAGTCACTATCACGTCTCCCCCACTCCTTTCTTGCGGTGAGATCAGATGCAGAGCCCAGCGCAGGACGGACACAGTTTCAGCACCTCTTGTCTTGGTGGGATGTAGACAACTAGACCGTCCATAGCTGGGGAAGCAGCAGCTGCTGGGAGCAGGGCTGGATCCTGATAACCTACAcccaggagagatgatggggggagAGAATGGAGGACTGAGCGActgcctgcctgttacgcgaatgcagtaagaagccaagAGATGGAGTGAAGAGGAAAGAGCCTATCGTTAAGGGCAGGAGCCAGCTGTTTGAGAATCAAGTGCTGGCGAGAAGAATGCAAGGGAACACCCCTAATGGAATGGAATAGTTCAATGGCTGCATTGAGGAAAAACGACAACCCTCCTTTTCAACCAGAATCCCACCACTAGTCTGTATTAAAGCAGTCGAGGGTACTGAATTAATGTCAAGCATCtcgtggaggcagcatcatgctgcacCGCTGGAAGTAGCTGGAGGACCACCCATGGAGATTCCGCCTTCTCGACGTTCTCAATGCTCCTAACACACACCAAGTAAACAGAAATGCCTTCAAAGGTCAGCTGCTTATACTTGTTGACGGTCGTTTGCTGGGCTAGCGCTCTCTGGTACCTGAGTCTGTCCCGTCCCTCCACCTCTTACGTGGGCCAGCTGTCCATCCCCATCCGCCAGAAGACCAAGCTCACCAAGAACGTGACCTTCAACAATATACGGACTCGGCCACTCAACCCACACTCCTTCGACTTTGTCATCAATGAGCCCAAGAAGTGTGAGACGGTGGCACCTTTCTTAGTCATCCTGATCAGCACCACCCACAAGGAGTTTGATGCACGTCAAGCGATTCGAGAGACGTGGGGCGACGAGAGCACGTTCGGCGATGGCGTTCGCGTCCTCACACTCTTCCTGCTTGGGAGGAACACGGACCCGGTGCTCAACCAGATGGTGGAACAGGAGAGCCAGATCTTCCACGATGTCGTGGTGGAGGACTTCATAGACTCCTACCACAACCTCACCCTCAAGACCCTGATGGGCATGCGCTGGGTGGCCACCTTCTGCTCCAAGGCACAGTACGTCCTCAAGACGGACTCGGACATCTTCGTCAACATGGAGAACCTGGTCTACAACCTCCTCAAGCCCACCTCCAAGCCGCGGAGACGCTACTTCACGGGCTACGTCATCAACGGAGGTCCGATCAGAGACATGCGCAGTAAGTGGTACATGCCCAGAGACCTTTACCCTGAGGCTAAGTACCCGCCTTTCTGCTCGGGCACTGGGTACGTGTTCTCGGCAGATGTGGCCGAGCTCATCTACAAGACGTCCCTGCACACCAGACTGCTCCACCTGGAGGATGTGTACGTGGGGCTGTGTCTTCGCAAGCTGGGCATACACCCCTTCCAGAACAGTGGCTTCAACCACTGGAAGATGGCCTACAGTCTATGCCGCTACAGACGGGTCGTAACGGTCCACCAGATCTCCCCGGAGGAGATGCACCGCATCTGGAATGACATGACCAGCAAGAAACACCTCAAGTGTTAATCAGCTACCTACAGTTAGTGCCAATATGAGGAGGTCCggaattcttcttcttctcctttattgcttcttctcttcctcctcctctgccccttcctcctcttccgatCTCTGCTTTTCTTTGTCACTGTACAGCACATGACCCTGAGGGAACAGTACTGTAACAATAACCGTCTGGCCGTTTGCATAGTCCAAGAGACGCTTCGCTAAAAGCCTCTTTATCAGACCAAGGTTTCTCTCTGCCGTTGTAACTCCTGCATTCTCCCTCGTAGCTATTGATGAGTTTAAAGGCCACAGGTAAGAAAAGAAAATAATTATAGACATTttcagaaatacatttgattaaaatGACTCTATGACTTTACTTTACTCTTATGAAAATCAAATGATGTCCCACAATGCAACAGTATGCCATTTGCACCATATGTTGTTTATGAGATGACATCACTAAAACACAGAGGTAGAAGCTTAGCAGTGGAACAGAATAGCTCAGATGCTATTAGGCTAATCTATGTAGGCAACGCTGCTAATTTACAGAAAAGGTCTGGCCCTGTTACTGAAGTAGTAGGGATGATAAGAAATACCAAGATATACAACCTATGTAAAATGTTCTGCTGTCAGTTAGGTTGATAATGAATGTCCACTCTTAATTTGTATATTTAATAAAGATGTATTTGTGGGATATACTGTTTTGGTACCTCAACAGATGTTGTCATAGTGAAAAGACCATGATAAGTATACGTGCTGTAAACATAGATTGAGTGTTCATTGGAATGATCTAAGATTGTTAGAACAGGAGACTAACAGTTCACTGGACCTACTGTGTGACACGACGGACACACTTGCCTCTGCAATTGAGTtgtaatatactgttttaaagaTCAAACCTATTTTCTTACTATGTATTTGGAGTCCTTTGTATTGTACTAGGTAGAGAATGGCTTCATTTCTTGGACACCCGTATTTCTTATGGGACGGTACAAATGGCGATGTAACAATATTAACCACATGCATTCCCAGGTGAATGTTATTCTATCTGTATGTGATGTGCAATAACGTCTTCGCTCTTTAAGCCGCGCTGTGACGAGACAGACTGCAGAGTGTTATATTTTATATTACTTGAAGCCGCATTACATTAAAGACGTATTTCATTTGAGAGTGTATCCCTTTTTGTCCCGCGTATTTGGGATTTTAAAAAGGCTGTAATTTATTGTGTGTGATCCTACTAAGAGGGCAGTTTATAAGATTGTTTAATTATTCAATGAGTTTTATTTCAATACATGCAGTAGACTGCCAAATACCTATTTATACCTGAACTAATGACTTCAGCTTTACCCAAGTCCCTCTCTGTAGTTGCAGTGCATCCGGTAATGAATTGTAAACATGTTCGGCGCTCATTAAGATTGCCTATCAACACAACTCTCTGTGTAAAGCTGTCAACACGCCATGAACAACTACTCAGAGAAACGCCTTCATGCTATGACTCTGAACTACTCGACTGAATACTCAATATTTGCAtttgtagaggtgtgtgtgtgttttgagttgTCAATTAGGCTCCCCATTAGCTGACGCCattggcgacagctagtcttacttgGGTCCGACACATACATTACAGACatttaaaaatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgatgtaAGAATAGAGCTCCAGTAATTGGTTCTTCCTATCTGTGAGAGCAGGTTTGTCAGAtgcagacaggtgtgtgtgtgtgtggcggaggTGAGAACACTTTGAAACACAAGTTTACCATCATGGCTCCTGGGAGCCTCTAGGGAGTGAGGTAGATTCTATATAGAACAAAAGGGGATTCTCAACAGTATATATGTtgaacacacaaagacacactgtGGTAAAACATTTACAGTGTTCTCACAAACAATATTGTCATGAAATCTTTGGGGACAAACACATCCCTATGTCCTAACCGTTTTCCTCAAAATAAGAGTATTCCCAGATGCTGTTCTGGTTGAAAATCTATTTGGTTAACTTGTGATCAACTTGAAACCCCTTGAAATGTAATTGGACTTTTAATACTGTAGATAAATGGTGTTTTGATGGCTTGCTCCATTCTAAATGGATCCACTTAACCACATGTTCATTCCCAGAGATTGTTCAGTAGAATGGCCATTTAGCTGATGGTTTTCTATTAAATGACTCACGGGTGATATATTCAC
>XM_021608677.2
