LOC110528404 (LOC106583471)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110528404
gene name LOC106583471
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 71274346 ~ 71278978 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU731406
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Function

NR:

description
SUZ domain-containing protein 1-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU731406 True 2801 TUCP 0.44 4 71275083 71278780

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110528402 LOC106583472 coding downstream 34754 71237011 ~ 71239592 (-)
LOC110528399 LOC106583473 coding downstream 38502 71210241 ~ 71235844 (-)
LOC110528398 LOC106583475 coding downstream 67316 71198628 ~ 71207030 (-)
LOC110528397 NA coding downstream 76282 71196371 ~ 71198064 (-)
LOC110528396 LOC106583476 coding downstream 107303 71150302 ~ 71167043 (-)
LOC110528410 LOC106583465 coding upstream 88172 71367150 ~ 71379759 (-)
LOC110528411 LOC106583463 coding upstream 104583 71383561 ~ 71392197 (-)
LOC110528413 LOC105016853 coding upstream 119644 71398622 ~ 71402695 (-)
LOC110528412 LOC106583462 coding upstream 123994 71402972 ~ 71412268 (-)
LOC110528417 NA coding upstream 137172 71416150 ~ 71419729 (-)
G643559 LOC100136012 non-coding downstream 32079 71242032 ~ 71242267 (-)
G643557 NA non-coding downstream 33614 71240289 ~ 71240732 (-)
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G643546 NA non-coding downstream 66162 71207903 ~ 71208184 (-)
G643582 NA non-coding upstream 10589 71289567 ~ 71292139 (-)
G643648 LOC106583456 non-coding upstream 185818 71464796 ~ 71466162 (-)
G643713 NA non-coding upstream 250418 71529396 ~ 71529634 (-)
LOC110528382 LOC106583486 other downstream 392921 70877584 ~ 70881519 (-)
G643159 NA other downstream 866228 70407033 ~ 70408118 (-)
G643054 NA other downstream 1015464 70255345 ~ 70258882 (-)
G642089 NA other downstream 1213091 70057997 ~ 70061255 (-)
G643823 NA other upstream 477941 71756919 ~ 71758810 (-)
G644738 LOC106583443 other upstream 765243 72044221 ~ 72073477 (-)
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G645156 NA other upstream 1438768 72717746 ~ 72718449 (-)
gnrh2 gon2 other upstream 1928982 73207930 ~ 73210424 (-)

Expression


Co-expression Network