LOC118965286


Basic Information

Item Value
gene id LOC118965286
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 34726401 ~ 34728810 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036983166.1
GGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGTAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATTGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGTAGGAGCTGTGTTATCCAACATGAAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCAGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGTAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACGTGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACCGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATAGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCATCATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGAGTTATCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGCAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTCATGAGGTACTGGATGGAAGGAGTTTGAAAGCAGTTGTTAATAGGTTTGTGGAGAGAAGGCCTTAACTCGAATTTCTGGTGTAATGTAGGGATTgaaacccccctccccccaaaaaaaa
>XR_005052572.1
GTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGTAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATTGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGTAGGAGCTGTGTTATCCAACATGAAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCAGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGTAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACGTGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACCGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATAGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCATCATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGAGTTATCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGCAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTCATGAGGTACTGGATGGAAGGAGTTTGAAAGCAGTTGTTAATAGGTTTGTGGAGAGAAGGCCTTAACTCGAATTTCTGGTGTAATGTAGGGATTgaaacccccctccccccaaaaaaaaa
>XM_036983167.1
ATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGTAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATTGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGTAGGAGCTGTGTTATCCAACATGAAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCAGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGTAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACGTGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACCGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATAGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGAGTTATCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGCAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTCATGAGGTACTGGATGGAAGGAGTTTGAAAGCAGTTGTTAATAGGTTTGTGGAGAGAAGGCCTTAACTCGAATTTCTGGTGTAATGTAGGGATTgaaacccccctccccccaa
>XM_036983169.1
ATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCAGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGTAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAAGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACGTGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACCGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGGTATAGGATGGAAGGAGATGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATAGAAGGAGCTGTGTTGTCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGGGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAAGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACATGGAGGTGATGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCATCATGGAGGTGATGTTGTCAGGAGTTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTATTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTGTTATCAGGAGGTACTGGATGGAAGGAGCTGTGTTATCCAACACTGTTAACGTGGAGGTGATGTTGTCATGAGG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106606497 isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036983166.1 False 2377 mRNA 0.47 2 34726401 34728809
XR_005052572.1 False 2339 mRNA 0.47 2 34726405 34728810
XM_036983167.1 False 2259 mRNA 0.47 2 34726407 34728803
XM_036983169.1 True 1273 mRNA 0.47 2 34726944 34728697
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
rims4 rims4 coding upstream 781833 33884249 ~ 33944568 (+)
tomm34 LOC106582656 coding upstream 918922 33801778 ~ 33807479 (+)
LOC118965285 NA coding upstream 926673 33774881 ~ 33799728 (+)
si:dkey-43k4.5 LOC106582653 coding upstream 1071855 33650637 ~ 33654546 (+)
LOC110528946 LOC106582609 coding upstream 1101926 33623237 ~ 33624475 (+)
LOC118965354 NA coding downstream 1277601 36006411 ~ 36024368 (+)
LOC110527683 LOC106582660 coding downstream 1741506 36470316 ~ 36536037 (+)
LOC110527684 NA coding downstream 1782184 36510994 ~ 36517194 (+)
LOC110527686 LOC106582662 coding downstream 1845001 36573811 ~ 36582978 (+)
LOC110527688 LOC106582663 coding downstream 1939991 36668801 ~ 36679505 (+)
G600407 NA non-coding upstream 12836 34713338 ~ 34713565 (+)
G600399 NA non-coding upstream 30289 34695274 ~ 34696112 (+)
G600385 NA non-coding upstream 58025 34664828 ~ 34668376 (+)
G600345 NA non-coding upstream 85326 34586059 ~ 34641075 (+)
G600342 NA non-coding upstream 96955 34579514 ~ 34629446 (+)
G600417 NA non-coding downstream 5475 34734285 ~ 34735880 (+)
G600418 NA non-coding downstream 7549 34736359 ~ 34736776 (+)
G600419 NA non-coding downstream 9576 34738386 ~ 34738745 (+)
G600421 NA non-coding downstream 12577 34741387 ~ 34741651 (+)
G600429 NA non-coding downstream 27110 34755920 ~ 34756129 (+)
G600013 NA other upstream 759646 33966289 ~ 33966755 (+)
G599123 NA other upstream 1430873 33290526 ~ 33295528 (+)
G599004 NA other upstream 1489765 33235813 ~ 33236636 (+)
LOC110531742 LOC106594194 other upstream 2716471 32007023 ~ 32013203 (+)
G596297 NA other upstream 3644111 31081721 ~ 31082290 (+)
G600431 NA other downstream 30537 34759347 ~ 34759658 (+)
G600531 NA other downstream 242318 34971128 ~ 34971405 (+)
G602295 gli1 other downstream 2360814 37089624 ~ 37090756 (+)
G604207 NA other downstream 3770221 38499031 ~ 38499662 (+)

Expression

LOC118965286 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 3.
End of interactive chart.

LOC118965286 Expression in each Bioproject

Bar chart with 13 bars.
LOC118965286 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 25.
End of interactive chart.

Co-expression Network