ctggtctttgtggttgaatctgtgcttgaaattcactacttgattgagggaccttaaagataattgtatgtgtcagggtacagagatggggtagtcattcaaaaatcatgctaCCCACTACTATTGAACacggaatgagtccatgcaacttcttAAAgagatttgttaagcacattttacaTTCTGAACTTATTAAGGCTTGCCATAacgaaggggttgaatacttgactaACATTTCAGCTTCACATTTTTTATTGATTGCAAAACGTTTCTACAggcaaaattccactttgacattatggtatATCAATTTtaatattcaggctgtaacacaacaaaatgtggaaaatgttaaggggtgtgaatactttctgaaggcactttaggGCTCTGTCACCCTAACATAGCATGGCCTCACTGTGAAGTCGAGTCATGAGTTAATTTAGCCTAAAACTGTCTAATTCCAATTGTCTGTTATGAGTAGCATCATATCCATGCAAACTCTACAAAAATACACATTAGCCTACCTCAAACTTCTCAGCTTCTGCAGTGCAATTCCTTGAAGCCTTCGGTCATGCATTGCAAATGTGTTTAGTGGCAATGTCAGTCAACCTTGCTAAAGAAAGTAGAGTCCTCACTTCCAGACAGATTGATTGGCTACTATTCATTTCGCAAATAATCCTGATTGGACAGCTCTCTTGTCTGCTGCAGTACCGCATACAGTCACTATCACGTCTCCCCCACTCCTTTCTTGCGGTGAGATCAGATGCAGAGCCCAGCGCAGGACGGACACAGTTTCAGCACCTCTTGTCTTGGTGGGATGTAGACAACTAGACCGGCGGAGTATGCAGATGGCTTGTGATCATTAAACACAGCTCATTGCAGTCCATAGCTGGGGAAGCAGCAGCTGCTGGGAGCAGGGCTGGATCCTGATAACCTACAcccaggagagatgatggggggagAGAATGGAGGACTGAGCGActgcctgcctgttacgcgaatgcagtaagaagccaagAGATGGAGTGAAGAGGAAAGAGCCTATCGTTAAGGGCAGGAGCCAGCTGTTTGAGAATCAAGTGCTGGCGAGAAGAATGCAAGGGAACACCCCTAATGGAATGGAATAGTTCAATGGCTGCATTGAGGAAAAACGACAACCCTCCTTTTCAACCAGAATCCCACCACTAGTCTGTATTAAAGCAGTCGAGGGTACTGAATTAATGTCAAGCATCtcgtggaggcagcatcatgctgcacCGCTGGAAGTAGCTGGAGGACCACCCATGGAGATTCCGCCTTCTCGACGTTCTCAATGCTCCTAACACACACCAAGTAAACAGAAATGCCTTCAAAGGTCAGCTGCTTATACTTGTTGACGGTCGTTTGCTGGGCTAGCGCTCTCTGGTACCTGAGTCTGTCCCGTCCCTCCACCTCTTACGTGGGCCAGCTGTCCATCCCCATCCGCCAGAAGACCAAGCTCACCAAGAACGTGACCTTCAACAATATACGGACTCGGCCACTCAACCCACACTCCTTCGACTTTGTCATCAATGAGCCCAAGAAGTGTGAGACGGTGGCACCTTTCTTAGTCATCCTGATCAGCACCACCCACAAGGAGTTTGATGCACGTCAAGCGATTCGAGAGACGTGGGGCGACGAGAGCACGTTCGGCGATGGCGTTCGCGTCCTCACACTCTTCCTGCTTGGGAGGAACACGGACCCGGTGCTCAACCAGATGGTGGAACAGGAGAGCCAGATCTTCCACGATGTCGTGGTGGAGGACTTCATAGACTCCTACCACAACCTCACCCTCAAGACCCTGATGGGCATGCGCTGGGTGGCCACCTTCTGCTCCAAGGCACAGTACGTCCTCAAGACGGACTCGGACATCTTCGTCAACATGGAGAACCTGGTCTACAACCTCCTCAAGCCCACCTCCAAGCCGCGGAGACGCTACTTCACGGGCTACGTCATCAACGGAGGTCCGATCAGAGACATGCGCAGTAAGTGGTACATGCCCAGAGACCTTTACCCTGAGGCTAAGTACCCGCCTTTCTGCTCGGGCACTGGGTACGTGTTCTCGGCAGATGTGGCCGAGCTCATCTACAAGACGTCCCTGCACACCAGACTGCTCCACCTGGAGGATGTGTACGTGGGGCTGTGTCTTCGCAAGCTGGGCATACACCCCTTCCAGAACAGTGGCTTCAACCACTGGAAGATGGCCTACAGTCTATGCCGCTACAGACGGGTCGTAACGGTCCACCAGATCTCCCCGGAGGAGATGCACCGCATCTGGAATGACATGACCAGCAAGAAACACCTCAAGTGTTAATCAGCTACCTACAGTTAGTGCCAATATGAGGAGGTCCggaattcttcttcttctcctttattgcttcttctcttcctcctcctctgccccttcctcctcttccgatCTCTGCTTTTCTTTGTCACTGTACAGCACATGACCCTGAGGGAACAGTACTGTAACAATAACCGTCTGGCCGTTTGCATAGTCCAAGAGACGCTTCGCTAAAAGCCTCTTTATCAGACCAAGGTTTCTCTCTGCCGTTGTAACTCCTGCATTCTCCCTCGTAGCTATTGATGAGTTTAAAGGCCACAGGTAAGAAAAGAAAATAATTATAGACATTttcagaaatacatttgattaaaatGACTCTATGACTTTACTTTACTCTTATGAAAATCAAATGATGTCCCACAATGCAACAGTATGCCATTTGCACCATATGTTGTTTATGAGATGACATCACTAAAACACAGAGGTAGAAGCTTAGCAGTGGAACAGAATAGCTCAGATGCTATTAGGCTAATCTATGTAGGCAACGCTGCTAATTTACAGAAAAGGTCTGGCCCTGTTACTGAAGTAGTAGGGATGATAAGAAATACCAAGATATACAACCTATGTAAAATGTTCTGCTGTCAGTTAGGTTGATAATGAATGTCCACTCTTAATTTGTATATTTAATAAAGATGTATTTGTGGGATATACTGTTTTGGTACCTCAACAGATGTTGTCATAGTGAAAAGACCATGATAAGTATACGTGCTGTAAACATAGATTGAGTGTTCATTGGAATGATCTAAGATTGTTAGAACAGGAGACTAACAGTTCACTGGACCTACTGTGTGACACGACGGACACACTTGCCTCTGCAATTGAGTtgtaatatactgttttaaagaTCAAACCTATTTTCTTACTATGTATTTGGAGTCCTTTGTATTGTACTAGGTAGAGAATGGCTTCATTTCTTGGACACCCGTATTTCTTATGGGACGGTACAAATGGCGATGTAACAATATTAACCACATGCATTCCCAGGTGAATGTTATTCTATCTGTATGTGATGTGCAATAACGTCTTCGCTCTTTAAGCCGCGCTGTGACGAGACAGACTGCAGAGTGTTATATTTTATATTACTTGAAGCCGCATTACATTAAAGACGTATTTCATTTGAGAGTGTATCCCTTTTTGTCCCGCGTATTTGGGATTTTAAAAAGGCTGTAATTTATTGTGTGTGATCCTACTAAGAGGGCAGTTTATAAGATTGTTTAATTATTCAATGAGTTTTATTTCAATACATGCAGTAGACTGCCAAATACCTATTTATACCTGAACTAATGACTTCAGCTTTACCCAAGTCCCTCTCTGTAGTTGCAGTGCATCCGGTAATGAATTGTAAACATGTTCGGCGCTCATTAAGATTGCCTATCAACACAACTCTCTGTGTAAAGCTGTCAACACGCCATGAACAACTACTCAGAGAAACGCCTTCATGCTATGACTCTGAACTACTCGACTGAATACTCAATATTTGCAtttgtagaggtgtgtgtgtgttttgagttgTCAATTAGGCTCCCCATTAGCTGACGCCattggcgacagctagtcttacttgGGTCCGACACATACATTACAGACatttaaaaatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgatgtaAGAATAGAGCTCCAGTAATTGGTTCTTCCTATCTGTGAGAGCAGGTTTGTCAGAtgcagacaggtgtgtgtgtgtgtggcggaggTGAGAACACTTTGAAACACAAGTTTACCATCATGGCTCCTGGGAGCCTCTAGGGAGTGAGGTAGATTCTATATAGAACAAAAGGGGATTCTCAACAGTATATATGTtgaacacacaaagacacactgtGGTAAAACATTTACAGTGTTCTCACAAACAATATTGTCATGAAATCTTTGGGGACAAACACATCCCTATGTCCTAACCGTTTTCCTCAAAATAAGAGTATTCCCAGATGCTGTTCTGGTTGAAAATCTATTTGGTTAACTTGTGATCAACTTGAAACCCCTTGAAATGTAATTGGACTTTTAATACTGTAGATAAATGGTGTTTTGATGGCTTGCTCCATTCTAAATGGATCCACTTAACCACATGTTCATTCCCAGAGATTGTTCAGTAGAATGGCCATTTAGCTGATGGTTTTCTATTAAATGACTCACGGGTGATATATTCAC
