pparg (LOC106583866)


Basic Information

Item Value
gene id pparg
gene name LOC106583866
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048571.1
NCBI id CM023225.2
chromosome length 90918291
location 90290101 ~ 90409035 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036984368.1
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>XM_036984365.1
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Function

NR:

description
peroxisome proliferator-activated receptor gamma isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K08530 NR1C3, PPARG; peroxisome proliferator-activated receptor gamma

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036984366.1 True 4134 mRNA 0.45 9 90290481 90409035

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
iqsec1b iqsec1 coding upstream 127453 90096022 ~ 90162648 (+)
LOC110529066 LOC106583848 coding upstream 797662 89479837 ~ 89492439 (+)
ptpdc1a LOC106583842 coding upstream 815218 89398875 ~ 89474883 (+)
LOC110529064 phf2 coding upstream 1174576 88981718 ~ 89115525 (+)
LOC118965329 NA coding upstream 1234133 89053940 ~ 89055968 (+)
tsen2 tsen2 coding downstream 4684 90413719 ~ 90459450 (+)
LOC110528705 mkrn2 coding downstream 74987 90484022 ~ 90506869 (+)
LOC110528704 cnbp coding downstream 109772 90518807 ~ 90562974 (+)
zgc:77375 LOC106593459 coding downstream 187978 90597013 ~ 90627553 (+)
cfap92 LOC106583852 coding downstream 331629 90740664 ~ 90885403 (+)
G662143 NA non-coding upstream 988 90288887 ~ 90289113 (+)
G662136 NA non-coding upstream 7470 90282328 ~ 90282631 (+)
G662135 NA non-coding upstream 8178 90279102 ~ 90281923 (+)
G662131 NA non-coding upstream 16249 90273624 ~ 90273852 (+)
G662117 NA non-coding upstream 23281 90232140 ~ 90266820 (+)
G662180 NA non-coding downstream 1911 90410946 ~ 90411265 (+)
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G662215 NA non-coding downstream 45030 90454065 ~ 90454691 (+)
G662026 NA other upstream 290190 89999277 ~ 89999911 (+)
G661692 NA other upstream 818710 89467984 ~ 89471391 (+)
G661696 NA other upstream 819982 89469829 ~ 89470119 (+)
G661541 NA other upstream 1033677 89255760 ~ 89256424 (+)
G661491 NA other upstream 1108064 89180814 ~ 89182037 (+)

Expression


Co-expression Network