LOC110527712 (LOC106593203)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110527712
gene name LOC106593203
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 38264371 ~ 38269527 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021609168.2
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>XM_021609167.2
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>TU687878
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021609167.2 False 4665 mRNA 0.43 3 38264371 38269527
TU687878 True 1016 lncRNA 0.45 1 38266849 38267864

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528948 p38a coding downstream 4049 38214031 ~ 38260322 (-)
LOC110527710 LOC106582681 coding downstream 64871 38170183 ~ 38199500 (-)
LOC110527706 LOC105030694 coding downstream 167849 38093203 ~ 38096522 (-)
LOC110527705 LOC106582679 coding downstream 184737 38063289 ~ 38079634 (-)
LOC118965380 NA coding downstream 327995 37935371 ~ 37936376 (-)
LOC110527714 LOC103464903 coding upstream 34503 38304030 ~ 38499669 (-)
LOC110527715 LOC106582687 coding upstream 262405 38531932 ~ 38659391 (-)
LOC110527716 LOC106582688 coding upstream 433710 38703237 ~ 38757485 (-)
LOC110527718 LOC106582690 coding upstream 500971 38770498 ~ 38793057 (-)
LOC110527719 LOC106582691 coding upstream 589341 38831707 ~ 38862874 (-)
G603962 NA non-coding downstream 130073 38134066 ~ 38134298 (-)
G603960 NA non-coding downstream 131568 38132561 ~ 38132803 (-)
G603956 NA non-coding downstream 133821 38130076 ~ 38130550 (-)
G603938 NA non-coding downstream 163725 38100392 ~ 38100646 (-)
G604049 NA non-coding upstream 1162 38270689 ~ 38270930 (-)
G604058 NA non-coding upstream 10963 38280490 ~ 38280791 (-)
G604484 NA non-coding upstream 314766 38584293 ~ 38639400 (-)
G604491 NA non-coding upstream 336930 38606457 ~ 38606722 (-)
G604631 NA non-coding upstream 427989 38697516 ~ 38697822 (-)
G601245 NA other downstream 2503101 35760699 ~ 35761270 (-)
G600881 NA other downstream 3209143 35001880 ~ 35055228 (-)
G600872 NA other downstream 3297585 34965447 ~ 34966786 (-)
G600721 NA other downstream 3649496 34614492 ~ 34614875 (-)
LOC110527679 LOC106565035 other downstream 4489757 33770050 ~ 33774908 (-)
G604485 NA other upstream 319628 38589155 ~ 38597519 (-)
LOC110527723 LOC106582696 other upstream 793478 39063005 ~ 39123578 (-)
G606135 NA other upstream 1569364 39838891 ~ 39841331 (-)
LOC110527741 LOC106582711 other upstream 1954028 40135298 ~ 40275270 (-)

Expression


Co-expression Network