>XR_005052540.1
ctggtctttgtggttgaatctgtgcttgaaattcactacttgattgagggaccttaaagataattgtatgtgtcagggtacagagatggggtagtcattcaaaaatcatgctaCCCACTACTATTGAACacggaatgagtccatgcaacttcttAAAgagatttgttaagcacattttacaTTCTGAACTTATTAAGGCTTGCCATAacgaaggggttgaatacttgactaACATTTCAGCTTCACATTTTTTATTGATTGCAAAACGTTTCTACAggcaaaattccactttgacattatggtatATCAATTTtaatattcaggctgtaacacaacaaaatgtggaaaatgttaaggggtgtgaatactttctgaaggcactttaggGCTCTGTCACCCTAACATAGCATGGCCTCACTGTGAAGTCGAGTCATGAGTTAATTTAGCCTAAAACTGTCTAATTCCAATTGTCTGTTATGAGTAGCATCATATCCATGCAAACTCTACAAAAATACACATTAGCCTACCTCAAACTTCTCAGCTTCTGCAGTGCAATTCCTTGAAGCCTTCGGTCATGCATTGCAAATGTGTTTAGTGGCAATGTCAGTCAACCTTGCTAAAGAAAGTAGAGTCCTCACTTCCAGACAGATTGATTGGCTACTATTCATTTCGCAAATAATCCTGATTGGACAGCTCTCTTGTCTGCTGCAGTACCGCATACAGTCACTATCACGTCTCCCCCACTCCTTTCTTGCGGTGAGATCAGATGCAGAGCCCAGCGCAGGACGGACACAGTTTCAGCACCTCTTGTCTTGGTGGGATGTAGACAACTAGACCGGCGGAGTATGCAGATGGCTTGTGATCATTAAACACAGCTCATTGCAGTCCATAGCTGGGGAAGCAGCAGCTGCTGGGAGCAGGGCTGGATCCTGATAACCTACAcccaggagagatgatggggggagAGAATGGAGGACTGAGCGActgcctgcctgttacgcgaatgcagtaagaagccaagAGATGGAGTGAAGAGGAAAGAGCCTATCGTTAAGGGCAGGAGCCAGCTGTTTGAGGCCCAGGCATGGATCAAAGCTGGCGAGACATTCAATAACGTCATCTTCACAGACGAATCAACCGTGGCCCTTGAGCAATTGGCTCAAAATTGCTACAGAAAAAAAGGAAGAAGATCAAGTAAGCCGAGTACCAAGCATCCCCTCAAACTCCATGTTTGGGGGGCAATTTCTTGCCAGGGACCAGGCCCATATTTGATTTTTGATGGTATCATGGCTCGAGATTTCTTTCAGGAAGAAAACATCAAGAGATATGCTGGACTCTAGGTCAGAGAGGTATTTCTGGGTACACATCATTTCTATCAAGacaatgacccaaaacacactgcCGCCCGGGTTTGCATTGCAAATGAGGGCATAAACTGGGTCAGAACGCCAACAGAGTCTCCTGATTTCAACCCGATCGAACTTGTTAGGCATCAACTGAAAACATGAATCCGTATCTCTGCCAAGCCGACAGGCAAAGATGAACTGGTCAAGACCATCGAGATGTTTTGGCGAGAGAAATTGACGATACAACAATGGAACAAATACATTGATCATCTTAGCAAGGTTTTACCTGTGGTCCTGGAGCTGGGGGGAagatcaaatgtatttaatataaATATCTGCGTTTGAATGTCTTTTttcttgttattttattgtattaacgaaagcataaagatgttgatgaagaaatgctgtactgctgttttgagttagaaatgtaacactttagAGTACTCTAGCATTGAATACAATGCAAGTTGAGGGATTTTCACAACAGTAGCCGGGCTGTAAaaagtatattgtcctgctaataggaaaCATTTGCATGACGTGctacattctttattgtaaccacaattCCGCACATcatttgtatctacctttccaattacttttagagtttgggatttacttttaattattagttacattgttttagttcgAATGTGCAGACTTTTCttctttaaattattattttatgtagGATGCTACATTTTTGACCAGTTGCAATTGTAAGTAGGCCTAATTAAAATCCTACTTCTATTAGGCTGTCAAGGCTcatagcctacctcagccagttaagttaGTTTATATAGGTCTGGGCTCCGAAGAAATAGACTCCAattaagccctcttgttgtttgtaaagtcaaattaaaattcatttttttgttgaaatgaaTTGCTCGACTGGTGTAGGTTTTTTCCATCTGTTGGTGTGCAACACTTGCATAACAAGTCAGCTATATTTTCAGC
>XR_005052541.1
ctggtctttgtggttgaatctgtgcttgaaattcactacttgattgagggaccttaaagataattgtatgtgtcagggtacagagatggggtagtcattcaaaaatcatgctaCCCACTACTATTGAACacggaatgagtccatgcaacttcttAAAgagatttgttaagcacattttacaTTCTGAACTTATTAAGGCTTGCCATAacgaaggggttgaatacttgactaACATTTCAGCTTCACATTTTTTATTGATTGCAAAACGTTTCTACAggcaaaattccactttgacattatggtatATCAATTTtaatattcaggctgtaacacaacaaaatgtggaaaatgttaaggggtgtgaatactttctgaaggcactttaggGCTCTGTCACCCTAACATAGCATGGCCTCACTGTGAAGTCGAGTCATGAGTTAATTTAGCCTAAAACTGTCTAATTCCAATTGTCTGTTATGAGTAGCATCATATCCATGCAAACTCTACAAAAATACACATTAGCCTACCTCAAACTTCTCAGCTTCTGCAGTGCAATTCCTTGAAGCCTTCGGTCATGCATTGCAAATGTGTTTAGTGGCAATGTCAGTCAACCTTGCTAAAGAAAGTAGAGTCCTCACTTCCAGACAGATTGATTGGCTACTATTCATTTCGCAAATAATCCTGATTGGACAGCTCTCTTGTCTGCTGCAGTACCGCATACAGTCACTATCACGTCTCCCCCACTCCTTTCTTGCGGTGAGATCAGATGCAGAGCCCAGCGCAGGACGGACACAGTTTCAGCACCTCTTGTCTTGGTGGGATGTAGACAACTAGACCGAGATGGAGTGAAGAGGAAAGAGCCTATCGTTAAGGGCAGGAGCCAGCTGTTTGAGGCCCAGGCATGGATCAAAGCTGGCGAGACATTCAATAACGTCATCTTCACAGACGAATCAACCGTGGCCCTTGAGCAATTGGCTCAAAATTGCTACAGAAAAAAAGGAAGAAGATCAAGTAAGCCGAGTACCAAGCATCCCCTCAAACTCCATGTTTGGGGGGCAATTTCTTGCCAGGGACCAGGCCCATATTTGATTTTTGATGGTATCATGGCTCGAGATTTCTTTCAGGAAGAAAACATCAAGAGATATGCTGGACTCTAGGTCAGAGAGGTATTTCTGGGTACACATCATTTCTATCAAGacaatgacccaaaacacactgcCGCCCGGGTTTGCATTGCAAATGAGGGCATAAACTGGGTCAGAACGCCAACAGAGTCTCCTGATTTCAACCCGATCGAACTTGTTAGGCATCAACTGAAAACATGAATCCGTATCTCTGCCAAGCCGACAGGCAAAGATGAACTGGTCAAGACCATCGAGATGTTTTGGCGAGAGAAATTGACGATACAACAATGGAACAAATACATTGATCATCTTAGCAAGGTTTTACCTGTGGTCCTGGAGCTGGGGGGAagatcaaatgtatttaatataaATATCTGCGTTTGAATGTCTTTTttcttgttattttattgtattaacgaaagcataaagatgttgatgaagaaatgctgtactgctgttttgagttagaaatgtaacactttagAGTACTCTAGCATTGAATACAATGCAAGTTGAGGGATTTTCACAACAGTAGCCGGGCTGTAAaaagtatattgtcctgctaataggaaaCATTTGCATGACGTGctacattctttattgtaaccacaattCCGCACATcatttgtatctacctttccaattacttttagagtttgggatttacttttaattattagttacattgttttagttcgAATGTGCAGACTTTTCttctttaaattattattttatgtagGATGCTACATTTTTGACCAGTTGCAATTGTAAGTAGGCCTAATTAAAATCCTACTTCTATTAGGCTGTCAAGGCTcatagcctacctcagccagttaagttaGTTTATATAGGTCTGGGCTCCGAAGAAATAGACTCCAattaagccctcttgttgtttgtaaagtcaaattaaaattcatttttttgttgaaatgaaTTGCTCGACTGGTGTAGGTTTTTTCCATCTGTTGGTGTGCAACACTTGCATAACAAGTCAGCTATATTTTCAG
>TU662436
gacaggtgtgtgtgtgtgtggcggaggTGAGAACACTTTGAAACACAAGTTTACCATCATGGCTCCTGGGAGCCTCTAGGGAGTGAGGTAGATTCTATATAGAACAAAAGGGGATTCTCAACAGTATATATGTtgaacacacaaagacacactgtGGTAAAACATTTACAGTGTTCTCACAAACAATATTGTCATGAAATCTTTGGGGACAAACACATCCCTATGTCCTAACCGTTTTCCTCAAAATAAGAGTATTCCCAGATGCTGTTCTGGTTGAAAATCTATTTGGTTAACTTGTGATCAACTTGAAACCCCTTGAAATGTAATTGGACTTTTAATACTGTAGATAAATGGTGTTTTGATGGCTTGCTCCATTCTAAATGGATCCACTTAACCACATGTTCATTCCCAGAGATTGTTCAGTAGAATGGCCATTTAGCTGATGGTTTTCTATTAAATGACTCACGGGTGATATATTCACTATACGACTCATTTTGTGTTCCATAGATTGCAGTTATATTTGCGGTGTTGTACAATAAAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021608675.2 False 4435 mRNA 0.44 3 17536318 17662496
XM_021608676.2 False 4571 mRNA 0.45 4 17536318 17662496
XM_021608677.2 False 4618 mRNA 0.45 4 17536318 17662496
XR_005052540.1 False 2318 mRNA 0.41 7 17542876 17662496
XR_005052541.1 False 2134 mRNA 0.40 6 17542877 17662496
TU662436 True 541 lncRNA 0.38 1 17536258 17536798

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110527417 LOC106575307 coding downstream 54350 17474265 ~ 17481968 (-)
LOC110527413 LOC106575308 coding downstream 74106 17431894 ~ 17462212 (-)
LOC110527414 LOC106574549 coding downstream 106230 17426540 ~ 17430088 (-)
LOC110527411 LOC106574553 coding downstream 111307 17406916 ~ 17425011 (-)
LOC110527412 LOC106574553 coding downstream 119835 17413180 ~ 17416483 (-)
