LOC110528361 (nfasc)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110528361
gene name nfasc
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 69554159 ~ 69682851 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036983947.1
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Function


symbol description
nfasc Predicted to enable protein binding activity involved in heterotypic cell-cell adhesion. Predicted to be involved in myelination and peripheral nervous system development. Predicted to act upstream of or within several processes, including nervous system development; protein localization to juxtaparanode region of axon; and protein localization to paranode region of axon. Located in plasma membrane.

NR:

description
neurofascin-like

GO: NA

KEGG:

id description
K06757 NFASC; neurofascin

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036983951.1 False 8474 mRNA 0.47 30 69554159 69650569
XM_036983952.1 False 8468 mRNA 0.46 30 69554159 69650569
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XR_005052652.1 True 3764 mRNA 0.53 29 69567201 69650569

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110528355 LOC106583518 coding downstream 175233 69377221 ~ 69378926 (-)
csf1a csf1 coding upstream 399182 70082033 ~ 70151213 (-)
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G641783 NA non-coding downstream 50944 69502893 ~ 69503215 (-)
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Expression



Co-expression Network