rab22a (rab22a)


Basic Information

Item Value
gene id rab22a
gene name rab22a
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 80025960 ~ 80046659 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU742099
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>TU742101
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Function

symbol description
rab22a Predicted to enable GTPase activity. Predicted to be involved in endocytosis and intracellular protein transport. Predicted to be active in early endosome. Orthologous to human RAB22A (RAB22A, member RAS oncogene family).

NR:

description
Ras-related protein Rab-22A

GO:

id name namespace
GO:0007264 small GTPase mediated signal transduction biological_process
GO:0015031 protein transport biological_process
GO:0005525 GTP binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

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Neighbor

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G653098 NA non-coding upstream 16548 80063207 ~ 80063577 (-)
G653119 NA non-coding upstream 52582 80099241 ~ 80184050 (-)
G653156 NA non-coding upstream 139716 80186375 ~ 80186580 (-)
G653162 NA non-coding upstream 146304 80192963 ~ 80193190 (-)
G653015 NA other downstream 88238 79943201 ~ 79943728 (-)
G652578 ncoa5 other downstream 576578 79454075 ~ 79457103 (-)
eya2 LOC106583664 other downstream 1719464 78209092 ~ 78312601 (-)
G650763 NA other downstream 1985497 78043299 ~ 78046469 (-)
G650755 cbfa2t2 other downstream 2002213 78029244 ~ 78029753 (-)
G653274 NA other upstream 299143 80345802 ~ 80347567 (-)
G653977 NA other upstream 732101 80778760 ~ 80780691 (-)
G655289 NA other upstream 1468878 81515537 ~ 81516722 (-)
G655297 NA other upstream 1489898 81536557 ~ 81537098 (-)

Expression


Co-expression Network