LOC110528801 LOC106575303 coding upstream 3017 17665513 ~ 17714934 (-)
LOC110527420 LOC106575301 coding upstream 92830 17755326 ~ 17803651 (-)
LOC110527099 LOC106575332 coding upstream 161030 17823526 ~ 17827349 (-)
LOC110527421 NA coding upstream 272298 17934794 ~ 17940045 (-)
LOC110527423 gran coding upstream 417495 18079991 ~ 18090271 (-)
G580537 NA non-coding downstream 643 17535429 ~ 17535675 (-)
G580536 NA non-coding downstream 900 17535198 ~ 17535418 (-)
G580528 LOC100194703 non-coding downstream 9504 17526589 ~ 17526814 (-)
G580527 LOC100194703 non-coding downstream 9790 17526265 ~ 17526528 (-)
G580526 NA non-coding downstream 12061 17524027 ~ 17524257 (-)
G580648 NA non-coding upstream 85192 17747688 ~ 17750095 (-)
G580657 NA non-coding upstream 111289 17773785 ~ 17774331 (-)
G580674 NA non-coding upstream 155614 17818110 ~ 17822171 (-)
G580729 NA non-coding upstream 250847 17913343 ~ 17913585 (-)
G580737 NA non-coding upstream 263253 17925749 ~ 17927237 (-)
G580487 NA other downstream 135782 17397857 ~ 17400536 (-)
LOC110527396 LOC106574529 other downstream 735632 16797680 ~ 16800686 (-)
LOC110528867 LOC106575374 other downstream 975173 16559930 ~ 16635251 (-)
G579278 NA other downstream 1070784 16464942 ~ 16465534 (-)
LOC110528887 LOC106574501 other downstream 1215554 16316980 ~ 16320794 (-)
G581089 LOC106575297 other upstream 380431 18042927 ~ 18043380 (-)
G581174 LOC101077481 other upstream 554662 18217158 ~ 18235038 (-)
G583661 NA other upstream 2553153 20215649 ~ 20249985 (-)
otos2 LOC106575250 other upstream 3110371 20772867 ~ 20778065 (-)
LOC110527470 LOC103366558 other upstream 3175992 20838415 ~ 20839399 (-)
G580539 NA non-coding upstream 8694 17545492 ~ 17545696 (-)
G580540 NA non-coding upstream 9896 17546694 ~ 17546937 (-)
G580545 NA non-coding upstream 29293 17566091 ~ 17566509 (-)
G580549 NA non-coding upstream 33331 17570129 ~ 17570373 (-)
G580568 NA non-coding upstream 52561 17589359 ~ 17589640 (-)

Expression


Co-expression Network